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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G027990
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 7565561-7570692 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2040 bp · TkA06G027990|TK1151|cDNA

TCTCACTTGAAAACACGATTTCACACTTCCTTCGCTTTCTCTCTCATCCCATCGTCTCTGGAACAAACGAGAAGCGCAGCCTAAGAACGACGGGGAACGCTAAACAGCACCGCCATTTTGCTCGGGGATTCCTCCACTAATCGCCGGTAGCAGATGTCTGTTTAGTTATCTGTGAATTAGGGAGACTCCAGCTTCATTCTTCTAAAAAAACTGGTGGAGAGTGCAGGAGACAACAATGAGTGCTTTGTTGTCAAATGATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1464 bp · TkA06G027990|TK1151|CDS

ATGAGTGCTTTGTTGTCAAATGATCCTATGCATTTTGGAAGTTATGAAGGTGGTCCTTACAGGAATTCAGATGATAATGCAGAAGAAAATGGAGGTAGGTGGTATTTTTCACGTAAAGAAATAGAGGAAAACTCTCCATCAAGACCAGATGGCATTGATTTGAAGAAGGAGACTTATTTGCGTAAAGCATATTGCACATTTTTGCAAGACTTGGGTATGCGGCTTAAAGTGCCCCAGGTAACAATTGCTACAGCTATAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

487 aa · TkA06G027990|TK1151|PROTEIN

MSALLSNDPMHFGSYEGGPYRNSDDNAEENGGRWYFSRKEIEENSPSRPDGIDLKKETYLRKAYCTFLQDLGMRLKVPQVTIATAIIFCHRFFLRQSHAKNDRRTVATVCMFLAGKVEETPRPLKDVILVSYEINNKKDPEAIQRIKQKEVYEQQKELILLGERVVLATLGFDFNVHHPYKPLVEAIKKFKVAQNALAQVAWNFVNDGLRTSLCLQFKPHHIAAGAIFLAAKFLKVKLPSDGEKVWWQEFDVTPRQLEEV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G027990
TK1151 IDTkA06G027990
OH-1004 IDLXL04_026090
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.893 / OH-1004 95.910
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G027990
位置Chr06:7565561-7570692 (+)
描述Similar to CYCT1-3: Cyclin-T1-3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g45190 细胞周期蛋白T1-5。 暂无已核实直接文献
At4g19600 细胞周期蛋白T1-4。 暂无已核实直接文献
At4g19560 细胞周期蛋白T1-2。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os11g0157100 细胞周期蛋白T1-3。 暂无已核实直接文献
Os12g0485400 细胞周期蛋白T1-4。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026090 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010090 trichome morphogenesis 生物过程
GO:0032786 positive regulation of DNA-templated transcription, elongation 生物过程
GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0050792 regulation of viral process 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0008024 cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex 细胞组分
GO:0061575 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G19600
ath:AT5G45190
dosa:Os11g0157100
dosa:Os12g0485400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.958
排名 1 · TkA06G027990 · TK1151
细胞质0.101
排名 2 · TkA06G027990 · TK1151
细胞膜0.025
排名 3 · TkA06G027990 · TK1151
线粒体0.012
排名 4 · TkA06G027990 · TK1151
内质网0.011
排名 5 · TkA06G027990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14303NAM-associated23-63 aa
PF00134Cyclin_N40-174 aa
PF00382TFIIB65-130 aa
PF02984Cyclin_C81-100 aa
PF21797CycT2-like_C101-116 aa
PF14303NAM-associated138-159 aa
PF21797CycT2-like_C178-265 aa
PF16899Cyclin_C_2178-235 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G027990PF14303NAM-associated23630.006818.0
TkA06G027990PF00134Cyclin_N401744.4e-2382.1
TkA06G027990PF00382TFIIB651300.03814.7
TkA06G027990PF02984Cyclin_C811000.0001222.8
TkA06G027990PF21797CycT2-like_C1011161.6e-0834.9
TkA06G027990PF14303NAM-associated1381590.006818.0
TkA06G027990PF21797CycT2-like_C1782651.6e-0834.9
TkA06G027990PF16899Cyclin_C_21782350.0913.9
TkA06G027990PF00134Cyclin_N1832664.4e-2382.1
TkA06G027990PF02984Cyclin_C1962730.0001222.8
TkA06G027990PF00382TFIIB2182350.03814.7
TkA06G027990PF14303NAM-associated2963960.006818.0
TkA06G027990PF18851baeRF_family83173462.19.0
TkA06G027990PF18851baeRF_family83984442.19.0
TkA06G027990PF14303NAM-associated4074720.006818.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FKE6拟南芥sp|Q9FKE6|CCT15_ARATH Cyclin-T1-560.000%Swiss-Prot高置信
Q8GYM6拟南芥sp|Q8GYM6|CCT14_ARATH Cyclin-T1-462.100%Swiss-Prot高置信
Q56YF8拟南芥sp|Q56YF8|CCT12_ARATH Cyclin-T1-253.900%Swiss-Prot高置信
Q2RAC5水稻sp|Q2RAC5|CCT13_ORYSJ Cyclin-T1-369.800%Swiss-Prot高置信
Q2QQS5水稻sp|Q2QQS5|CCT14_ORYSJ Cyclin-T1-461.300%Swiss-Prot高置信

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