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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G018020
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 4929724-4930526 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

722 bp · TkA06G018020|TK1151|cDNA

CCTGTCCTTCCTTCCAGATCGTATAAAAAGGGGAGTATATAACAGATAAGCATTACTCACTCGCTACTCGCTTTCAACATTTGCAAACACGCACTAGAAAAAGAAAACAACGAAGGAATGTCGGAAGAAGGAAGAAGGAGCAAAAATGAAGGTCGGAAGAGATTCACGGATAAACAGATAAGCTTTCTAGAGTACATGTATGAAACTGAGTCGCGTCCTGCGTTACGGATGAAACACCAGTTAGCGAACAAGCTCGGGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

513 bp · TkA06G018020|TK1151|CDS

ATGTCGGAAGAAGGAAGAAGGAGCAAAAATGAAGGTCGGAAGAGATTCACGGATAAACAGATAAGCTTTCTAGAGTACATGTATGAAACTGAGTCGCGTCCTGCGTTACGGATGAAACACCAGTTAGCGAACAAGCTCGGGCTTCATCCTCGCCAGGTGGCGATTTGGTTTCAGAACAAAAGAGCGCGATCGAAATCAAGGCAGATTGAGCAAGAGTACAATACCTTGAAGCACGATTATGATACGCTAGCGTCGAAATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

170 aa · TkA06G018020|TK1151|PROTEIN

MSEEGRRSKNEGRKRFTDKQISFLEYMYETESRPALRMKHQLANKLGLHPRQVAIWFQNKRARSKSRQIEQEYNTLKHDYDTLASKSESLKKENQALLNQLEMLRNAANNTTGNSSSASDESDERRENNENVEIMVPFLYLGDESKFAEIEEWEEGGCSLGMDLQTWLEF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G018020
TK1151 IDTkA06G018020
OH-1004 IDLXL04_026250
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G018020
位置Chr06:4929724-4930526 (-)
描述Similar to ATHB-7: Homeobox-leucine zipper protein ATHB-7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g61890 可能的转录激活剂，可作为响应缺水的生长调节剂。
Structure and expression of the Arabidopsis thaliana homeobox gene Athb-12.2001 · DOI: 10.1006/bbrc.2001.4904
At2g46680 可能的转录激活剂，可作为响应缺水的生长调节剂。
The Arabidopsis homeobox gene ATHB-7 is induced by water deficit and by abscisic acid.1996 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1996.10020375.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q9XH35 可能的转录因子，可结合DNA序列5'-CAAT[AT]ATTG-3'。 暂无已核实直接文献
Os09g0528200 可能的转录因子，可结合DNA序列5'-CAAT[AT]ATTG-3'。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q01IK0 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026250 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0009725 response to hormone 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0033993 response to lipid 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G46680
ath:AT3G61890
dosa:Os02g0649300
dosa:Os09g0528200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.981
排名 1 · TkA06G018020 · TK1151
细胞质0.082
排名 2 · TkA06G018020 · TK1151
细胞膜0.017
排名 3 · TkA06G018020 · TK1151
内质网0.009
排名 4 · TkA06G018020 · TK1151
质体0.007
排名 5 · TkA06G018020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00046Homeodomain12-65 aa
PF30854Par-4_C24-45 aa
PF05920Homeobox_KN37-63 aa
PF01496V_ATPase_I38-128 aa
PF26212Phage_T7_Gp1539-128 aa
PF08172CASP_C58-131 aa
PF00170bZIP_158-106 aa
PF25450Rab11-FIP359-127 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G018020PF00046Homeodomain12653.5e-1762.7
TkA06G018020PF30854Par-4_C24450.07513.9
TkA06G018020PF05920Homeobox_KN37633.5e-0524.3
TkA06G018020PF01496V_ATPase_I381280.07811.6
TkA06G018020PF26212Phage_T7_Gp15391280.008915.0
TkA06G018020PF08172CASP_C581310.002517.9
TkA06G018020PF00170bZIP_1581060.4511.4
TkA06G018020PF25450Rab11-FIP3591270.0005121.1
TkA06G018020PF28907ZapB_rel63830.8411.0
TkA06G018020PF25966Myo5a641230.01516.1
TkA06G018020PF04977DivIC641050.6410.6
TkA06G018020PF24423OVT1651340.01116.9
TkA06G018020PF06156YabA651270.1213.7
TkA06G018020PF24915Spectrin_SESTD1661170.0814.1
TkA06G018020PF02183HALZ671061.9e-1247.8
TkA06G018020PF30854Par-4_C671040.07513.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M276拟南芥sp|Q9M276|ATB12_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-1258.000%Swiss-Prot低置信
P46897拟南芥sp|P46897|ATHB7_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-762.100%Swiss-Prot低置信
Q9XH35水稻sp|Q9XH35|HOX6_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX652.200%Swiss-Prot中等置信
Q651Z5水稻sp|Q651Z5|HOX6_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX652.200%Swiss-Prot中等置信
Q01IK0水稻sp|Q01IK0|HOX22_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX2244.100%Swiss-Prot中等置信

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