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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G028170
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 7634488-7637553 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1336 bp · TkA06G028170|TK1151|cDNA

ACCATGTCAGCCACCATCTACTTATATAAATATGTGATATTGTCTCTTTTAACATCTCAAAAAACAAACGACATTTCATTAACTCCACGGAAAAAACATGAAAATGTCCAAGAGTAAGATTTTGGTTGTGGGTGGTACAGGGTACATTGGCAAGAGGATTGTAAAGGCTAGTTTGGCTCAAGGCCATCCGACTTTTGTCCTTATGCGTCCAGATATCGGTTACGAAGTTGAAAAGCTTCAGAAATTATTATCATTTAAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

945 bp · TkA06G028170|TK1151|CDS

ATGAAAATGTCCAAGAGTAAGATTTTGGTTGTGGGTGGTACAGGGTACATTGGCAAGAGGATTGTAAAGGCTAGTTTGGCTCAAGGCCATCCGACTTTTGTCCTTATGCGTCCAGATATCGGTTACGAAGTTGAAAAGCTTCAGAAATTATTATCATTTAAGGAAAAAGGAGCTCAACTGATTAAAGGTTCATTTTCTGATCATCAATCTCTCGTGGATGCCGTCAAACAAGTTGATGTTGTGATATGCACCATATCGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

314 aa · TkA06G028170|TK1151|PROTEIN

MKMSKSKILVVGGTGYIGKRIVKASLAQGHPTFVLMRPDIGYEVEKLQKLLSFKEKGAQLIKGSFSDHQSLVDAVKQVDVVICTISGVQLRSHNILLQLKLVDAIKEAGNIKRFLPSEFGIDPSRMEHALEYGKESFTDKMVVRKAIEDAKIPYTYISANCFGGYFVGNLSQLYTLVPPKDQVCIYGDGNRKVVFMDEDDVATYTIKTVDDPRSLNKTLYLRPHENILTHIQLVEKWEKLSGKPLQKVYISAQDFFASMK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G028170
TK1151 IDTkA06G028170
OH-1004 IDLXL04_026094
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)89.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.363 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G028170
位置Chr06:7634488-7637553 (-)
描述Similar to Isoflavone reductase homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026094 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009807 lignan biosynthetic process 生物过程
GO:0019336 phenol-containing compound catabolic process 生物过程
GO:0034312 diol biosynthetic process 生物过程
GO:0042537 benzene-containing compound metabolic process 生物过程
GO:0046189 phenol-containing compound biosynthetic process 生物过程
GO:0046273 lignan catabolic process 生物过程
GO:1901502 ether catabolic process 生物过程
GO:1902123 (-)-pinoresinol catabolic process 生物过程
GO:1902125 (+)-pinoresinol catabolic process 生物过程
GO:1902128 (-)-lariciresinol catabolic process 生物过程
GO:1902129 (-)-lariciresinol biosynthetic process 生物过程
GO:1902132 (+)-lariciresinol biosynthetic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ag:ABM68630
ath:AT1G32100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.610
排名 1 · TkA06G028170 · TK1151
内质网0.153
排名 2 · TkA06G028170 · TK1151
细胞核0.152
排名 3 · TkA06G028170 · TK1151
细胞膜0.083
排名 4 · TkA06G028170 · TK1151
溶酶体／液泡0.077
排名 5 · TkA06G028170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13241NAD_binding_72-88 aa
PF05368NmrA5-310 aa
PF01262AlaDh_PNT_C5-106 aa
PF01118Semialdhyde_dh7-83 aa
PF01370Epimerase8-115 aa
PF08659KR8-88 aa
PF02719Polysacc_synt_28-82 aa
PF00106adh_short8-79 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G028170PF13241NAD_binding_72880.1613.2
TkA06G028170PF05368NmrA53101.3e-67229.2
TkA06G028170PF01262AlaDh_PNT_C51060.04214.0
TkA06G028170PF01118Semialdhyde_dh7830.1313.4
TkA06G028170PF01370Epimerase81151.4e-1041.7
TkA06G028170PF08659KR8880.00318.2
TkA06G028170PF02719Polysacc_synt_28820.02614.4
TkA06G028170PF00106adh_short8790.05113.8
TkA06G028170PF010733Beta_HSD9924.4e-0626.6
TkA06G028170PF16363GDP_Man_Dehyd9802.3e-0524.7
TkA06G028170PF02254TrkA_N10870.1113.5
TkA06G028170PF13460NAD_binding_10121593.1e-1454.0
TkA06G028170PF22660RS_preATP-grasp-like13970.008517.2
TkA06G028170PF08942DUF19191441750.2211.7
TkA06G028170PF01370Epimerase1812141.4e-1041.7
TkA06G028170PF22660RS_preATP-grasp-like1882170.008517.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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