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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G011240
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 2940539-2942546 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1197 bp · TkA06G011240|TK1151|cDNA

AAATCATCAAAAAGATCCAAAATTACCCTAATGATGCAAGTCCAATTTTTTCAAACCATTTGTCTTGACAACTATAGGGACATTACTGCAATTTTGTCTAAAAATAAAAGAGGCTGGATTTTCTTGGTATCTCCGGACTCCAGTACACCTAATTCACCTGAGCCAATGGATCGGAAGAAAAGATGTGCAGTTGTTACAGGAGGTAACAAAGGGATTGGATTAGAAACATGTCGTCAGCTTGCTTTGAATGATGGAATTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1032 bp · TkA06G011240|TK1151|CDS

ATGATGCAAGTCCAATTTTTTCAAACCATTTGTCTTGACAACTATAGGGACATTACTGCAATTTTGTCTAAAAATAAAAGAGGCTGGATTTTCTTGGTATCTCCGGACTCCAGTACACCTAATTCACCTGAGCCAATGGATCGGAAGAAAAGATGTGCAGTTGTTACAGGAGGTAACAAAGGGATTGGATTAGAAACATGTCGTCAGCTTGCTTTGAATGATGGAATTGAAGTTATATTAACTGCTAGGGACGAGAGTCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

343 aa · TkA06G011240|TK1151|PROTEIN

MMQVQFFQTICLDNYRDITAILSKNKRGWIFLVSPDSSTPNSPEPMDRKKRCAVVTGGNKGIGLETCRQLALNDGIEVILTARDESRGIEAVKKLNESGLPNIVFHQLDINDPDSIERLAKFIETNFKKLDILINNAALIGIIIHEKEFKAGAGFVQVLDENAHLLSEVIEEPYELGEECLKTNYFATKRLTEALIPLLQLSTSPRIVNLTSMYGELGYLHNEKLKEELRDMQNVTEERIEEIIEMFLRDFKAAMLQENG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G011240
TK1151 IDTkA06G011240
OH-1004 IDLXL04_026465
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)64.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 85.714 / OH-1004 98.990
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G011240
位置Chr06:2940539-2942546 (-)
描述Similar to SDR1: (+)-neomenthol dehydrogenase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g61220 醛还原酶，催化饱和和 α,β-不饱和且碳数大于5的醛的醛基还原反应。 暂无已核实直接文献
At2g24190 醛还原酶，催化饱和和 α,β-不饱和且碳数大于5的醛的醛基还原反应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026465 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009820 alkaloid metabolic process 生物过程
GO:0016104 triterpenoid biosynthetic process 生物过程
GO:0016135 saponin biosynthetic process 生物过程
GO:0097295 morphine biosynthetic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0008106 alcohol dehydrogenase (NADP+) activity 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0016616 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:ABC47654
ath:AT2G24190
ath:AT3G61220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.572
排名 1 · TkA06G011240 · TK1151
细胞核0.233
排名 2 · TkA06G011240 · TK1151
线粒体0.144
排名 3 · TkA06G011240 · TK1151
过氧化物酶体0.103
排名 4 · TkA06G011240 · TK1151
内质网0.092
排名 5 · TkA06G011240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00106adh_short52-221 aa
PF08659KR54-139 aa
PF01370Epimerase54-140 aa
PF02719Polysacc_synt_254-139 aa
PF16363GDP_Man_Dehyd55-121 aa
PF13561adh_short_C259-142 aa
PF03979Sigma70_r1_175-87 aa
PF19233DUF5886106-135 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G011240PF00106adh_short522212e-31109.7
TkA06G011240PF08659KR541391.3e-0732.5
TkA06G011240PF01370Epimerase541401.1e-0525.7
TkA06G011240PF02719Polysacc_synt_2541390.03614.0
TkA06G011240PF16363GDP_Man_Dehyd551210.005516.9
TkA06G011240PF13561adh_short_C2591423.1e-2073.5
TkA06G011240PF03979Sigma70_r1_175870.3711.5
TkA06G011240PF19233DUF58861061350.2212.5
TkA06G011240PF03979Sigma70_r1_11091240.3711.5
TkA06G011240PF16359RcsD_ABL1612000.1113.4
TkA06G011240PF13561adh_short_C21682183.1e-2073.5
TkA06G011240PF01370Epimerase1792181.1e-0525.7
TkA06G011240PF02719Polysacc_synt_21932420.03614.0
TkA06G011240PF03979Sigma70_r1_12102470.3711.5
TkA06G011240PF19233DUF58862182470.2212.5
TkA06G011240PF16359RcsD_ABL2232590.1113.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M2E2拟南芥sp|Q9M2E2|SDR1_ARATH (+)-neomenthol dehydrogenase50.800%Swiss-Prot高置信
Q9ZUH5拟南芥sp|Q9ZUH5|SDR2B_ARATH Short-chain dehydrogenase/reductase 2b49.800%Swiss-Prot中等置信

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