TkA06G017360 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G017360

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 4730383-4735870 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2775 bp · TkA06G017360|TK1151|cDNA

CAAATAATGGGAGTTTGACGTGAAAGACCTTAGACGGAGGGGTGCTCGGAGTGTGCTCAATAAAAATCAAATCTAACATCGCCAACTTGGCCGAAGCTTTTCTTGGACTTCCGACACCGACCGAGGACTCCACACCTCACACTCCATGCCATCAACTTACTTTCAGATCACCATCTAAGACCTCTCCTGCTGTGTTTATCGGCGGTATGGGCGGCGGTCAGAAGAGCTACACCACCAATCCAGACGATTACAAGCTTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

2145 bp · TkA06G017360|TK1151|CDS

ATGGGCGGCGGTCAGAAGAGCTACACCACCAATCCAGACGATTACAAGCTTTTAGAAGAAGTAGGTTACGGCGCCAGCGCCACCGTCTACAGAGCGATCTATCTCCCTTCCAATGACGTCGTCGCCGTTAAGTGCTTGGATCTCGATCGCTGCAACAGCAATCTGGATGATATACGAAGAGAAGCACAAACAATGAGTTTAATAGATCATCCGAATGTGATCCGTGCATTTTGTTCATTTGTTGTGAAGCAAAACCTTTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

714 aa · TkA06G017360|TK1151|PROTEIN

MGGGQKSYTTNPDDYKLLEEVGYGASATVYRAIYLPSNDVVAVKCLDLDRCNSNLDDIRREAQTMSLIDHPNVIRAFCSFVVKQNLWVVMPFMAEGSCLHLMKTAYPDGFEESAIASILKETLKALEYLHRHGHIHRDVKAGNILLDTNGVIKLGDFGVSACMFDRGDRQRSRNTFVGTPCWMAPEVLQPGSGYDFKADIWSFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTIQNAPPGLDYDRDKRFSKSFKELVAMCLVKD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G017360`
TK1151 ID	TkA06G017360
OH-1004 ID	LXL04_026261
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 94.695 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA06G017360`
位置	Chr06:4730383-4735870 (-)
描述	Similar to fray2: Serine/threonine-protein kinase fray2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_026261` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程 GO:0006611 protein export from nucleus 生物过程 GO:0006884 cell volume homeostasis 生物过程 GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0007231 osmosensory signaling pathway 生物过程 GO:0009410 response to xenobiotic stimulus 生物过程 GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程 GO:0038116 chemokine (C-C motif) ligand 21 signaling pathway 生物过程 GO:0038146 chemokine (C-X-C motif) ligand 12 signaling pathway 生物过程 GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程 GO:0070294 renal sodium ion absorption 生物过程
KEGG 基因交叉引用	ddi:DDB_G0276577 hsa:9943 pon:100174028 ssc:397618 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.680

排名 1 · TkA06G017360 · TK1151

细胞膜0.208

排名 2 · TkA06G017360 · TK1151

细胞核0.204

排名 3 · TkA06G017360 · TK1151

高尔基体0.097

排名 4 · TkA06G017360 · TK1151

溶酶体／液泡0.047

排名 5 · TkA06G017360 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase15-276 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr16-272 aa

PF03109ABC127-46 aa

PF06293Kdo39-56 aa

PF03109ABC146-172 aa

PF06293Kdo116-167 aa

PF17667Pkinase_fungal117-203 aa

PF07387Seadorna_VP7120-157 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G017360	`PF00069`	Pkinase	15	276	2.6e-62	211.3
TkA06G017360	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	16	272	2e-45	155.8
TkA06G017360	`PF03109`	ABC1	27	46	9.4e-05	22.4
TkA06G017360	`PF06293`	Kdo	39	56	0.16	12.1
TkA06G017360	`PF03109`	ABC1	46	172	9.4e-05	22.4
TkA06G017360	`PF06293`	Kdo	116	167	0.16	12.1
TkA06G017360	`PF17667`	Pkinase_fungal	117	203	0.0017	17.9
TkA06G017360	`PF07387`	Seadorna_VP7	120	157	0.091	12.5
TkA06G017360	`PF01636`	APH	120	152	0.17	12.3
TkA06G017360	`PF14531`	Kinase-like	124	220	0.0016	18.5
TkA06G017360	`PF14531`	Kinase-like	475	494	0.0016	18.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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