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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G391770
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 97371149-97372034 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

562 bp · TkA05G391770|TK1151|cDNA

ATCAGTCTCTCTAATCCTATACACCCTAAACACACACATACGGGGACATCCATGGATGTGTATATAGTCTTGCAAGAAGCAGGGATTGCCAAATACGTTATGTATTTATGTTTTGTTTTATGTTCCATTCAAAACACCGTGCTATATCTTTTTCGTTTCACGGGCATCTTTGAGTCGGATGATACCTGGCATCACAATCATCAAGATCAGTCTGATGGCCCTCCTCTTTCAGCAGTGGTAACTCGTGAATTCCTTGTGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

477 bp · TkA05G391770|TK1151|CDS

ATGGATGTGTATATAGTCTTGCAAGAAGCAGGGATTGCCAAATACGTTATGTATTTATGTTTTGTTTTATGTTCCATTCAAAACACCGTGCTATATCTTTTTCGTTTCACGGGCATCTTTGAGTCGGATGATACCTGGCATCACAATCATCAAGATCAGTCTGATGGCCCTCCTCTTTCAGCAGTGGTAACTCGTGAATTCCTTGTGGTCACAAACTATACGGACATTCACAGAATGGATTTGCCGGAAAGTTGTGCAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

158 aa · TkA05G391770|TK1151|PROTEIN

MDVYIVLQEAGIAKYVMYLCFVLCSIQNTVLYLFRFTGIFESDDTWHHNHQDQSDGPPLSAVVTREFLVVTNYTDIHRMDLPESCAVCLDEFGRDDKTRCLKNCMHIFHQGCLDSWMDHAHDTCPICRTPLLPNAYQNEYKKRFKVVTFGLTPIQGRI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G391770
TK1151 IDTkA05G391770
OH-1004 IDLXL04_006696
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 79.798
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G391770
位置Chr05:97371149-97372034 (+)
描述Similar to BRH1: Brassinosteroid-responsive RING protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g61460 可能参与油菜素甾醇信号通路并调节莲座叶的生长发育。
Characterisation of BRH1, a brassinosteroid-responsive RING-H2 gene from Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1007/s00425-001-0723-z
Overexpressed BRH1, a RING finger gene, alters rosette leaf shape in Arabidopsis thaliana.2018 · DOI: 10.1007/s11427-017-9133-8
At5g46650 RING-H2 指蛋白 ATL30。 暂无已核实直接文献
At4g25230 E3 泛素蛋白连接酶，作为 RPM1 和 RPS2 依赖的超敏反应（HR）的正调控因子，与 RIN3 相关联。
A duplicated pair of Arabidopsis RING-finger E3 ligases contribute to the RPM1- and RPS2-mediated hypersensitive response.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02525.x
At5g51450 E3泛素蛋白连接酶，作为RPM1和RPS2依赖的超敏反应（HR）正调控因子，与RIN2相关联。
A duplicated pair of Arabidopsis RING-finger E3 ligases contribute to the RPM1- and RPS2-mediated hypersensitive response.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02525.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006696 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0047484 regulation of response to osmotic stress 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1901371 regulation of leaf morphogenesis 生物过程
GO:1905421 regulation of plant organ morphogenesis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G23980
ath:AT2G01150
ath:AT3G61460
ath:AT4G11360
ath:AT4G11370
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.305
排名 1 · TkA05G391770 · TK1151
内质网0.269
排名 2 · TkA05G391770 · TK1151
细胞质0.250
排名 3 · TkA05G391770 · TK1151
高尔基体0.210
排名 4 · TkA05G391770 · TK1151
细胞膜0.191
排名 5 · TkA05G391770 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12861zf-ANAPC1176-129 aa
PF12678zf-rbx177-128 aa
PF22795DUF4796_N79-91 aa
PF21349RUBY_RBDX80-88 aa
PF13920zf-C3HC4_383-130 aa
PF13639zf-RING_284-128 aa
PF17120zf-RING_1684-125 aa
PF22908PHD_NSD84-123 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G391770PF12861zf-ANAPC11761290.0001122.9
TkA05G391770PF12678zf-rbx1771282.4e-0525.2
TkA05G391770PF22795DUF4796_N79910.03614.6
TkA05G391770PF21349RUBY_RBDX80880.04813.8
TkA05G391770PF13920zf-C3HC4_3831300.0003421.1
TkA05G391770PF13639zf-RING_2841282.7e-1247.4
TkA05G391770PF17120zf-RING_16841250.004617.3
TkA05G391770PF22908PHD_NSD841230.2212.5
TkA05G391770PF17123zf-RING_11851131e-0732.2
TkA05G391770PF14634zf-RING_5851295.5e-0730.2
TkA05G391770PF00097zf-C3HC4851272.5e-0628.0
TkA05G391770PF13923zf-C3HC4_2851273.1e-0627.6
TkA05G391770PF13445zf-RING_UBOX851190.0001422.5
TkA05G391770PF14835zf-RING_6851300.007316.9
TkA05G391770PF23555zf-RING_Vps41851270.05813.7
TkA05G391770PF14447Prok-RING_4851290.08613.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XF92拟南芥sp|Q9XF92|BRH1_ARATH Brassinosteroid-responsive RING protein 143.300%Swiss-Prot中等置信
Q9FIR0拟南芥sp|Q9FIR0|ATL30_ARATH RING-H2 finger protein ATL3047.300%Swiss-Prot低置信
Q8VYC8拟南芥sp|Q8VYC8|RIN2_ARATH E3 ubiquitin protein ligase RIN234.400%Swiss-Prot低置信
Q8W4Q5拟南芥sp|Q8W4Q5|RIN3_ARATH E3 ubiquitin protein ligase RIN333.300%Swiss-Prot低置信

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