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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G409010
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 101702458-101706161 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1321 bp · TkA05G409010|TK1151|cDNA

ATATATGGGATCCCTATATATATAGCTGGATCCAGAATCTTTTACATCTTCATTTCAAAATCAAAAGGGGATATACATACACACACACACACACACTCTTCCTAATTCATTGAATCTATATCTCCAACAACTCCGCCATTAAAGATCTCAACATCGTTCACGTCTCCTAGGAAGATTAAAAAGGCTATGACCTTATCAATCTTCCAAAATTCAACAACTTAAATCGATTTTGATGGGTTGCATTTGTTCATCTGGTGTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

642 bp · TkA05G409010|TK1151|CDS

ATGGGTTGCATTTGTTCATCTGGTGTTAAGCATACCCCTGGGTACGAAGAACCCACTCTTCTCGCCGACGAAACCCCATTTACCGTGAGTGAAGTTGAGGCGTTGTATGAGCTTTTTAAGAAATTAAGCAGCTCGATTATCGACGATGGACTAATTCACAAGGAGGAATTCCAACTTGCGCTTTTCAGGAACAGAAACAGGCGAAATCTCTTTGCGGATAGGATATTCGATCTATTTGATGTGAAACGTAATGGGGTTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

213 aa · TkA05G409010|TK1151|PROTEIN

MGCICSSGVKHTPGYEEPTLLADETPFTVSEVEALYELFKKLSSSIIDDGLIHKEEFQLALFRNRNRRNLFADRIFDLFDVKRNGVIEFGEFVRSLGVFHPNAPVQDKIAFAFRLYDLRHTGFIEREELKEMVIALLHESDLVLSEEYIETIVDKTFSDADINGDGKIDEDEWKQFVAKNPSLIKNMTLHYLKDITLAFPSFVLSSEVEDSEV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G409010
TK1151 IDTkA05G409010
OH-1004 IDLXL04_029859
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)67.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.592 / OH-1004 98.592
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G409010
位置Chr05:101702458-101706161 (+)
描述Similar to CBL9: Calcineurin B-like protein 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g24270 可能作为钙传感器，参与细胞内 Na⁺、K⁺ 稳态及耐盐性的调控。
The Arabidopsis SOS2 protein kinase physically interacts with and is activated by the calcium-binding protein SOS3.2000 · DOI: 10.1073/pnas.97.7.3735
SOS3 function in plant salt tolerance requires N-myristoylation and calcium binding.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.9.1667
Regulation of SOS1, a plasma membrane Na+/H+ exchanger in Arabidopsis thaliana, by SOS2 and SOS3.2002 · DOI: 10.1073/pnas.122224699
Calcium-dependent modulation and plasma membrane targeting of the AKT2 potassium channel by the CBL4/CIPK6 calcium sensor/protein kinase complex.2011 · DOI: 10.1038/cr.2011.50
Arabidopsis SOS3 plays an important role in salt tolerance by mediating calcium-dependent microfilament reorganization.2013 · DOI: 10.1007/s00299-012-1348-3

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0291000 充当钙传感器。 暂无已核实直接文献
Os02g0291400 充当钙传感器。
Expression analysis of the calcineurin B-like gene family in rice (Oryza sativa L.) under environmental stresses.2008 · DOI: 10.1016/j.gene.2008.02.011
Os05g0534400 作为钙传感器，参与控制细胞内 Na(+) 和 K(+) 稳态和耐盐性的调节途径。
Conservation of the salt overly sensitive pathway in rice.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.092635
Os10g0564800 充当钙传感器。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029859 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G17615
ath:AT5G47100
ath:AT5G55990
dosa:Os02g0291000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.446
排名 1 · TkA05G409010 · TK1151
细胞膜0.381
排名 2 · TkA05G409010 · TK1151
细胞核0.171
排名 3 · TkA05G409010 · TK1151
溶酶体／液泡0.127
排名 4 · TkA05G409010 · TK1151
高尔基体0.098
排名 5 · TkA05G409010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13499EF-hand_733-58 aa
PF12763EH33-93 aa
PF13405EF-hand_635-61 aa
PF21857DUF691347-87 aa
PF13499EF-hand_748-94 aa
PF00036EF-hand_149-61 aa
PF13202EF-hand_549-58 aa
PF30347RSA-1_C58-133 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G409010PF13499EF-hand_733584.4e-1659.7
TkA05G409010PF12763EH33930.002518.5
TkA05G409010PF13405EF-hand_635611.2e-1556.4
TkA05G409010PF21857DUF691347870.03814.6
TkA05G409010PF13499EF-hand_748944.4e-1659.7
TkA05G409010PF00036EF-hand_149611.3e-1969.0
TkA05G409010PF13202EF-hand_549581.8e-1350.0
TkA05G409010PF30347RSA-1_C581330.002918.5
TkA05G409010PF30624EF_SSP12065936.6e-0627.4
TkA05G409010PF23564EF-hand_FSTL168961.6e-0629.2
TkA05G409010PF13833EF-hand_872942.3e-0628.0
TkA05G409010PF00036EF-hand_173941.3e-1969.0
TkA05G409010PF13202EF-hand_573941.8e-1350.0
TkA05G409010PF10591SPARC_Ca_bdg73920.005917.6
TkA05G409010PF13405EF-hand_674961.2e-1556.4
TkA05G409010PF20743DUF5580_C76890.06214.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81223拟南芥sp|O81223|CNBL4_ARATH Calcineurin B-like protein 477.000%Swiss-Prot高置信
Q3HRP0水稻sp|Q3HRP0|CNBL7_ORYSJ Calcineurin B-like protein 771.400%Swiss-Prot高置信
Q3HRN9水稻sp|Q3HRN9|CNBL8_ORYSJ Calcineurin B-like protein 870.900%Swiss-Prot高置信
Q75KU4水稻sp|Q75KU4|CNBL4_ORYSJ Calcineurin B-like protein 469.000%Swiss-Prot高置信
Q7XC27水稻sp|Q7XC27|CNBL1_ORYSJ Calcineurin B-like protein 166.700%Swiss-Prot高置信

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