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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G036350
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 9751331-9752888 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1239 bp · TkA06G036350|TK1151|cDNA

AACAAAGACTTTCCAACTTCAAAACCTCTATAAGAACGTGGCACACTTGTTAGCTTCACCTTCAATCGGTTGAATAATTCTTCATACATCAACAATGGTGGCTACAACTACATCATTTTCCTTAGACCTCAATCTTTTCCCCTTCCACAAAATCGATGACATCCCCATTACGGAAGTCGTTCATTCTGATGACGATGAACATGGAGAAGAAGAAGACGACGTTGATCATGGGGATTTAAGCAGAATAAGCAACGAAAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

780 bp · TkA06G036350|TK1151|CDS

ATGGTGGCTACAACTACATCATTTTCCTTAGACCTCAATCTTTTCCCCTTCCACAAAATCGATGACATCCCCATTACGGAAGTCGTTCATTCTGATGACGATGAACATGGAGAAGAAGAAGACGACGTTGATCATGGGGATTTAAGCAGAATAAGCAACGAAAACAAGAAGCTAAAGGAGATGCTTAAGACCATATGCGAAAACTACAACTCCCTTCAGACGCATGTTAAGAGCTTAATGCAAGATAAGTTAATCTTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

259 aa · TkA06G036350|TK1151|PROTEIN

MVATTTSFSLDLNLFPFHKIDDIPITEVVHSDDDEHGEEEDDVDHGDLSRISNENKKLKEMLKTICENYNSLQTHVKSLMQDKLIFESNPKKRKLDETVQQSSWKMPHLESPKTGVRRVYVPTDPSDKSLIVKDGYQWRKYGQKVTRDNPSPRAYYKCSSSPTCPVKKKVQRSVDDAGVLVATYEGEHNHKSTKEEAAYALANERKNSRSERRSNSPIGVTKFDELLVEKMATFLGKDPDFTAELAAAISSKILEVDLF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G036350
TK1151 IDTkA06G036350
OH-1004 IDLXL04_025925
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.614 / OH-1004 99.614
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G036350
位置Chr06:9751331-9752888 (-)
描述Similar to WRKY40: Probable WRKY transcription factor 40
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g80840 转录因子（通过同源性推测）。 暂无已核实直接文献
At4g31800 转录因子。
Potentiation of developmentally regulated plant defense response by AtWRKY18, a pathogen-induced Arabidopsis transcription factor.2002 · DOI: 10.1104/pp.001057
At2g25000 转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q6IEK5 转录抑制因子。 暂无已核实直接文献
Os09g0417600 转录抑制因子。
OsWRKY IIa Transcription Factors Modulate Rice Innate Immunity.2010 · DOI: 10.1007/s12284-010-9039-6
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025925 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:1905034 regulation of antifungal innate immune response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G80840
ath:AT2G25000
ath:AT4G31800
dosa:Os06g0649000
osa:4341678
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.962
排名 1 · TkA06G036350 · TK1151
细胞质0.105
排名 2 · TkA06G036350 · TK1151
细胞膜0.024
排名 3 · TkA06G036350 · TK1151
内质网0.012
排名 4 · TkA06G036350 · TK1151
线粒体0.011
排名 5 · TkA06G036350 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24525TTC344-76 aa
PF13851GAS44-107 aa
PF07902Gp5845-81 aa
PF18504Csm1_N49-83 aa
PF29308YEL043W_helical51-109 aa
PF09177STX6_10_61_N53-98 aa
PF15157IQCJ-SCHIP167-114 aa
PF04500FLYWCH128-190 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G036350PF24525TTC344760.002118.3
TkA06G036350PF13851GAS441070.01515.4
TkA06G036350PF07902Gp5845810.2110.6
TkA06G036350PF18504Csm1_N49830.212.7
TkA06G036350PF29308YEL043W_helical511090.09213.6
TkA06G036350PF09177STX6_10_61_N53980.03715.3
TkA06G036350PF15157IQCJ-SCHIP1671140.4711.5
TkA06G036350PF04500FLYWCH1281900.1313.2
TkA06G036350PF03106WRKY1331911.5e-2486.7
TkA06G036350PF15157IQCJ-SCHIP11371740.4711.5
TkA06G036350PF09177STX6_10_61_N1652040.03715.3
TkA06G036350PF18504Csm1_N1671830.212.7
TkA06G036350PF13851GAS1912090.01515.4
TkA06G036350PF07902Gp581982310.2110.6
TkA06G036350PF15157IQCJ-SCHIP12072200.4711.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SAH7拟南芥sp|Q9SAH7|WRK40_ARATH Probable WRKY transcription factor 4042.300%Swiss-Prot中等置信
Q9C5T4拟南芥sp|Q9C5T4|WRK18_ARATH WRKY transcription factor 1841.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SK33拟南芥sp|Q9SK33|WRK60_ARATH Probable WRKY transcription factor 6043.800%Swiss-Prot中等置信
Q6IEK5水稻sp|Q6IEK5|WRK76_ORYSI WRKY transcription factor WRKY7646.100%Swiss-Prot中等置信
Q6EPZ2水稻sp|Q6EPZ2|WRK76_ORYSJ WRKY transcription factor WRKY7646.100%Swiss-Prot中等置信

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