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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G033620
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 9089550-9090399 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

378 bp · TkA06G033620|TK1151|cDNA

ATGGGTGGAAAATTATTAGAAGTCGATGGATCATCAATCAAGTTCATATGTGAAATCAAGAAACAAAGTACCTCTTCAGTTCACCTCTCCAACAAATCTGATGAGTATGTTGCTTTTAAGGTAAAGACTACATCACCAAAAAGATTTTGTGTAAGACCTAATTCGGGCATCATTAGCCCAAAGTCAGAATGCAGTTTCACAGTTACTATGCAAGGTCTAAGATCAGCTCCATCTGAAGTGGAATGCAAGGATAAATTCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

378 bp · TkA06G033620|TK1151|CDS

ATGGGTGGAAAATTATTAGAAGTCGATGGATCATCAATCAAGTTCATATGTGAAATCAAGAAACAAAGTACCTCTTCAGTTCACCTCTCCAACAAATCTGATGAGTATGTTGCTTTTAAGGTAAAGACTACATCACCAAAAAGATTTTGTGTAAGACCTAATTCGGGCATCATTAGCCCAAAGTCAGAATGCAGTTTCACAGTTACTATGCAAGGTCTAAGATCAGCTCCATCTGAAGTGGAATGCAAGGATAAATTCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

125 aa · TkA06G033620|TK1151|PROTEIN

MGGKLLEVDGSSIKFICEIKKQSTSSVHLSNKSDEYVAFKVKTTSPKRFCVRPNSGIISPKSECSFTVTMQGLRSAPSEVECKDKFLIQSTVVDSGTKEEDITLDFGKYCIVSLLISETFIAICC

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G033620
TK1151 IDTkA06G033620
OH-1004 IDLXL04_025887
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)94.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 87.200 / OH-1004 21.308
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G033620
位置Chr06:9089550-9090399 (-)
描述Similar to PVA22: Vesicle-associated protein 2-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g08820 可能在囊泡运输中起作用。 暂无已核实直接文献
At2g45140 囊泡相关蛋白，与氧甾醇结合蛋白 ORP3A 结合并允许其靶向 ER。
The targeting of the oxysterol-binding protein ORP3a to the endoplasmic reticulum relies on the plant VAP33 homolog PVA12.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03815.x
At3g60600 是膜-细胞骨架适配器复合物的一部分，该复合物在内质网和质膜之间形成桥梁。 暂无已核实直接文献
At4g00170 可能在囊泡运输中起作用。 暂无已核实直接文献
At5g47180 可能在囊泡运输中起作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025887 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006605 protein targeting 生物过程
GO:0061817 endoplasmic reticulum-plasma membrane tethering 生物过程
GO:0090158 endoplasmic reticulum membrane organization 生物过程
GO:0000326 protein storage vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005776 autophagosome 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0032586 protein storage vacuole membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08820
ath:AT2G45140
ath:AT3G60600
ath:AT4G00170
ath:AT5G47180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.545
排名 1 · TkA06G033620 · TK1151
细胞核0.293
排名 2 · TkA06G033620 · TK1151
内质网0.144
排名 3 · TkA06G033620 · TK1151
细胞膜0.129
排名 4 · TkA06G033620 · TK1151
线粒体0.077
排名 5 · TkA06G033620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17545DUF54617-41 aa
PF22076Cep192_D611-88 aa
PF00635Motile_Sperm12-101 aa
PF22067Cep192_D312-73 aa
PF22544HYDIN_VesB_CFA65-like_Ig16-71 aa
PF24798Ig-CFAP74_4th16-74 aa
PF24507Ig_CFAP65_4th18-71 aa
PF16392DUF500118-71 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G033620PF17545DUF54617410.1213.5
TkA06G033620PF22076Cep192_D611883.1e-0628.0
TkA06G033620PF00635Motile_Sperm121019e-2897.0
TkA06G033620PF22067Cep192_D312732.1e-0525.3
TkA06G033620PF22544HYDIN_VesB_CFA65-like_Ig16710.0002521.9
TkA06G033620PF24798Ig-CFAP74_4th16740.06814.1
TkA06G033620PF24507Ig_CFAP65_4th18710.0001922.4
TkA06G033620PF16392DUF500118710.004317.7
TkA06G033620PF15780ASH18700.009116.9
TkA06G033620PF17545DUF546176970.1213.5
TkA06G033620PF24798Ig-CFAP74_4th1031110.06814.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
B9DHD7拟南芥sp|B9DHD7|VAP22_ARATH Vesicle-associated protein 2-252.400%Swiss-Prot高置信
Q9SHC8拟南芥sp|Q9SHC8|VAP12_ARATH Vesicle-associated protein 1-248.500%Swiss-Prot中等置信
Q8VZ95拟南芥sp|Q8VZ95|VAP11_ARATH Vesicle-associated protein 1-148.000%Swiss-Prot中等置信
Q84WW5拟南芥sp|Q84WW5|VAP13_ARATH Vesicle-associated protein 1-346.300%Swiss-Prot中等置信
Q9LVU1拟南芥sp|Q9LVU1|VAP21_ARATH Vesicle-associated protein 2-144.500%Swiss-Prot中等置信

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