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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G427340
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 106570726-106572943 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1501 bp · TkA05G427340|TK1151|cDNA

GGGAGGCACTTTTAAATGTGTGTCATCTCTAATTAATTGTGTCGTCTTATGATTTTTAGAATCTCTGTATATGGTCGTCTCCCACCTCCCGCATACCCTTTCAACTTCACCAAAAACTCACTCCCACTCCCGCTCGAACTGATAATCTCCATCGCTAGGGTTTCCTCCGCTGCGACGATCCTCTCCCACCTCTCGCTATAAGGTCGTCGATCCTCTCCCACCTCTCGGTAATACGAGGGTTTCCTCCGCTGCGACGACGA...

CDS

下载 CDS FASTA

678 bp · TkA05G427340|TK1151|CDS

ATGCCACCAGTGGCAGGTGATGTGGCAAACATAATTTTGGATCCGATTCTCATCTTTGTATGCAAGTTAGGAGTTAGTGGTGCAGCCATTTCACATGTTCTTTCCCCAGTAACTCTCCATTATATTTATATTTACCCAAACAACCTAGAAACATCATTTAATTATTTAATTTTCGGAACTGGACTCGCTCTGATAAAAGCCTATTGCAGGTACTTAATATCGTTAATTTTGTTAGTCAAACTGATGCAAAAAGTTGACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

225 aa · TkA05G427340|TK1151|PROTEIN

MPPVAGDVANIILDPILIFVCKLGVSGAAISHVLSPVTLHYIYIYPNNLETSFNYLIFGTGLALIKAYCRYLISLILLVKLMQKVDLLLPPNLKVLQFSRFLKNGFYLLFKVIASTICVTLAASFAARLGAKPMAAFQICLQVWMASSLLADGLAVAGQAIIATSFAEKTMRRQLQQQFECYRWELNSYKKEEENIFKEVFGEIEEEKTKILLENRPFVCTSFIF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G427340
TK1151 IDTkA05G427340
OH-1004 IDLXL04_021832
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)53.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.667 / OH-1004 63.436
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G427340
位置Chr05:106570726-106572943 (-)
描述Similar to DTX43: Protein DETOXIFICATION 43
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g08040 柠檬酸盐转运蛋白负责将柠檬酸盐装载到木质部组织中，这有助于促进铁向芽的运输。
FRD3, a member of the multidrug and toxin efflux family, controls iron deficiency responses in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.001495
FRD3 controls iron localization in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.045633
The FRD3-mediated efflux of citrate into the root vasculature is necessary for efficient iron translocation.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.097162
The FRD3 citrate effluxer promotes iron nutrition between symplastically disconnected tissues throughout Arabidopsis development.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.088088
At1g51340 柠檬酸盐转运蛋白对于铝耐受性至关重要。
Aluminum-activated citrate and malate transporters from the MATE and ALMT families function independently to confer Arabidopsis aluminum tolerance.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03696.x
A promoter-swap strategy between the AtALMT and AtMATE genes increased Arabidopsis aluminum resistance and improved carbon-use efficiency for aluminum resistance.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.04994.x
At4g38380 蛋白解毒45，叶绿体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021832 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006879 intracellular iron ion homeostasis 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010044 response to aluminum ion 生物过程
GO:0015746 citrate transport 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0030001 metal ion transport 生物过程
GO:0034220 monoatomic ion transmembrane transport 生物过程
GO:0060586 multicellular organismal-level iron ion homeostasis 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0035618 root hair 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G51340
ath:AT2G38330
ath:AT3G08040
ath:AT4G38380
mja:MJ_0709
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.324
排名 1 · TkA05G427340 · TK1151
溶酶体／液泡0.180
排名 2 · TkA05G427340 · TK1151
细胞膜0.147
排名 3 · TkA05G427340 · TK1151
高尔基体0.141
排名 4 · TkA05G427340 · TK1151
细胞质0.136
排名 5 · TkA05G427340 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11309DUF311243-58 aa
PF01554MatE56-77 aa
PF11309DUF3112100-189 aa
PF01554MatE109-171 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G427340PF11309DUF311243580.05113.8
TkA05G427340PF01554MatE56770.000321.3
TkA05G427340PF11309DUF31121001890.05113.8
TkA05G427340PF01554MatE1091710.000321.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SFB0拟南芥sp|Q9SFB0|DTX43_ARATH Protein DETOXIFICATION 4353.600%Swiss-Prot高置信
Q9SYD6拟南芥sp|Q9SYD6|DTX42_ARATH Protein DETOXIFICATION 4251.800%Swiss-Prot高置信
Q9SVE7拟南芥sp|Q9SVE7|DTX45_ARATH Protein DETOXIFICATION 45, chloroplastic41.300%Swiss-Prot低置信

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