TkA05G400900 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G400900

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 99735229-99739051 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2176 bp · TkA05G400900|TK1151|cDNA

TGGAAAGCCCAAAGAATCGAGACCAAGGGCAGTTTACGGGTTACCCGACTGGCGACAGTAGTCGGGGATGATGCCTGTTATTTCCATTGGTCAAGCGATTCTCCGGCGCCTCTCCACCGTCGACGACCTTTTCCGCCATGGCGACGAGGAAGCTATCGCTATCGAAGCTTCTCCGCTGCCGCTACCACACCCTTCGTACTACCCCTTCAACATCATCAATATCTAATTATACTTTCCCTCCTTCTTCAATCAAACCCCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1737 bp · TkA05G400900|TK1151|CDS

ATGGCGACGAGGAAGCTATCGCTATCGAAGCTTCTCCGCTGCCGCTACCACACCCTTCGTACTACCCCTTCAACATCATCAATATCTAATTATACTTTCCCTCCTTCTTCAATCAAACCCCAGCATTTCTCTAATTCATTCAATCGCAATTTAGCTACACATAACTTTTATGGACACGGTGAAGGCATTAGATTTTGGAGACCGTACAAGTTCTCATTAGCACCATCATCTAATCGTTCCTTTTCGACTGATAGAGAAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

578 aa · TkA05G400900|TK1151|PROTEIN

MATRKLSLSKLLRCRYHTLRTTPSTSSISNYTFPPSSIKPQHFSNSFNRNLATHNFYGHGEGIRFWRPYKFSLAPSSNRSFSTDREKATDGPVDEELLGTGFFDYNYGGGGDVGIPGEITDAVIRGEEVILPVRCLVWFLDKVHDLTGMPWWTVIIISTLALRVAILPVLLLQLQKLKINAELAPKLPPPLPPPFSGKSWIKQYKLFTEKRKELGCPTFLWILAYPSVQIPCFILGTSSVRQMALDHHSGFETGGTLWFQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G400900`
TK1151 ID	TkA05G400900
OH-1004 ID	LXL04_026347
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	25.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 42.042 / OH-1004 51.528 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G400900

位置 Chr05:99735229-99739051 (-)

描述 Similar to OXA1: Mitochondrial inner membrane protein OXA1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g65080`	可能需要用于整合膜蛋白插入叶绿体类囊体膜。	暂无已核实直接文献
`UniProt: Q0WUC5`	可能在整合膜蛋白插入线粒体内膜中必需。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026347 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009060 aerobic respiration 生物过程

GO:0032543 mitochondrial translation 生物过程

GO:0032780 negative regulation of ATP-dependent activity 生物过程

GO:0032979 protein insertion into mitochondrial inner membrane from matrix 生物过程

GO:0032981 mitochondrial respiratory chain complex I assembly 生物过程

GO:0033615 mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly 生物过程

GO:0045039 protein insertion into mitochondrial inner membrane 生物过程

GO:0051262 protein tetramerization 生物过程

GO:0051354 negative regulation of oxidoreductase activity 生物过程

GO:0065003 protein-containing complex assembly 生物过程

GO:0141164 mitochondrial protein quality control 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G46470

ath:AT5G62050

bta:520335

hsa:5018

mmu:69089

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.800

排名 1 · TkA05G400900 · TK1151

质体0.135

排名 2 · TkA05G400900 · TK1151

细胞质0.043

排名 3 · TkA05G400900 · TK1151

细胞核0.041

排名 4 · TkA05G400900 · TK1151

细胞膜0.016

排名 5 · TkA05G400900 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF0209660KD_IMP144-187 aa

PF0209660KD_IMP229-351 aa

PF07719TPR_2400-430 aa

PF13431TPR_17400-416 aa

PF24575TPR_Slam401-452 aa

PF13432TPR_16407-459 aa

PF25063ARM_TT21_C408-457 aa

PF13428TPR_14409-440 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G400900	`PF02096`	60KD_IMP	144	187	5.9e-09	36.7
TkA05G400900	`PF02096`	60KD_IMP	229	351	5.9e-09	36.7
TkA05G400900	`PF07719`	TPR_2	400	430	1.5e-08	34.8
TkA05G400900	`PF13431`	TPR_17	400	416	0.12	13.4
TkA05G400900	`PF24575`	TPR_Slam	401	452	0.3	12.2
TkA05G400900	`PF13432`	TPR_16	407	459	1.2e-06	29.5
TkA05G400900	`PF25063`	ARM_TT21_C	408	457	0.0095	16.5
TkA05G400900	`PF13428`	TPR_14	409	440	2e-06	28.6
TkA05G400900	`PF14559`	TPR_19	409	457	8.4e-06	26.7
TkA05G400900	`PF13176`	TPR_7	409	429	6.1e-05	23.5
TkA05G400900	`PF00515`	TPR_1	409	430	0.00012	22.4
TkA05G400900	`PF13181`	TPR_8	409	429	0.00015	22.3
TkA05G400900	`PF29386`	CFAP70_mid_TPR	409	483	0.001	20.0
TkA05G400900	`PF29407`	CFAP70_TPR_C	409	461	0.28	11.3
TkA05G400900	`PF29814`	TPR_Myxo	409	457	0.33	12.1
TkA05G400900	`PF13174`	TPR_6	410	429	0.00046	21.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8L718`	拟南芥	sp\|Q8L718\|ALB32_ARATH ALBINO3-like protein 2, chloroplastic	45.000%	Swiss-Prot	中等置信
`Q0WUC5`	拟南芥	sp\|Q0WUC5\|ALB33_ARATH ALBINO3-like protein 3, mitochondrial	48.100%	Swiss-Prot	中等置信

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