TkA05G412150 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G412150

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 102523352-102526370 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2497 bp · TkA05G412150|TK1151|cDNA

TTTTTGTAAAACTTATTATAATCCTGTTTGTACATAAAAACATGTCCATCAATGCGCGTATATTTTTCTATTTTTCTTTTAGTTTTACAAAGACACTTTGATTAAAGTTCATTCTTCTTCTTCTTCTTCTACACTCCATCACCATGTGCATCCTCCAGTTATCCCGCCATCTTTCTCTGCAAATCCATTTGTAGAGAGAATTCACTCGCTTTCTTTTCCTTTTTCCTTCATCAAAACCCTATCACTCTCTGTACACTATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1830 bp · TkA05G412150|TK1151|CDS

ATGATAAACATGAAGAACAAGCTCAGTTTCGTTGTGATTTTCGTGTTTGGGGCTATTTTCTCTCTAGTTACAACTGAACCTGTTGAAGATAAGAAGATCTTACTCGATTTCCTCCAACAGATTCCGCATTCTTCTGCGATTAACTGGCGGATGAATTCTTCGGCTTGTAGTAACTGGACTGGTGTGACATGCGATCATCATCGTTCGGCGATAATAGCTGTTCGTTTGCCTGCGGCTAGTTTTCACGGCCCTATTCCTCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

609 aa · TkA05G412150|TK1151|PROTEIN

MINMKNKLSFVVIFVFGAIFSLVTTEPVEDKKILLDFLQQIPHSSAINWRMNSSACSNWTGVTCDHHRSAIIAVRLPAASFHGPIPPNTLSRLSKLQILSLRSNGLSGPFPSDFSNLRNLTSLHLQYNNFSGPLPLNLSVWNNLSVLNLSNNAFTGSISPSISRLTHLTVLSLANNSLSGEIPNFSTASLQILDLSNNFFTGTVPQSLERFPSSAFLGNQLAPATSSLPALSPQKKPSKLSEPAILGIVIGCSVFVLGLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G412150`
TK1151 ID	TkA05G412150
OH-1004 ID	LXL04_011852
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	69.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 96.880 / OH-1004 91.118 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G412150

位置 Chr05:102523352-102526370 (-)

描述 Similar to At4g23740: Probable inactive receptor kinase At4g23740

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g23740`	可能的非活性受体激酶 At4g23740。	暂无已核实直接文献
`At5g53320`	可能不活跃的受体激酶 At5g53320。	暂无已核实直接文献
`At5g24100`	失活的富含亮氨酸重复结构受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At5g24100。	暂无已核实直接文献
`At3g08680`	可能的非活性受体激酶 At3g08680。	暂无已核实直接文献
`At1g64210`	推定不活性的类受体蛋白激酶 At1g64210。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011852 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0042802 identical protein binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G64210

ath:AT2G26730

ath:AT4G23740

ath:AT5G24100

ath:AT5G53320

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.878

排名 1 · TkA05G412150 · TK1151

内质网0.072

排名 2 · TkA05G412150 · TK1151

细胞质0.071

排名 3 · TkA05G412150 · TK1151

细胞核0.054

排名 4 · TkA05G412150 · TK1151

溶酶体／液泡0.021

排名 5 · TkA05G412150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_229-65 aa

PF13855LRR_885-130 aa

PF23598LRR_1487-177 aa

PF23211LRR_LRWD187-122 aa

PF13516LRR_694-107 aa

PF00560LRR_195-117 aa

PF12799LRR_495-134 aa

PF24141LRR_ComC112-207 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G412150	`PF08263`	LRRNT_2	29	65	4.2e-06	27.6
TkA05G412150	`PF13855`	LRR_8	85	130	1.2e-12	48.2
TkA05G412150	`PF23598`	LRR_14	87	177	8.4e-05	22.2
TkA05G412150	`PF23211`	LRR_LRWD1	87	122	0.72	10.2
TkA05G412150	`PF13516`	LRR_6	94	107	0.0002	21.9
TkA05G412150	`PF00560`	LRR_1	95	117	6.8e-16	55.7
TkA05G412150	`PF12799`	LRR_4	95	134	4.4e-11	43.4
TkA05G412150	`PF24141`	LRR_ComC	112	207	1.6e-06	28.7
TkA05G412150	`PF13516`	LRR_6	117	131	0.0002	21.9
TkA05G412150	`PF00560`	LRR_1	119	139	6.8e-16	55.7
TkA05G412150	`PF23598`	LRR_14	137	207	8.4e-05	22.2
TkA05G412150	`PF13855`	LRR_8	142	178	1.2e-12	48.2
TkA05G412150	`PF00560`	LRR_1	143	165	6.8e-16	55.7
TkA05G412150	`PF12799`	LRR_4	143	182	4.4e-11	43.4
TkA05G412150	`PF13516`	LRR_6	143	156	0.0002	21.9
TkA05G412150	`PF23211`	LRR_LRWD1	157	212	0.72	10.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SUQ3`	拟南芥	sp\|Q9SUQ3\|Y4374_ARATH Probable inactive receptor kinase At4g23740	57.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FK10`	拟南芥	sp\|Q9FK10\|Y5332_ARATH Probable inactive receptor kinase At5g53320	56.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FL63`	拟南芥	sp\|Q9FL63\|Y5410_ARATH Inactive leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g24100	53.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q9C9Y8`	拟南芥	sp\|Q9C9Y8\|Y3868_ARATH Probable inactive receptor kinase At3g08680	47.000%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SH71`	拟南芥	sp\|Q9SH71\|Y1421_ARATH Putative inactive receptor-like protein kinase At1g64210	54.500%	Swiss-Prot	高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情