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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G377650
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 93787213-93791636 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2385 bp · TkA05G377650|TK1151|cDNA

AAGATTCGATTCAGACTATAACCAAATAATTCATGTAGCGACAGAAACGATATTTGCCCAACACTCAAATAAGATAACATTGCTATTATATATATACACTCGTTGTAACCACCCATTTCGAATTTGGAGCAAGAATTCCAAACAAAATCTAACATTTTCTTTGATGGGTTCTCATGATTCACTTTGATACGTAGAATCTCTTATCGGAACTGTTGATTAGATATTGATACGATACGTCACTTGAACCTCTGTAATCTCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1857 bp · TkA05G377650|TK1151|CDS

ATGGTGTCAGAGAGTTTGAGAAGAGACGATCCATTGGCAAATGGCGAGCAGAATGATCTCGAGCTTGGAGATGCAGTGCCGGCTGCGAATGTGAGTTACGTCAGAGTTCTGTCTCTGGCAAAACCAGAGGCAGGAAGATTGATCATTGGTACTATCGCTTTGTTGATTGCATCCACATCAAGTATTCTGATTCCAAGATTTGGTGGGACAATAATTGATATTGTATCTGGAGATCTCCAAACACCTGAACAAAAAAGCCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

618 aa · TkA05G377650|TK1151|PROTEIN

MVSESLRRDDPLANGEQNDLELGDAVPAANVSYVRVLSLAKPEAGRLIIGTIALLIASTSSILIPRFGGTIIDIVSGDLQTPEQKSQAVSSVNRTILGILLIVIIGSICTATRAWLFSSASERIVAALRKNLFTHLINQEIAFFDVTRTGELLSRLSEDTQIIKNAATSNVSEILRNLSTAFIGLGFMFATSWKLTLLALVVVPGISIAVRQVGRYLREVSHKTQTAAAVASSIAEETFGAVRTVRAFAQESYETSRYSE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G377650
TK1151 IDTkA05G377650
OH-1004 IDLXL04_021286
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.353 / OH-1004 96.389
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G377650
位置Chr05:93787213-93791636 (-)
描述Similar to ABCB25: ABC transporter B family member 25
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g39040 可能涉及内化铝的重新分配。
Arabidopsis ALS1 encodes a root tip and stele localized half type ABC transporter required for root growth in an aluminum toxic environment.2007 · DOI: 10.1007/s00425-006-0452-4

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0755100 金属转运蛋白参与将铝封存在液泡中，这是铝的细胞解毒所必需的。
A tonoplast-localized half-size ABC transporter is required for internal detoxification of aluminum in rice.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04837.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021286 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006783 heme biosynthetic process 生物过程
GO:0006839 mitochondrial transport 生物过程
GO:0006935 chemotaxis 生物过程
GO:0006972 hyperosmotic response 生物过程
GO:0010044 response to aluminum ion 生物过程
GO:0034514 mitochondrial unfolded protein response 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0070455 positive regulation of heme biosynthetic process 生物过程
GO:0090374 oligopeptide export from mitochondrion 生物过程
GO:0140982 detoxification of aluminum ion 生物过程
GO:0170037 export from the mitochondrion 生物过程
GO:1902602 aluminum ion transmembrane transport 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G39040
ddi:DDB_G0293416
dosa:Os03g0755100
hsa:23456
mmu:56199
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.383
排名 1 · TkA05G377650 · TK1151
细胞膜0.208
排名 2 · TkA05G377650 · TK1151
细胞质0.164
排名 3 · TkA05G377650 · TK1151
内质网0.158
排名 4 · TkA05G377650 · TK1151
高尔基体0.106
排名 5 · TkA05G377650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00664ABC_membrane47-324 aa
PF19865DUF633896-119 aa
PF02463SMC_N146-176 aa
PF19865DUF6338189-238 aa
PF00004AAA223-235 aa
PF00005ABC_tran390-540 aa
PF00270DEAD398-557 aa
PF13521AAA_28402-423 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G377650PF00664ABC_membrane473242.3e-62211.9
TkA05G377650PF19865DUF6338961192.78.2
TkA05G377650PF02463SMC_N1461765.3e-0626.7
TkA05G377650PF19865DUF63381892382.78.2
TkA05G377650PF00004AAA2232350.01316.7
TkA05G377650PF00005ABC_tran3905404.8e-35121.8
TkA05G377650PF00270DEAD3985570.008116.6
TkA05G377650PF13521AAA_284024230.1413.0
TkA05G377650PF13401AAA_224035420.02915.4
TkA05G377650PF07728AAA_54034250.08213.6
TkA05G377650PF13175AAA_154035050.2511.6
TkA05G377650PF09818ABC_ATPase4044220.001818.1
TkA05G377650PF00004AAA4045610.01316.7
TkA05G377650PF02463SMC_N4695835.3e-0626.7
TkA05G377650PF09818ABC_ATPase4845800.001818.1
TkA05G377650PF07728AAA_55205430.08213.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WML0拟南芥sp|Q0WML0|AB27B_ARATH ABC transporter B family member 2774.300%Swiss-Prot高置信
Q9FNU2水稻sp|Q9FNU2|AB25B_ORYSJ ABC transporter B family member 2576.100%Swiss-Prot高置信

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