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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G005780
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 1470014-1471931 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1842 bp · TkA06G005780|TK1151|cDNA

CAAAATTTCGACTTTTTGAAATGTAACCATATGTTATTTATATCTATCTCGGTTTCTATTTTTTCATTATCCCAATGTCCATCAAAATGATACAAGGTAACCGGTGGTCATGGTGGTCGGAACTTAGCAGCAAGAAAGACGAGCTCACTTTTCCAATACTCGTCATTTCAGTCATCTCATTGGCTATTATATGGTACAAACTCAGGAAGCCCACATTCCCTTTGCCACCTGGACCTCGTGGCCTGCCGTTGGTGGGTTAC...

1575 bp · TkA06G005780|TK1151|CDS

ATGTCCATCAAAATGATACAAGGTAACCGGTGGTCATGGTGGTCGGAACTTAGCAGCAAGAAAGACGAGCTCACTTTTCCAATACTCGTCATTTCAGTCATCTCATTGGCTATTATATGGTACAAACTCAGGAAGCCCACATTCCCTTTGCCACCTGGACCTCGTGGCCTGCCGTTGGTGGGTTACCTTCCATTTCTTAACCCCAACTTGCACCACGAATTCTCCAAAATGGCTCAACGGTATGGCCCTATTTTTAAACT...

524 aa · TkA06G005780|TK1151|PROTEIN

MSIKMIQGNRWSWWSELSSKKDELTFPILVISVISLAIIWYKLRKPTFPLPPGPRGLPLVGYLPFLNPNLHHEFSKMAQRYGPIFKLQLGRKTYIVLSSSDMAKEVVRVQDDVFANRDPPMAGVIVTYGGKDIVWSDNNSYWRNMRKVFVFEVLSNKNLEASRSFRRSGVRKIIKQVHESMGTEVDVGGIAFTSSLSVVTSMMWGKSLDEDEERINGFREVISKIVDLLGAANLSDFFPVLTMFDLQKVQRDMKKQLENV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G005780
TK1151 IDTkA06G005780
OH-1004 IDLXL04_014824
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)66.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.237 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G005780
位置Chr06:1470014-1471931 (-)
描述Similar to CYP93A1: 3,9-dihydroxypterocarpan 6A-monooxygenase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g45560 细胞色素 P450 76C1。 暂无已核实直接文献
At2g45570 细胞色素 P450 76C2。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_014824 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009718 anthocyanin-containing compound biosynthetic process 生物过程
GO:0016099 monoterpenoid biosynthetic process 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0016705 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen 分子功能
GO:0016709 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能
GO:0020037 heme binding 分子功能
GO:0033772 flavonoid 3',5'-hydroxylase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:CAC80883
gmx:100776878
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

内质网0.910
排名 1 · TkA06G005780 · TK1151
细胞膜0.039
排名 2 · TkA06G005780 · TK1151
细胞质0.033
排名 3 · TkA06G005780 · TK1151
线粒体0.029
排名 4 · TkA06G005780 · TK1151
质体0.028
排名 5 · TkA06G005780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067p45051-507 aa
PF30234TP_0208_C195-280 aa
PF29947C5orf22247-305 aa
PF09177STX6_10_61_N248-298 aa
PF22470Histone_HNS_N255-290 aa
PF29947C5orf22306-348 aa
PF09177STX6_10_61_N316-356 aa
PF22470Histone_HNS_N329-353 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G005780PF00067p450515074.1e-107359.5
TkA06G005780PF30234TP_0208_C1952800.1512.7
TkA06G005780PF29947C5orf222473050.07614.4
TkA06G005780PF09177STX6_10_61_N2482981.310.4
TkA06G005780PF22470Histone_HNS_N2552902.48.8
TkA06G005780PF29947C5orf223063480.07614.4
TkA06G005780PF09177STX6_10_61_N3163561.310.4
TkA06G005780PF22470Histone_HNS_N3293532.48.8
TkA06G005780PF05952ComX3333570.1313.2
TkA06G005780PF30234TP_0208_C3453590.1512.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64636拟南芥sp|O64636|C76C1_ARATH Cytochrome P450 76C135.900%Swiss-Prot中等置信
O64637拟南芥sp|O64637|C76C2_ARATH Cytochrome P450 76C234.500%Swiss-Prot中等置信

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