TkA05G433410 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G433410

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 108166959-108171392 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1793 bp · TkA05G433410|TK1151|cDNA

TGAAGATAGTGGATGACACATGCAAAACATTCACGTACCTAAACTTTATAAGACATTTTTGCTTCTAATTAACATCATTAATGGAGGACATACCACAATGCAATATGATTCTTGTTTCCTATCATTATTTTCATTCCTATATATATACCTCTACAAGCATTAAGCCCAACATTAATCTCTCCAGCACTCTCATTTTGGTCAACTGGAGAGATTATAAGAAAGAAGAAAACCAAAAATAAACCGATCAAAGGAAGACGATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1134 bp · TkA05G433410|TK1151|CDS

ATGGAGATGCCAGATGGCTGGTTTTGGCGGTTTTGCAAGCAAGGGAGGCCGTATGTCGGGGTTCTTTTCTTACAATTGGGATATGCTATTAACAATCTTCTGGTGAAGTCTGCTTTAGATGAGGGCTTAAATCCCTACACATTTTCTGTTTATAGAAATATTGCTGCAGCAGTTGCTTTTGGCCCATTTGCTCTATATTTTGAAAGGAAAATACGTACTCGGATGACATTTTCAGTATTTTGGAAGATATCATTGTTGGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

377 aa · TkA05G433410|TK1151|PROTEIN

MEMPDGWFWRFCKQGRPYVGVLFLQLGYAINNLLVKSALDEGLNPYTFSVYRNIAAAVAFGPFALYFERKIRTRMTFSVFWKISLLALLEPVMDQILYYTGMKYTTATFAIAMCNVLPALTFVMAWIFRLEKVNVKKLHSQGKILGTLITVGGAMVMTLVNGPPVPLPWTKGTEVHHALASTAIVSQDQHIKGAIMITAGCFLWATFYILQAMTLKEYPAQLSLTTLICMMGALQGTVVTLVIENGKSGIWSMHKRTEIL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G433410`
TK1151 ID	TkA05G433410
OH-1004 ID	LXL04_021957
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G433410

位置 Chr05:108166959-108171392 (+)

描述 Similar to At2g39510: WAT1-related protein At2g39510

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g39510`	WAT1 相关蛋白 At2g39510。	暂无已核实直接文献
`At2g37460`	与WAT1相关的蛋白At2g37460。	暂无已核实直接文献
`At4g08290`	WAT1相关蛋白At4g08290。	暂无已核实直接文献
`At5g13670`	WAT1 相关蛋白 At5g13670。	暂无已核实直接文献
`At5g07050`	与 WAT1 相关的蛋白 At5g07050。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021957 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009620 response to fungus 生物过程

GO:0048316 seed development 生物过程

GO:0098712 L-glutamate import across plasma membrane 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0015186 L-glutamine transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G21890

ath:AT2G37460

ath:AT2G39510

ath:AT4G08290

ath:AT5G13670

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.558

排名 1 · TkA05G433410 · TK1151

内质网0.164

排名 2 · TkA05G433410 · TK1151

溶酶体／液泡0.148

排名 3 · TkA05G433410 · TK1151

细胞质0.069

排名 4 · TkA05G433410 · TK1151

高尔基体0.065

排名 5 · TkA05G433410 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11381DUF318519-34 aa

PF00892EamA21-157 aa

PF19360TadB_TadC_N56-67 aa

PF10639TMEM23492-157 aa

PF11381DUF3185143-155 aa

PF11381DUF3185191-202 aa

PF00892EamA192-331 aa

PF10639TMEM234289-330 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G433410	`PF11381`	DUF3185	19	34	0.33	11.7
TkA05G433410	`PF00892`	EamA	21	157	6.6e-25	88.7
TkA05G433410	`PF19360`	TadB_TadC_N	56	67	0.0051	17.3
TkA05G433410	`PF10639`	TMEM234	92	157	0.19	12.5
TkA05G433410	`PF11381`	DUF3185	143	155	0.33	11.7
TkA05G433410	`PF11381`	DUF3185	191	202	0.33	11.7
TkA05G433410	`PF00892`	EamA	192	331	6.6e-25	88.7
TkA05G433410	`PF10639`	TMEM234	289	330	0.19	12.5
TkA05G433410	`PF11381`	DUF3185	316	342	0.33	11.7
TkA05G433410	`PF19360`	TadB_TadC_N	317	360	0.0051	17.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O80638`	拟南芥	sp\|O80638\|WTR14_ARATH WAT1-related protein At2g39510	54.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q9ZUS1`	拟南芥	sp\|Q9ZUS1\|WTR13_ARATH WAT1-related protein At2g37460	54.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SUF1`	拟南芥	sp\|Q9SUF1\|WTR31_ARATH WAT1-related protein At4g08290	47.500%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FNA5`	拟南芥	sp\|Q9FNA5\|WTR39_ARATH WAT1-related protein At5g13670	46.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FL41`	拟南芥	sp\|Q9FL41\|WTR38_ARATH WAT1-related protein At5g07050	47.200%	Swiss-Prot	中等置信

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