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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G040460
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 10929077-10933527 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2752 bp · TkA06G040460|TK1151|cDNA

AAAGGCACGTGATCTGCCAAGATTTTACCTGCAAGAAAAAAAGCTTTTCTTTTTAAAAAAACTTGCTTTTTTGGACATCTCATTGTTCTCTCTCACACACACAGACACAGACATCCATCCTTCAGTCCAATCACTGAATAAAAAGCAAATGTCTTTGTTTTCCCCCGAAAAAATCCAAACAATTATTTGATTCTTTTGATAAAATATTTCGTAAAATACCAATTCAATTATTTAAATTCCCTTTGTACTGGTGAACAACC...

CDS

下载 CDS FASTA

1893 bp · TkA06G040460|TK1151|CDS

ATGGAGAAGAGATTATGTGTTTTTGAGATATTGCGGTTTGGGGTTTTATGTCTTGTAACATGGCTGAGTGTCGCATATGCAACTCTTTCTCCTTCTGGTGTCAATTATGAAGTTGTAGCTTTAATGGCGATAAAAGGCGATCTAAAGGACCCACGCAATATAATGGACAATTGGGATTTATCTTCTGTGGATCCTTGTAGTTGGCGGATGGTTACTTGTAATTCCGATCGCTCTGTTTCAGCTTTAGGGCTACCTAGTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

630 aa · TkA06G040460|TK1151|PROTEIN

MEKRLCVFEILRFGVLCLVTWLSVAYATLSPSGVNYEVVALMAIKGDLKDPRNIMDNWDLSSVDPCSWRMVTCNSDRSVSALGLPSQNLSGTLSSAIGNLSNLQSVTLQNNAIIGPISDAIGKLQKLQTLDLSGNLFSGQLPSSLGDLKNLNFLRLNNNSLSGPVPESLSQVEGLTLVDVSYNNLTGPLPKLSARTFKITGNPLLCGQNSVNNCSNIYPEPLSFPPDDFTDQPSTNDKTHHLAIALGTSLSGIFVIILIV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G040460
TK1151 IDTkA06G040460
OH-1004 IDLXL04_025834
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G040460
位置Chr06:10929077-10933527 (+)
描述Similar to NIK3: Protein NSP-INTERACTING KINASE 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g60800 受体激酶，与其他CIK（如CIK1、CIK2、CIK3、CIK5和CIK6）冗余作用，作为CLV1、CLV2/CRN和RPK2的共受体，并需要通过磷酸化介导CLAVATA家族肽（如CLV3）信号；该信号调控原韧皮部分化以及维持芽顶分生组织（SAM）和根顶分生组织（RAM）稳态，并在BRX和OPS下游发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g16000 可能作为受体激酶，参与分生组织稳态及原韧皮部分化的调控。
Regulated nuclear trafficking of rpL10A mediated by NIK1 represents a defense strategy of plant cells against virus.2008 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1000247
NIK1-mediated translation suppression functions as a plant antiviral immunity mechanism.2015 · DOI: 10.1038/nature14171
CLERK is a novel receptor kinase required for sensing of root-active CLE peptides in Arabidopsis .2018 · DOI: 10.1242/dev.162354
At3g25560 受体激酶，与其他CIK（如CIK1、CIK2、CIK3、CIK5和CIK6）冗余作用，作为CLV1、CLV2/CRN和RPK2的共受体，并且需要通过磷酸化介导CLAVATA家族肽（如CLV3、CLE25、CLE26和CLE45）信号；该信号调控原韧皮部分化及维持茎尖分生组织（SAM）和根尖分生组织（RAM）的稳态，并作用于BRX和OPS下游。 暂无已核实直接文献
At2g23950 可能作为受体激酶，参与分生组织稳态及原韧皮部分化的调控。
CLERK is a novel receptor kinase required for sensing of root-active CLE peptides in Arabidopsis .2018 · DOI: 10.1242/dev.162354
A CLE-BAM-CIK signalling module controls root protophloem differentiation in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1111/nph.17791

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0274500 可能参与防御反应的 LRR 受体激酶。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8BB68 参与防御反应的 LRR 受体激酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025834 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0007639 homeostasis of number of meristem cells 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010088 phloem development 生物过程
GO:0034504 protein localization to nucleus 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0040015 negative regulation of multicellular organism growth 生物过程
GO:0048638 regulation of developmental growth 生物过程
GO:0048653 anther development 生物过程
GO:0051607 defense response to virus 生物过程
GO:0140374 antiviral innate immune response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G60800
ath:AT2G23950
ath:AT3G25560
ath:AT5G16000
dosa:Os06g0274500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.882
排名 1 · TkA06G040460 · TK1151
内质网0.075
排名 2 · TkA06G040460 · TK1151
细胞质0.071
排名 3 · TkA06G040460 · TK1151
细胞核0.043
排名 4 · TkA06G040460 · TK1151
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · TkA06G040460 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_235-74 aa
PF29252LRR_NLRC477-112 aa
PF13855LRR_878-136 aa
PF00560LRR_186-100 aa
PF25013LRR_Zer-188-134 aa
PF29252LRR_NLRC489-160 aa
PF12799LRR_492-118 aa
PF23598LRR_1494-181 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G040460PF08263LRRNT_235741.2e-1145.4
TkA06G040460PF29252LRR_NLRC4771120.311.0
TkA06G040460PF13855LRR_8781361.6e-0834.9
TkA06G040460PF00560LRR_1861005.4e-0935.1
TkA06G040460PF25013LRR_Zer-1881340.2412.2
TkA06G040460PF29252LRR_NLRC4891600.311.0
TkA06G040460PF12799LRR_4921182.5e-0525.1
TkA06G040460PF23598LRR_14941811e-0938.3
TkA06G040460PF00560LRR_11021245.4e-0935.1
TkA06G040460PF12799LRR_41021352.5e-0525.1
TkA06G040460PF23211LRR_LRWD11041630.0009319.7
TkA06G040460PF12799LRR_41251612.5e-0525.1
TkA06G040460PF00560LRR_11261485.4e-0935.1
TkA06G040460PF13855LRR_81431851.6e-0834.9
TkA06G040460PF12799LRR_41491922.5e-0525.1
TkA06G040460PF00560LRR_11501715.4e-0935.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93ZS4拟南芥sp|Q93ZS4|CIK1_ARATH Protein CLAVATA3 INSENSITIVE RECEPTOR KINASE 173.700%Swiss-Prot高置信
Q9LFS4拟南芥sp|Q9LFS4|CIK5_ARATH Protein CLAVATA3 INSENSITIVE RECEPTOR KINASE 566.300%Swiss-Prot高置信
Q8RY65拟南芥sp|Q8RY65|CIK6_ARATH Protein CLAVATA3 INSENSITIVE RECEPTOR KINASE 666.600%Swiss-Prot高置信
Q0WVM4拟南芥sp|Q0WVM4|CIK2_ARATH Protein CLAVATA3 INSENSITIVE RECEPTOR KINASE 262.100%Swiss-Prot高置信
Q9FP13水稻sp|Q9FP13|SERL2_ORYSJ LRR receptor kinase SERL263.300%Swiss-Prot高置信
B8BB68水稻sp|B8BB68|BAK1_ORYSI LRR receptor kinase BAK165.300%Swiss-Prot高置信

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