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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G441620
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 110282917-110286136 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2082 bp · TkA05G441620|TK1151|cDNA

GACTATACTAGAAAAAAAAAACATAATACAAATCTAATTAGTTATACATTTCATTTATAAAGGGCCCGTATATCTCATACAAAAAAAAGCCCAATTCCTTTTCAATTCAAACACACCCACGACTAAATTCATAATCATTTCCTTCTTCTTCTTCCTCCGACGTGATCGCCATATCCTTTCCCTCATTGAACCCGTAAATTTGATGAGAATAAAATGTTATGACGAAGAAGATGAAACTTTCACATCTATGGCGGAACCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1470 bp · TkA05G441620|TK1151|CDS

ATGAGCCGCCACAACACCAACCAGCCATTTTACGTCATTGGTCATAAAACCGCCAACATTCGCGATCTTTACACATTAGGTCAAAAACTCGGTCAAGGCCAATTCGGTACAACCTACTTATGCACCGAAAACTCCACAAACACAAACTACGCCTGCAAATCAATTTCAAAACGGAAATTGATTTCCAAAGAGGACGTAGAAGATGTTAGAAGAGAGATTCAAATAATGCACCATTTAGCAGGCCACAAGAACATTGTAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

489 aa · TkA05G441620|TK1151|PROTEIN

MSRHNTNQPFYVIGHKTANIRDLYTLGQKLGQGQFGTTYLCTENSTNTNYACKSISKRKLISKEDVEDVRREIQIMHHLAGHKNIVTIKGAYEDTLYVHIVMELCNGGELFDRIIQRGQYSECKAAELTKIIVGVVEACHSLSVMHRDLKPENFLLVNRDDDFSLKAIDFGLSVFFKPGQVFKDVVGSPYYVAPEVLKKNYGPEADVWTAGVILYILLSGVPPFWAETQQGIFDAVLKAHIDFDSDPWPLISESGKDLIK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G441620
TK1151 IDTkA05G441620
OH-1004 IDLXL04_009720
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 89.071
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G441620
位置Chr05:110282917-110286136 (-)
描述Similar to CPK4: Calcium-dependent protein kinase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g17290 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
CDPKs CPK6 and CPK3 function in ABA regulation of guard cell S-type anion- and Ca(2+)-permeable channels and stomatal closure.2006 · DOI: 10.1371/journal.pbio.0040327
Calcium-dependent protein kinases responsible for the phosphorylation of a bZIP transcription factor FD crucial for the florigen complex formation.2015 · DOI: 10.1038/srep08341
At4g35310 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At4g38230 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009720 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:1902456 regulation of stomatal opening 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17290
ath:AT4G35310
ath:AT4G38230
sot:102594309
sot:102604043
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.585
排名 1 · TkA05G441620 · TK1151
细胞核0.297
排名 2 · TkA05G441620 · TK1151
细胞膜0.283
排名 3 · TkA05G441620 · TK1151
高尔基体0.082
排名 4 · TkA05G441620 · TK1151
溶酶体／液泡0.063
排名 5 · TkA05G441620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase24-282 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr25-276 aa
PF14531Kinase-like25-84 aa
PF04558tRNA_synt_1c_R143-66 aa
PF01636APH55-83 aa
PF06293Kdo99-170 aa
PF14531Kinase-like122-230 aa
PF01636APH143-172 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G441620PF00069Pkinase242823.8e-77259.9
TkA05G441620PF07714PK_Tyr_Ser-Thr252761.9e-2590.3
TkA05G441620PF14531Kinase-like25840.1811.8
TkA05G441620PF04558tRNA_synt_1c_R143660.07313.7
TkA05G441620PF01636APH55830.05913.8
TkA05G441620PF06293Kdo991700.0007919.6
TkA05G441620PF14531Kinase-like1222300.1811.8
TkA05G441620PF01636APH1431720.05913.8
TkA05G441620PF27559MTUS1_CCDC69_CC13013650.1313.1
TkA05G441620PF20742DUF5580_M3103880.0003121.4
TkA05G441620PF04028DUF3743103480.212.0
TkA05G441620PF13833EF-hand_83123521e-1764.3
TkA05G441620PF12763EH3223931.1e-0835.6
TkA05G441620PF25825SAPC2_N3223670.002918.2
TkA05G441620PF10591SPARC_Ca_bdg3233880.04214.9
TkA05G441620PF21008AIF-13243894.5e-0524.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38872拟南芥sp|Q38872|CDPK6_ARATH Calcium-dependent protein kinase 687.600%Swiss-Prot高置信
Q38871拟南芥sp|Q38871|CDPK5_ARATH Calcium-dependent protein kinase 581.200%Swiss-Prot高置信
Q9SZM3拟南芥sp|Q9SZM3|CDPKQ_ARATH Calcium-dependent protein kinase 2680.300%Swiss-Prot高置信

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