TkA06G022490 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G022490

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 6193651-6196370 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1661 bp · TkA06G022490|TK1151|cDNA

GTTCGTTGATATCGACCACAACTAATTCAAGAGCTTTTGGGAAAGATAACGTCGTCGTTTTGTGTATGTCACCTGACACTGATACCTACATATAGTCATATAGATACAGATGAACGAAGAGGCGCCATACAATTTGCATTCCTGGAAAGAGCTCATAGAAGTGCCGTGGTAAACCCTAATCTCAGCTTAAATGGCATCTCTAATGTTGCCATCTCCATCTTCATGCTCCACTTCTTCTTCTTCGTCGCCATTATCTCGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1188 bp · TkA06G022490|TK1151|CDS

ATGGCATCTCTAATGTTGCCATCTCCATCTTCATGCTCCACTTCTTCTTCTTCGTCGCCATTATCTCGGTGCCCTTTAAGCCGTGGTCTTAGCTACAGCAACGCCCGTATTCCTGCTTCTGCTAGCAACATCAGATGCGAAGTTAGCAAATCATTGAACGGGAAACCATGTGTACCAATCATCAACGATAGAATGCTATCAAACATCATGCAACCACCTGGGCGCCTGAATCATCCTGTCATGAATGGAAAACTCAAAAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

395 aa · TkA06G022490|TK1151|PROTEIN

MASLMLPSPSSCSTSSSSSPLSRCPLSRGLSYSNARIPASASNIRCEVSKSLNGKPCVPIINDRMLSNIMQPPGRLNHPVMNGKLKIFSGTANSALSEEIARYMGLDLGRIEIKRFADGEIYVQLQESVRGCDVYLVQPTSPPANENLMELLVTIDACRRASAKNITAVIPYFGYARADRKTQGRESIAAKLVANLITEAGADRVLACDLHSGQSMGYFDIPVDHVYCQPVILDYLASKSICSNDLVVVSPDVGGVARAR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G022490`
TK1151 ID	TkA06G022490
OH-1004 ID	LXL04_026184
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G022490

位置 Chr06:6193651-6196370 (+)

描述 Similar to PRS1: Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g32380`	核糖-磷酸焦磷酸化酶 2，叶绿体。	暂无已核实直接文献
`At2g35390`	核糖-磷酸焦磷酸化酶 1，叶绿体。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0127700`	核糖-磷酸焦磷酸化酶 1，叶绿体。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026184 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006015 5-phosphoribose 1-diphosphate biosynthetic process 生物过程

GO:0006164 purine nucleotide biosynthetic process 生物过程

GO:0009156 ribonucleoside monophosphate biosynthetic process 生物过程

GO:0002189 ribose phosphate diphosphokinase complex 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能

GO:0004749 ribose phosphate diphosphokinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0016301 kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G32380

ath:AT2G35390

dosa:Os02g0127700

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.967

排名 1 · TkA06G022490 · TK1151

线粒体0.052

排名 2 · TkA06G022490 · TK1151

细胞质0.024

排名 3 · TkA06G022490 · TK1151

细胞核0.021

排名 4 · TkA06G022490 · TK1151

过氧化物酶体0.018

排名 5 · TkA06G022490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13793Pribosyltran_N85-201 aa

PF01106NifU94-133 aa

PF26420Halo_prof107-156 aa

PF14681UPRTase119-140 aa

PF00156Pribosyltran244-332 aa

PF14572Pribosyl_synth246-268 aa

PF14681UPRTase273-357 aa

PF14572Pribosyl_synth286-394 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G022490	`PF13793`	Pribosyltran_N	85	201	4.5e-51	172.4
TkA06G022490	`PF01106`	NifU	94	133	0.027	15.3
TkA06G022490	`PF26420`	Halo_prof	107	156	0.34	11.8
TkA06G022490	`PF14681`	UPRTase	119	140	0.0099	16.1
TkA06G022490	`PF00156`	Pribosyltran	244	332	1.2e-16	61.1
TkA06G022490	`PF14572`	Pribosyl_synth	246	268	1.7e-25	90.8
TkA06G022490	`PF14681`	UPRTase	273	357	0.0099	16.1
TkA06G022490	`PF14572`	Pribosyl_synth	286	394	1.7e-25	90.8
TkA06G022490	`PF26420`	Halo_prof	320	334	0.34	11.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q42583`	拟南芥	sp\|Q42583\|KPRS2_ARATH Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, chloroplastic	77.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q42581`	拟南芥	sp\|Q42581\|KPRS1_ARATH Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, chloroplastic	81.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q6Z2L5`	水稻	sp\|Q6Z2L5\|KPRS1_ORYSJ Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, chloroplastic	75.300%	Swiss-Prot	高置信

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