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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G446390
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 111637518-111641162 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2451 bp · TkA05G446390|TK1151|cDNA

CCCACATATCTTCAAACCCTACTTTAAGTTATGTTCAAAACATCATCGATCAATTCTGTTGCGATTGACAAAATTTGAAGAACAGGAAAAAAAACACAAAACCAAAAAGAAATTGAGATACGGTAATCAACATAAAAATGGATGATTAGATAAATAAAAAAGGTAAACGTATATAAAATGTGGAAGCGTGGAGGTAGCTTGCACGGTGGCGGTGGTGCAGAGAAATTGCAGCTGCTGAAGGGCAACCACATGGTGGCGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1191 bp · TkA05G446390|TK1151|CDS

ATGTCCGCCGCTGCCGCAATGTACTACGAAACCGATTTGAGCCCAACCGCCCCAACTCCACGACTTTCAACAGCTTCAGATCGCACCTTTGGTGCACTCTACTATGGAAACAAGGGACCTGATATGGGCTATATGCTTTCGTCAACCTCGAGAAACAGTAAAGCATCAACTTCGTCACGAACAGTAGATGACGTGGACAACGAAATGCGACGATTAAAAATGGAACTCGAGAAAACAATGGAGATGTACAGCACAGCCTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

396 aa · TkA05G446390|TK1151|PROTEIN

MSAAAAMYYETDLSPTAPTPRLSTASDRTFGALYYGNKGPDMGYMLSSTSRNSKASTSSRTVDDVDNEMRRLKMELEKTMEMYSTACKDALTAKQKAGELEQGRVEEANRLEEATSTEEAREVAAKEKERYKALMAKARASRRIAEIELQKRALEHPEEKHQESHRYRRYTIDEIEKATDFFEKARKIGEGGYGPVFKGRLDNTVVAIKVLRPDAAQGRSQFQQEVEVLSCMRHPNMVLLLGACPEYGCLVYEYMANGSL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G446390
TK1151 IDTkA05G446390
OH-1004 IDLXL04_022120
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.495 / OH-1004 51.842
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G446390
位置Chr05:111637518-111641162 (+)
描述Similar to PUB35: U-box domain-containing protein 35
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g19410 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At5g61550 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At4g25160 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At5g61560 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献
At5g51270 起E3泛素连接酶的作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022120 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0061630 ubiquitin protein ligase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G19410
ath:AT4G25160
ath:AT5G61550
ath:AT5G61560
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.464
排名 1 · TkA05G446390 · TK1151
细胞质0.383
排名 2 · TkA05G446390 · TK1151
细胞核0.291
排名 3 · TkA05G446390 · TK1151
高尔基体0.044
排名 4 · TkA05G446390 · TK1151
内质网0.040
排名 5 · TkA05G446390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11744ALMT48-167 aa
PF00631G-gamma61-89 aa
PF03109ABC165-128 aa
PF26206PTX3_N66-142 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr94-129 aa
PF00631G-gamma101-118 aa
PF10279Latarcin102-138 aa
PF00069Pkinase113-153 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G446390PF11744ALMT481671.78.1
TkA05G446390PF00631G-gamma61890.6210.8
TkA05G446390PF03109ABC1651280.0001521.8
TkA05G446390PF26206PTX3_N661420.213.4
TkA05G446390PF07714PK_Tyr_Ser-Thr941296.7e-38131.2
TkA05G446390PF00631G-gamma1011180.6210.8
TkA05G446390PF10279Latarcin1021381.79.7
TkA05G446390PF00069Pkinase1131538.8e-40137.5
TkA05G446390PF01636APH1251460.0414.4
TkA05G446390PF12330Haspin_kinase1262560.001718.2
TkA05G446390PF10279Latarcin1731871.79.7
TkA05G446390PF00069Pkinase1823858.8e-40137.5
TkA05G446390PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1843816.7e-38131.2
TkA05G446390PF03109ABC11882170.0001521.8
TkA05G446390PF12260PIP49_C2373390.02614.8
TkA05G446390PF03109ABC12903320.0001521.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8S8S7拟南芥sp|Q8S8S7|PUB34_ARATH U-box domain-containing protein 3448.100%Swiss-Prot中等置信
Q9FKG6拟南芥sp|Q9FKG6|PUB52_ARATH U-box domain-containing protein 5249.000%Swiss-Prot中等置信
Q9SW11拟南芥sp|Q9SW11|PUB35_ARATH U-box domain-containing protein 3555.800%Swiss-Prot中等置信
Q9FKG5拟南芥sp|Q9FKG5|PUB51_ARATH U-box domain-containing protein 5145.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LU47拟南芥sp|Q9LU47|PUB53_ARATH Putative U-box domain-containing protein 5352.000%Swiss-Prot中等置信

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