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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G001020
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 224505-229157 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3660 bp · TkA06G001020|TK1151|cDNA

CAACAATCTCTTAACACCCCCTCATTGTCTTTTCTTTCATCTCATATATTTCACTTTTAACTTCGGTAGGCCTGTCCCTAACCCACCATTCTATTTTTATTCATAAATTCATCTCTCCTTATCTCTTTCCCATAACCCGTGTCTTGAAATTGCTCCTTCTCTTCCATCCCCATACAAATTCATCGACTTTCTTCAATAAAGTCATGTTTTGATCCTCAAATCGACATCCTTTAATGCCCAAAAGTGATTTTCTCTTCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2967 bp · TkA06G001020|TK1151|CDS

ATGTCAAAGCAGCCCATTCTACCTTCTTCCCGCCAAATTACATATGTATTCTTCTTATTATTTTCCTTCGCCGGCATATTTTTCCGGTCAGTATTCTGCTCTTCCTCGTCTGTTGAAGTCCACGCACTGATTGATTTCAAGAAACAGCTAAAAGACCCTTTGAATTACTTGGATTCATGGAAGATCACGGAATCCCCTTGTCAATTTTACGGGGTTTCTTGCGACGATCAAACGGGTCGGGTGGTGGGGATTTCGTTGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

988 aa · TkA06G001020|TK1151|PROTEIN

MSKQPILPSSRQITYVFFLLFSFAGIFFRSVFCSSSSVEVHALIDFKKQLKDPLNYLDSWKITESPCQFYGVSCDDQTGRVVGISLNYKSLSGKISPALGALQSLKSLVIPSNYIYGELPTALVNCSDLRVLNVTANNITGVLPDLSKLQKLEILDVSNNYLTGDFPTWVGSLTRLSKLGLNDNNFEEGGIPENIGNLTNLRWLNLGGISLTGEIPKSVFDLKDLETLDLSSNKISGDFPVEITKLRNLLKIELFGNRLT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G001020
TK1151 IDTkA06G001020
OH-1004 IDLXL04_026602
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G001020
位置Chr06:224505-229157 (+)
描述Similar to CEPR2: Receptor protein-tyrosine kinase CEPR2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g72180 受体激酶，参与感知 C 端编码植物信号肽 (CEP) 及随后对根和芽的发育调控。 暂无已核实直接文献
At5g49660 受体激酶参与 C 末端编码的植物信号肽 的感知以及根和芽发育的后续调节。
XYLEM INTERMIXED WITH PHLOEM1, a leucine-rich repeat receptor-like kinase required for stem growth and vascular development in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1007/s00425-011-1489-6
CEP5 and XIP1/CEPR1 regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1093/jxb/erw231
At1g09970 在病原体相关分子模式 诱导的模式触发免疫 信号传导中发挥作用。
RLK7, a leucine-rich repeat receptor-like kinase, is required for proper germination speed and tolerance to oxidative stress in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1260-4
The secreted peptide PIP1 amplifies immunity through receptor-like kinase 7.2014 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1004331
At4g28650 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
At1g28440 类受体蛋白激酶 HSL1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026602 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0009960 endosperm development 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0010555 response to mannitol 生物过程
GO:0031540 regulation of anthocyanin biosynthetic process 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048437 floral organ development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09970
ath:AT1G28440
ath:AT1G72180
ath:AT3G19700
ath:AT5G49660
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.855
排名 1 · TkA06G001020 · TK1151
内质网0.094
排名 2 · TkA06G001020 · TK1151
细胞质0.059
排名 3 · TkA06G001020 · TK1151
溶酶体／液泡0.034
排名 4 · TkA06G001020 · TK1151
细胞核0.034
排名 5 · TkA06G001020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17561TssO13-42 aa
PF08263LRRNT_239-75 aa
PF00560LRR_185-102 aa
PF12799LRR_485-113 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL2195-110 aa
PF24758LRR_At5g5637097-158 aa
PF23598LRR_1498-181 aa
PF23952LRR_EndoS101-160 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G001020PF17561TssO13420.03714.7
TkA06G001020PF08263LRRNT_239751.1e-0939.1
TkA06G001020PF00560LRR_1851023.8e-43136.8
TkA06G001020PF12799LRR_4851132.8e-2794.8
TkA06G001020PF25019LRR_R13L1-DRL21951102.1e-0628.4
TkA06G001020PF24758LRR_At5g56370971581.8e-0628.5
TkA06G001020PF23598LRR_14981812.3e-32112.8
TkA06G001020PF23952LRR_EndoS1011600.1113.4
TkA06G001020PF12799LRR_41031402.8e-2794.8
TkA06G001020PF24141LRR_ComC1031922.7e-0628.0
TkA06G001020PF00560LRR_11041263.8e-43136.8
TkA06G001020PF13855LRR_81041463.4e-34117.1
TkA06G001020PF29594LRR_SKP21191350.0001421.9
TkA06G001020PF13516LRR_61261410.005217.4
TkA06G001020PF00560LRR_11291453.8e-43136.8
TkA06G001020PF13855LRR_81291863.4e-34117.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C7T7拟南芥sp|Q9C7T7|CEPR2_ARATH Receptor protein-tyrosine kinase CEPR251.200%Swiss-Prot低置信
Q9FGL5拟南芥sp|Q9FGL5|CEPR1_ARATH Receptor protein-tyrosine kinase CEPR140.000%Swiss-Prot低置信
F4I2N7拟南芥sp|F4I2N7|RLK7_ARATH Receptor-like protein kinase 742.100%Swiss-Prot低置信
Q9M0G7拟南芥sp|Q9M0G7|MIK1_ARATH MDIS1-interacting receptor like kinase 145.200%Swiss-Prot低置信
Q9SGP2拟南芥sp|Q9SGP2|HSL1_ARATH Receptor-like protein kinase HSL139.600%Swiss-Prot低置信

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