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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G041020
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 11091347-11092465 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1053 bp · TkA06G041020|TK1151|cDNA

ATGTTGAGGGAAGACGACAAATCACAGCCGCCGCCTCTACCTGCAGCTACCGGAGGAGGAAAAATATACTCCAGGTCAGTTTCCTGGGCCGGCAAGGCAAGGGCATGTCTGCCGCCGTTACAGCCTCTCTCGGTTTCTCGGCCGAAGGCCGAGGAGTGGCCAAGGGCGGGCTCCGACGATCTCGGAGTTTGGCCGAATGTCACCGCTACTACTCCCGGCGCTAGACCTAGACCTCCTTCTCTACCTCAGTGTTCTCGAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1053 bp · TkA06G041020|TK1151|CDS

ATGTTGAGGGAAGACGACAAATCACAGCCGCCGCCTCTACCTGCAGCTACCGGAGGAGGAAAAATATACTCCAGGTCAGTTTCCTGGGCCGGCAAGGCAAGGGCATGTCTGCCGCCGTTACAGCCTCTCTCGGTTTCTCGGCCGAAGGCCGAGGAGTGGCCAAGGGCGGGCTCCGACGATCTCGGAGTTTGGCCGAATGTCACCGCTACTACTCCCGGCGCTAGACCTAGACCTCCTTCTCTACCTCAGTGTTCTCGAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

350 aa · TkA06G041020|TK1151|PROTEIN

MLREDDKSQPPPLPAATGGGKIYSRSVSWAGKARACLPPLQPLSVSRPKAEEWPRAGSDDLGVWPNVTATTPGARPRPPSLPQCSRIIDHVFLGSDAVAKNRDVLRQNGITHVLNCVGFVCPEYFNTDLVYKTLWLQDSPSEDITSILYDVFDYFEDVREQNGRVFVHCCQGVSRSTSLVIAYLMWREGHSFEDAFQQVKAARGVTNPNMGFASQLLQCQKRVHAVPVSPSSVLRMYRIAPHSSYAPLHLVPKLLHKPSE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G041020
TK1151 IDTkA06G041020
OH-1004 IDLXL04_025801
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 52.991
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G041020
位置Chr06:11091347-11092465 (-)
描述Similar to MKP1: Protein-tyrosine-phosphatase MKP1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g55270 蛋白酪氨酸磷酸酶，通过去磷酸化并抑制 MPK6 和 MPK3，作为 MPK6 和 MPK3 信号的负调控因子。
Mitogen-activated protein kinase phosphatase is required for genotoxic stress relief in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1101/gad.192601
Distinct regulation of salinity and genotoxic stress responses by Arabidopsis MAP kinase phosphatase 1.2002 · DOI: 10.1093/emboj/cdf646
The role of NADPH oxidase and MAP kinase phosphatase in UV-B-dependent gene expression in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2006.01555.x
MAP kinase phosphatase1 and protein tyrosine phosphatase1 are repressors of salicylic acid synthesis and SNC1-mediated responses in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.067678
Arabidopsis MAP Kinase Phosphatase 1 (AtMKP1) negatively regulates MPK6-mediated PAMP responses and resistance against bacteria.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04588.x
Arabidopsis MAP kinase phosphatase 1 is phosphorylated and activated by its substrate AtMPK6.2011 · DOI: 10.1007/s00299-011-1064-4
Arabidopsis MAP kinase phosphatase 1 and its target MAP kinases 3 and 6 antagonistically determine UV-B stress tolerance, independent of the UVR8 photoreceptor pathway.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04725.x
At3g06110 对含 Ser/Thr 和 Tyr 的蛋白质具有双重特异性。
Arabidopsis MAPK phosphatase 2 (MKP2) positively regulates oxidative stress tolerance and inactivates the MPK3 and MPK6 MAPKs.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m701888200
MAPK phosphatase MKP2 mediates disease responses in Arabidopsis and functionally interacts with MPK3 and MPK6.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04297.x
Regulation of MAPK signaling and cell death by MAPK phosphatase MKP2.2010 · DOI: 10.4161/psb.5.11.13645

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025801 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006470 protein dephosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
GO:0010224 response to UV-B 生物过程
GO:0010225 response to UV-C 生物过程
GO:0016311 dephosphorylation 生物过程
GO:0034051 negative regulation of plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0034599 cellular response to oxidative stress 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0070373 negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G06110
ath:AT3G55270
gga:395642
hsa:1846
rno:60587
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.637
排名 1 · TkA06G041020 · TK1151
细胞核0.313
排名 2 · TkA06G041020 · TK1151
细胞膜0.121
排名 3 · TkA06G041020 · TK1151
高尔基体0.075
排名 4 · TkA06G041020 · TK1151
线粒体0.074
排名 5 · TkA06G041020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00782DSPc91-221 aa
PF22785Tc-R-P95-187 aa
PF00102Y_phosphatase135-191 aa
PF22741PTP-NADK158-198 aa
PF00626Gelsolin259-323 aa
PF25480DUF7904275-327 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G041020PF00782DSPc912215.5e-2898.1
TkA06G041020PF22785Tc-R-P951870.0001822.7
TkA06G041020PF00102Y_phosphatase1351910.0005520.3
TkA06G041020PF22741PTP-NADK1581980.0116.0
TkA06G041020PF00626Gelsolin2593230.002718.2
TkA06G041020PF25480DUF79042753270.0006720.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C5S1拟南芥sp|Q9C5S1|MKP1_ARATH Protein-tyrosine-phosphatase MKP158.200%Swiss-Prot高置信
Q9M8K7拟南芥sp|Q9M8K7|DUS1B_ARATH Dual specificity protein phosphatase 1B37.400%Swiss-Prot低置信

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