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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G037540
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 10061481-10062731 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1113 bp · TkA06G037540|TK1151|cDNA

ATGTCCACTTGTGCCTCCTTCTACGGTATCACTCTCAGTTCTTCATCTTCAACCTTCAATCGAAAAAAACACACTCTCGTAACCGCTTCAACTCCCACAGCTCTCGAATCACCTCCCAAATCTTCATTTCGCGACAAATCCCCCAAAGATATCAATGTTTTAGTCGTGGGTTCGACTGGTTACATCGGGAATTTTGTCGTGAAGGAATTGGTGAATAGAGGGTTCAATGTGATTGCGGTTTGTAGAGAAAAGAGTGGAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1113 bp · TkA06G037540|TK1151|CDS

ATGTCCACTTGTGCCTCCTTCTACGGTATCACTCTCAGTTCTTCATCTTCAACCTTCAATCGAAAAAAACACACTCTCGTAACCGCTTCAACTCCCACAGCTCTCGAATCACCTCCCAAATCTTCATTTCGCGACAAATCCCCCAAAGATATCAATGTTTTAGTCGTGGGTTCGACTGGTTACATCGGGAATTTTGTCGTGAAGGAATTGGTGAATAGAGGGTTCAATGTGATTGCGGTTTGTAGAGAAAAGAGTGGAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

370 aa · TkA06G037540|TK1151|PROTEIN

MSTCASFYGITLSSSSSTFNRKKHTLVTASTPTALESPPKSSFRDKSPKDINVLVVGSTGYIGNFVVKELVNRGFNVIAVCREKSGIKANVCFSDVTELDILQQSLQKLGVSIDVVVSCLASRSGGVKDSWKIDYEATKNSLLAGRTFGAKHFVLLSAICVQKPLLEFQRAKLKFESELIKAAEDDDEFSYSIVRPTAFFKSLGGQVELVKDGKPYVMFGDGKLCACKPISESDLATFIADCVLKPDKINQILPIGGPGK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G037540
TK1151 IDTkA06G037540
OH-1004 IDLXL04_033906
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)31.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 29.459 / OH-1004 39.394
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G037540
位置Chr06:10061481-10062731 (+)
描述Similar to At2g34460: Uncharacterized protein At2g34460, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g18660 催化二乙烯基叶绿酸（divinyl chlorophyllide）转化为单乙烯基叶绿酸（monovinyl chlorophyllide）。
Identification of a vinyl reductase gene for chlorophyll synthesis in Arabidopsis thaliana and implications for the evolution of Prochlorococcus species.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.027276
Characterization of the Arabidopsis thaliana mutant pcb2 which accumulates divinyl chlorophylls.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci053

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: D5L1S4 催化二乙烯基叶绿酸（divinyl chlorophyllide）转化为单乙烯基叶绿酸（monovinyl chlorophyllide）。 暂无已核实直接文献
Os03g0351200 催化二乙烯基叶绿酸（divinyl chlorophyllide）转化为单乙烯基叶绿酸（monovinyl chlorophyllide）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033906 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009534 chloroplast thylakoid 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009579 thylakoid 细胞组分
GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0010287 plastoglobule 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G34460
ath:AT2G37660
ath:AT3G18890
dosa:Os10g0100300
osa:4347935
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.984
排名 1 · TkA06G037540 · TK1151
线粒体0.027
排名 2 · TkA06G037540 · TK1151
细胞质0.017
排名 3 · TkA06G037540 · TK1151
过氧化物酶体0.013
排名 4 · TkA06G037540 · TK1151
细胞核0.012
排名 5 · TkA06G037540 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01488Shikimate_DH49-124 aa
PF05368NmrA52-328 aa
PF04321RmlD_sub_bind52-119 aa
PF01118Semialdhyde_dh52-122 aa
PF01370Epimerase53-161 aa
PF00106adh_short53-88 aa
PF08659KR53-116 aa
PF16363GDP_Man_Dehyd54-88 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G037540PF01488Shikimate_DH491240.07613.8
TkA06G037540PF05368NmrA523281.9e-1248.1
TkA06G037540PF04321RmlD_sub_bind521190.211.4
TkA06G037540PF01118Semialdhyde_dh521220.2212.7
TkA06G037540PF01370Epimerase531618.9e-1039.1
TkA06G037540PF00106adh_short53880.04613.9
TkA06G037540PF08659KR531160.06313.9
TkA06G037540PF16363GDP_Man_Dehyd54880.00616.8
TkA06G037540PF010733Beta_HSD541610.01814.8
TkA06G037540PF07993NAD_binding_4561040.008116.1
TkA06G037540PF13460NAD_binding_10572463.9e-1660.2
TkA06G037540PF07993NAD_binding_4981630.008116.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q1H537拟南芥sp|Q1H537|DCVR_ARATH Divinyl chlorophyllide a 8-vinyl-reductase, chloroplastic77.700%Swiss-Prot高置信
D5L1S4水稻sp|D5L1S4|DCVR_ORYSI Divinyl chlorophyllide a 8-vinyl-reductase, chloroplastic64.200%Swiss-Prot高置信
Q10LH0水稻sp|Q10LH0|DCVR_ORYSJ Divinyl chlorophyllide a 8-vinyl-reductase, chloroplastic64.200%Swiss-Prot高置信

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