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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G008620
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 2171553-2172610 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

621 bp · TkA06G008620|TK1151|cDNA

ATGGGAGGTGCTTGTGGATACGGAAATACGATGACAAACGGATACGGTACAAATACAGCAGCATTGAGCTCAACCATCTTTAGCAACGGATACGCGTGTGGCCAATGTTACCAAATAAAATGTGTCCAATCTCCATGGTGCTCAAAAGGTGTCGCCACTGTAACCGCAACAAACCTTTGTCCCCCAAACTGGTCAAAAGATTCAAACAAAGGCGGATGGTGCAACCCCCCTCGAACCCATTTCGACATGGCTAAGCCCGC...

CDS

下载 CDS FASTA

621 bp · TkA06G008620|TK1151|CDS

ATGGGAGGTGCTTGTGGATACGGAAATACGATGACAAACGGATACGGTACAAATACAGCAGCATTGAGCTCAACCATCTTTAGCAACGGATACGCGTGTGGCCAATGTTACCAAATAAAATGTGTCCAATCTCCATGGTGCTCAAAAGGTGTCGCCACTGTAACCGCAACAAACCTTTGTCCCCCAAACTGGTCAAAAGATTCAAACAAAGGCGGATGGTGCAACCCCCCTCGAACCCATTTCGACATGGCTAAGCCCGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

206 aa · TkA06G008620|TK1151|PROTEIN

MGGACGYGNTMTNGYGTNTAALSSTIFSNGYACGQCYQIKCVQSPWCSKGVATVTATNLCPPNWSKDSNKGGWCNPPRTHFDMAKPAFMQIAQWKAGIVPVVYRRVPCVRKGGLRFSFQGNGYWLLVYVMNVGGAGDIKSMWVKGTKTGWLSMSHNWGVSYQAFATLRGQALSFRLTSYTTKQTITAYNVAPANWNLGCRVINCGT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G008620
TK1151 IDTkA06G008620
OH-1004 IDLXL04_026499
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.631 / OH-1004 23.879
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G008620
位置Chr06:2171553-2172610 (+)
描述Similar to EXPA7: Expansin-A7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g12560 通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键，导致植物细胞壁松弛和延伸。 暂无已核实直接文献
At1g62980 通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键，导致植物细胞壁松弛和延伸。 暂无已核实直接文献
At5g56320 通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键，导致植物细胞壁松弛和延伸。
LBD18 acts as a transcriptional activator that directly binds to the EXPANSIN14 promoter in promoting lateral root emergence of Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12013

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os10g0535900 可能通过破坏纤维素微纤维与基质葡聚糖之间的非共价键导致植物细胞壁松弛和伸长。 暂无已核实直接文献
Os03g0155300 可能通过破坏纤维素微纤维与基质葡聚糖之间的非共价键导致植物细胞壁松弛和伸长。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026499 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009828 plant-type cell wall loosening 生物过程
GO:0009853 photorespiration 生物过程
GO:0009854 oxidative photosynthetic carbon pathway 生物过程
GO:0048767 root hair elongation 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0016618 hydroxypyruvate reductase [NAD(P)H] activity 分子功能
GO:0030267 glyoxylate reductase (NADPH) activity 分子功能
GO:0051287 NAD binding 分子功能
GO:0120509 hydroxypyruvate reductase (NADPH) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12550
ath:AT1G12560
ath:AT1G62980
osa:107277540
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.788
排名 1 · TkA06G008620 · TK1151
细胞质0.101
排名 2 · TkA06G008620 · TK1151
溶酶体／液泡0.065
排名 3 · TkA06G008620 · TK1151
内质网0.037
排名 4 · TkA06G008620 · TK1151
细胞膜0.025
排名 5 · TkA06G008620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29515Expansin_N2-92 aa
PF22514EXPB1_D13-108 aa
PF03330DPBB_119-103 aa
PF01357Expansin_C115-192 aa
PF22514EXPB1_D1184-185 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G008620PF29515Expansin_N2922.4e-0938.1
TkA06G008620PF22514EXPB1_D131081.1e-0526.5
TkA06G008620PF03330DPBB_1191032.1e-2176.6
TkA06G008620PF01357Expansin_C1151925.4e-2691.2
TkA06G008620PF22514EXPB1_D11841851.1e-0526.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LN94拟南芥sp|Q9LN94|EXPA7_ARATH Expansin-A772.900%Swiss-Prot高置信
Q9LQ07拟南芥sp|Q9LQ07|EXP18_ARATH Expansin-A1869.500%Swiss-Prot高置信
Q9FMA0拟南芥sp|Q9FMA0|EXP14_ARATH Expansin-A1457.300%Swiss-Prot高置信
Q8W2X8水稻sp|Q8W2X8|EXP30_ORYSJ Putative expansin-A3067.000%Swiss-Prot高置信
Q7G6Z2水稻sp|Q7G6Z2|EXP12_ORYSJ Expansin-A1260.200%Swiss-Prot高置信

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