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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G041260
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 11162786-11165373 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2099 bp · TkA06G041260|TK1151|cDNA

GAAACATTTCCACTTATATAATGCATATGGAAAAACTCAAACCTCCCTTTTGTTCCTTTCTAGAGAACTAGACCTACTAATACACATACAGACACACTCATACACAGTTATCGCATAAACCCTAGGAACTCCAATTTAGAGAGAGAATCCGAACAGCTATGAAATACTGAATCCATCTTCATCCGACACTCCTTTTCACCTTCCTCCGTCTTTCCACGTTCTGGACACCGCTCGCCATGGATGACGCTCGTTTCGATCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1836 bp · TkA06G041260|TK1151|CDS

ATGGATGACGCTCGTTTCGATCGTTTCCCGGTCAGCTTAGACCCAACCGCACAAGAATTCCGACCAACTTACTCTTTGTCTTTACCCCCACCTCATACATACTTCCCACACCCGTACCCGTACAACGTCTACAGTTCTCCTATACCGCCACCGCCACCGCCACTGCCACTACCGCCGCCCGTTTATGTTGCACCCAAGCCACAGGCTCCGGCTCCAACACTCCCACCACCGTCAATCACCCCCACGCGTACGCTCCTACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

611 aa · TkA06G041260|TK1151|PROTEIN

MDDARFDRFPVSLDPTAQEFRPTYSLSLPPPHTYFPHPYPYNVYSSPIPPPPPPLPLPPPVYVAPKPQAPAPTLPPPSITPTRTLLLSSVPSDVSESILRRELEVFGDVRAVQMERIRDGIVTVHFYDLRQSTEALHEIQEQHMQQQYRLRKHFDALTLSNFLSAPPYEYHSNAYLSPPLPPPAVGLIVGRAVWAQFTFPVSAGLPDGYNQGTIVVFNLVPDIAAGTLREIFEAYGSVKEIRGTPSKKNQRFVEFYDTRD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G041260
TK1151 IDTkA06G041260
OH-1004 IDLXL04_025790
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.399 / OH-1004 96.399
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G041260
位置Chr06:11162786-11165373 (-)
描述Similar to TE1: Protein terminal ear1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g61960 可能的RNA结合转录激活因子，在减数分裂和营养生长中起作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2WY46 可能的RNA结合蛋白。 暂无已核实直接文献
Os01g0907900 可能的RNA结合蛋白。
PLASTOCHRON2 regulates leaf initiation and maturation in rice.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.037622
Os09g0531200 蛋白质 MEI2 样蛋白 6。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025790 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000381 regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome 生物过程
GO:0045836 positive regulation of meiotic nuclear division 生物过程
GO:0045927 positive regulation of growth 生物过程
GO:0016607 nuclear speck 细胞组分
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
dosa:Os01g0907900
dosa:Os02g0517531
zma:541683
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.741
排名 1 · TkA06G041260 · TK1151
细胞质0.256
排名 2 · TkA06G041260 · TK1151
细胞膜0.101
排名 3 · TkA06G041260 · TK1151
内质网0.048
排名 4 · TkA06G041260 · TK1151
质体0.024
排名 5 · TkA06G041260 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16842RRM_occluded83-115 aa
PF14703PHM7_cyt83-101 aa
PF00076RRM_187-142 aa
PF28976RRM_ACIN199-139 aa
PF13893RRM_5105-147 aa
PF22976RRM_10122-141 aa
PF13893RRM_5208-285 aa
PF16842RRM_occluded213-278 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G041260PF16842RRM_occluded831152.7e-0731.1
TkA06G041260PF14703PHM7_cyt831010.2512.2
TkA06G041260PF00076RRM_1871422.7e-1763.1
TkA06G041260PF28976RRM_ACIN1991390.06614.0
TkA06G041260PF13893RRM_51051473.3e-0524.3
TkA06G041260PF22976RRM_101221410.002218.8
TkA06G041260PF13893RRM_52082853.3e-0524.3
TkA06G041260PF16842RRM_occluded2132782.7e-0731.1
TkA06G041260PF00076RRM_12142782.7e-1763.1
TkA06G041260PF28976RRM_ACIN12142710.06614.0
TkA06G041260PF22976RRM_102172770.002218.8
TkA06G041260PF14703PHM7_cyt2462650.2512.2
TkA06G041260PF29396F07F6_N2482860.1512.5
TkA06G041260PF04059RRM_24144393.1e-34117.8
TkA06G041260PF14703PHM7_cyt4154370.2512.2
TkA06G041260PF00076RRM_14174342.7e-1763.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W4I9拟南芥sp|Q8W4I9|AML1_ARATH Protein MEI2-like 143.600%Swiss-Prot低置信
A2WY46水稻sp|A2WY46|EAR1_ORYSI Protein terminal ear1 homolog41.700%Swiss-Prot中等置信
Q0JGS5水稻sp|Q0JGS5|EAR1_ORYSJ Protein terminal ear1 homolog41.400%Swiss-Prot中等置信
Q652K6水稻sp|Q652K6|OML6_ORYSJ Protein MEI2-like 642.200%Swiss-Prot低置信

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