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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA05G367690
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 91303217-91305141 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

745 bp · TkA05G367690|TK1151|cDNA

GTTTGGGTCAATTATAATCAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCCAGTTTTAACAAAAAAGAAAGTTAAATTAGGCTATGCAAATCTTTTTCTATCCAATTATCGGAGGGATCAAGAAGGTAGTGCCAGATTAGAATGGAAGGCGTGCACGGATTATTGAAGTTGCGAGTGAAAAGAGGGATCAATCTCGCTGTTCGTGACGCCAAAAGCAGCGATCCTTATCTCGTTGCGACCTTGGATGGCCAGGCTGT...

507 bp · TkA05G367690|TK1151|CDS

ATGGAAGGCGTGCACGGATTATTGAAGTTGCGAGTGAAAAGAGGGATCAATCTCGCTGTTCGTGACGCCAAAAGCAGCGATCCTTATCTCGTTGCGACCTTGGATGGCCAGAAAACAAAGACTAGGGTTATCAAGGGGAACTGCAATCCTGTGTGGAATGATGAATTGACTCTCACAATGAGAGACCCCATCAATCCAGTTAGTATTGCTGTGTACGACAGGGACAGGTTTAGCAATGACGATAGTATGGGGGTGGCAGA...

168 aa · TkA05G367690|TK1151|PROTEIN

MEGVHGLLKLRVKRGINLAVRDAKSSDPYLVATLDGQKTKTRVIKGNCNPVWNDELTLTMRDPINPVSIAVYDRDRFSNDDSMGVADIDVKPYIECLRKGLDLKKIPNGTTLDRIQPKKNNYLSDESCIVCEDGKIVQDMVVRLREVECGEVVLQIELIPVAGRKLHV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G367690
TK1151 IDTkA05G367690
OH-1004 IDLXL04_021220
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G367690
位置Chr05:91303217-91305141 (-)
描述Similar to CAR10: Protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g01540 刺激Obg样ATP酶的GTP酶/ATP酶活性(通过相似性推测)。 暂无已核实直接文献
At1g70790 刺激Obg样ATP酶的GTP酶/ATP酶活性(通过相似性推测)。
At1g70810 刺激Obg样ATP酶的GTP酶/ATP酶活性(通过相似性推测)。 暂无已核实直接文献
At1g23140 刺激Obg样ATP酶的GTP酶/ATP酶活性(通过相似性推测)。 暂无已核实直接文献
At3g17980 介导 PYR/PYL/RCAR 脱落酸(ABA)受体与质膜的短暂钙依赖性相互作用,从而调控 ABA 敏感性。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_021220 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0043547 positive regulation of GTPase activity 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005096 GTPase activator activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005543 phospholipid binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G23140
ath:AT1G70790
ath:AT1G70810
ath:AT2G01540
ath:AT5G37740
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.423
排名 1 · TkA05G367690 · TK1151
细胞膜0.399
排名 2 · TkA05G367690 · TK1151
细胞核0.287
排名 3 · TkA05G367690 · TK1151
内质网0.073
排名 4 · TkA05G367690 · TK1151
高尔基体0.054
排名 5 · TkA05G367690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00168C27-92 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G367690PF00168C27921.4e-2074.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZVF1拟南芥sp|Q9ZVF1|CAR10_ARATH Protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 1053.300%Swiss-Prot高置信
Q9S7J9拟南芥sp|Q9S7J9|CAR9_ARATH Protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 954.600%Swiss-Prot高置信
Q9SSL1拟南芥sp|Q9SSL1|CAR7_ARATH Protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 752.100%Swiss-Prot高置信
O49303拟南芥sp|O49303|CAR8_ARATH Protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 850.300%Swiss-Prot高置信
Q9LVH4拟南芥sp|Q9LVH4|CAR4_ARATH Protein C2-DOMAIN ABA-RELATED 450.900%Swiss-Prot高置信

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