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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G026010
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 7020637-7022232 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1194 bp · TkA06G026010|TK1151|cDNA

GAAACTGTGTCAAAAGCTCAAGACCCCCTTTAAAAAACAACTCCTTATTCATTGCTTTTGTAGCTTTCATTCATCAAAGGCAAGGAACAAAAAAAACTTTTATCTTCTAAAACCTCCAAACCAAACCCATTTAATACGTTCCAAGATTTTCCTCAAACATGGCAATGAGCAACAATGTCATCGGAGGCATCAACTTCATCGCCATGTTGCTATCGATCCCGATCATTGGAGCCGGGATCTGGCTATCAACCGAGACAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

810 bp · TkA06G026010|TK1151|CDS

ATGGCAATGAGCAACAATGTCATCGGAGGCATCAACTTCATCGCCATGTTGCTATCGATCCCGATCATTGGAGCCGGGATCTGGCTATCAACCGAGACAGATAACACGTGTGTCCAGATCCTACAATGGCCCGTTATAATTTTAGGGGTCTTGATCTTGGTTGTAGCCATAGCCGGCTTCATTGGAGGATTCTGGCGAGTCTCGTGGCTTCTTGTGATCTATCTCGTTGCCATGTTTGTACTCATCGTCTTGCTCACGTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

269 aa · TkA06G026010|TK1151|PROTEIN

MAMSNNVIGGINFIAMLLSIPIIGAGIWLSTETDNTCVQILQWPVIILGVLILVVAIAGFIGGFWRVSWLLVIYLVAMFVLIVLLTCLVVFVYMVTIRGSGHPEPSRSFLEYRLDDYSGFLRRRVRSHYKWDKIRTCLSSTTVCAELNQTYRMAQDFFNSHLTPLQSGCCKPPTQCGYTFVNPTYWISPINNAADMDCLNWSNEQTGLCYGCDSCKAGLLENLKKEWRRANIILIITLVALICVYVIGCCAFRNAKTEDL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G026010
TK1151 IDTkA06G026010
OH-1004 IDLXL04_026137
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G026010
位置Chr06:7020637-7022232 (-)
描述Similar to TRN2: Protein TORNADO 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g46700 参与生长素 的基叶转运，调节生长和器官组织以及细胞分化。
Tornado1 and tornado2 are required for the specification of radial and circumferential pattern in the Arabidopsis root.2000 · DOI: 10.1242/dev.127.15.3385
The ekeko mutant demonstrates a role for tetraspanin-like protein in plant development.2003 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2003.09.122
The TORNADO1 and TORNADO2 genes function in several patterning processes during early leaf development in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.040568
Mutations in the TORNADO2 gene affect cellular decisions in the peripheral zone of the shoot apical meristem of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1007/s11103-006-9105-z
Arabidopsis WIH1 and WIH2 genes act in the transition from somatic to reproductive cell fate.2011 · DOI: 10.1016/j.cub.2011.05.015
At2g19580 可能参与细胞分化的调控。 暂无已核实直接文献
At2g23810 可能参与细胞分化的调控。 暂无已核实直接文献
At4g28050 可能参与细胞分化的调控。 暂无已核实直接文献
At5g60220 可能参与细胞分化的调控。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026137 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006890 retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum 生物过程
GO:0009554 megasporogenesis 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009933 meristem structural organization 生物过程
GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程
GO:0009956 radial pattern formation 生物过程
GO:0010015 root morphogenesis 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0050829 defense response to Gram-negative bacterium 生物过程
GO:0090110 COPII-coated vesicle cargo loading 生物过程
GO:0099039 sphingolipid translocation 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G19580
ath:AT2G23810
ath:AT3G45600
ath:AT4G30430
ath:AT5G46700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.815
排名 1 · TkA06G026010 · TK1151
细胞质0.119
排名 2 · TkA06G026010 · TK1151
溶酶体／液泡0.078
排名 3 · TkA06G026010 · TK1151
内质网0.055
排名 4 · TkA06G026010 · TK1151
细胞核0.038
排名 5 · TkA06G026010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00335Tetraspanin6-251 aa
PF11992TgpA_N38-93 aa
PF06024Orf7839-60 aa
PF00487FA_desaturase41-88 aa
PF13567DUF413141-85 aa
PF12730ABC2_membrane_443-94 aa
PF20088DUF648044-57 aa
PF20990DUF2207_C45-133 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G026010PF00335Tetraspanin62511.3e-32114.0
TkA06G026010PF11992TgpA_N38930.2211.2
TkA06G026010PF06024Orf7839601.410.0
TkA06G026010PF00487FA_desaturase41880.8610.0
TkA06G026010PF13567DUF413141852.98.3
TkA06G026010PF12730ABC2_membrane_443943.88.2
TkA06G026010PF20088DUF648044570.7710.4
TkA06G026010PF20990DUF2207_C451330.0116.2
TkA06G026010PF31196Gp5647571.39.6
TkA06G026010PF20088DUF648065900.7710.4
TkA06G026010PF06024Orf7870941.410.0
TkA06G026010PF15883DUF4736731240.05713.9
TkA06G026010PF28057SosA761044.08.1
TkA06G026010PF31196Gp5678961.39.6
TkA06G026010PF28057SosA1451534.08.1
TkA06G026010PF20088DUF64802212490.7710.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FIQ5拟南芥sp|Q9FIQ5|TRN2_ARATH Protein TORNADO 271.000%Swiss-Prot高置信
Q9ZUN5拟南芥sp|Q9ZUN5|TET2_ARATH Tetraspanin-255.800%Swiss-Prot高置信
Q8S8Q6拟南芥sp|Q8S8Q6|TET8_ARATH Tetraspanin-846.800%Swiss-Prot中等置信
Q9SUD4拟南芥sp|Q9SUD4|TET7_ARATH Tetraspanin-743.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LSS4拟南芥sp|Q9LSS4|TET4_ARATH Tetraspanin-444.200%Swiss-Prot中等置信

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