TkA06G027390 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G027390

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 7405924-7408577 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1319 bp · TkA06G027390|TK1151|cDNA

CTAGTCCTAGCGTTTGGAACGACCTCTCTTTATTTTCTGACAAGAGCCAAGGGCTTTGGTTTTTCGTTTCTGTAATTTTCACACGCAGCCATGGCGATGCAAGCTGGAATGGGATTTTCTAAGATCATCATCTTAGTTGGAGCAGGGTACACTGGTACGTTGATGATGAAGAATGGTAAACTTTCGGATGTATTGGGCGAACTTCAGGCTTTGGTGAAAGGATATGAAGAAAAGCAGGCGAATGGAGCTGAAGGTGATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

903 bp · TkA06G027390|TK1151|CDS

ATGGCGATGCAAGCTGGAATGGGATTTTCTAAGATCATCATCTTAGTTGGAGCAGGGTACACTGGTACGTTGATGATGAAGAATGGTAAACTTTCGGATGTATTGGGCGAACTTCAGGCTTTGGTGAAAGGATATGAAGAAAAGCAGGCGAATGGAGCTGAAGGTGATCATGCTGATGCAATTGCCGCTCAGGTACGCCGATTGGCAATGGAGGTTCGACAGCTGGCATCATCAAGGCAGATCACTGTTCTCAATGGTGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

300 aa · TkA06G027390|TK1151|PROTEIN

MAMQAGMGFSKIIILVGAGYTGTLMMKNGKLSDVLGELQALVKGYEEKQANGAEGDHADAIAAQVRRLAMEVRQLASSRQITVLNGGSSGNVTSLVVPVAALGAVGYGYMWWKGLSFSDLMYVTKQNMSNAVSNLTKHLEQVSDALAAAKKHLTQRIENLDGKMDQQVEISKLIKNEVTDVRGDISQIGYDLDSLNRMVSGLNGKIMTLEEKQDLTNLGVWYLCNKADGNKLSGKAQEQLKLAGKSFGGYLTTGGLLNLE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G027390`
TK1151 ID	TkA06G027390
OH-1004 ID	LXL04_026104
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA06G027390`
位置	Chr06:7405924-7408577 (-)
描述	Protein of unknown function
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_026104` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	暂无功能描述
KEGG 基因交叉引用	暂无功能描述

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.901

排名 1 · TkA06G027390 · TK1151

细胞质0.084

排名 2 · TkA06G027390 · TK1151

细胞核0.074

排名 3 · TkA06G027390 · TK1151

细胞膜0.035

排名 4 · TkA06G027390 · TK1151

质体0.032

排名 5 · TkA06G027390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13729TraF_221-103 aa

PF10498IFT5723-75 aa

PF20362DUF665725-74 aa

PF06133Com_YlbF25-74 aa

PF06013WXG10028-76 aa

PF06103DUF94829-76 aa

PF04513Baculo_PEP_C30-75 aa

PF10046BLOC1_230-76 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G027390	`PF13729`	TraF_2	21	103	0.067	13.1
TkA06G027390	`PF10498`	IFT57	23	75	0.02	14.6
TkA06G027390	`PF20362`	DUF6657	25	74	0.025	15.1
TkA06G027390	`PF06133`	Com_YlbF	25	74	0.2	12.8
TkA06G027390	`PF06013`	WXG100	28	76	0.93	10.5
TkA06G027390	`PF06103`	DUF948	29	76	1.8	9.5
TkA06G027390	`PF04513`	Baculo_PEP_C	30	75	0.044	14.5
TkA06G027390	`PF10046`	BLOC1_2	30	76	0.52	11.4
TkA06G027390	`PF23203`	KIF21A	32	60	0.034	14.7
TkA06G027390	`PF30778`	SBP_bac_4HB	33	89	0.21	12.6
TkA06G027390	`PF22905`	Hydro_N_hd	37	66	0.11	13.1
TkA06G027390	`PF28231`	STB2_C	38	75	0.22	12.7
TkA06G027390	`PF11469`	Ribonucleas_3_2	47	64	0.11	13.7
TkA06G027390	`PF16526`	CLZ	53	75	0.044	14.9
TkA06G027390	`PF10805`	DUF2730	55	77	0.53	11.3
TkA06G027390	`PF24627`	PUMA_CC	56	79	0.0014	19.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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