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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G340150
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 84229332-84232800 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2194 bp · TkA05G340150|TK1151|cDNA

CAAATTTACATTACATAAACCATAACCCTTATTTGGCTCGTCCTAATCTGTTAAACAAATAATTGCATCTTTCATTTTCTATTTTTCATTTTATATTTCTATTTTCCTTTTTCGTGATTCACCTTCGCTGTGGCCTCCCGCAATCTCCTCTTTCCACTCTTCGTACATCTGAGGGGTATCTCTTAGCCTTCACAACTTCATAGATATTTTCAGAAAAGAGGTTCTTCTCCACTCAACTTAGTCCACACCTGTACATAGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1194 bp · TkA05G340150|TK1151|CDS

ATGGAGCAACAACCAATGGATACTTCTATTGAACAATCTATCAATAATCGGTACTCATTTTGGGTCCGAGAAGCTCTTGACGAACTCCCCCATAGTTTCACCATAACCGACCCGTCAATTTCGGGTCACCCGATTGTTTTTGCTTCAAGGGAGTTCTTGAAAATGTCTGGCTATTCAAGAGAGGAGGTGATTGGAAAGAATGGACGGATGTTTCAAGGGATTAGGACTAATAGGAGATCAGTAATGGAGATTAGGGAAGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

397 aa · TkA05G340150|TK1151|PROTEIN

MEQQPMDTSIEQSINNRYSFWVREALDELPHSFTITDPSISGHPIVFASREFLKMSGYSREEVIGKNGRMFQGIRTNRRSVMEIREAIREERSIQVSLLNYHKNGTPFWILFHMFPVFSKEDGRVIHFVGVQVPIMPKPRRSGSEFSRIEVNLYENGAGVLGFCRREVCSDTVAELGRISNLDQVLSADTELTDTACKASDLEKRRANTAMSNILSMLTHYSESMGRLVSDKRCCPHNMSRVGASLNISLGRIKQSFVLT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G340150
TK1151 IDTkA05G340150
OH-1004 IDLXL04_021009
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G340150
位置Chr05:84229332-84232800 (+)
描述Similar to TLP1: Protein TWIN LOV 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g02710 蛋白 TWIN LOV 1。 暂无已核实直接文献
At5g58140 在光诱导运动的信号传导通路中，作为蓝光光受体的蛋白激酶。
Arabidopsis NPL1: a phototropin homolog controlling the chloroplast high-light avoidance response.2001 · DOI: 10.1126/science.291.5511.2138
Arabidopsis nph1 and npl1: blue light receptors that mediate both phototropism and chloroplast relocation.2001 · DOI: 10.1073/pnas.101137598
Phot1 and phot2 mediate blue light-induced transient increases in cytosolic Ca2+ differently in Arabidopsis leaves.2003 · DOI: 10.1073/pnas.1336802100
A transgene encoding a blue-light receptor, phot1, restores blue-light responses in the Arabidopsis phot1 phot2 double mutant.2004 · DOI: 10.1093/jxb/erh044
Functional analysis of each blue light receptor, cry1, cry2, phot1, and phot2, by using combinatorial multiple mutants in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0305984101
RPT2 is a signal transducer involved in phototropic response and stomatal opening by association with phototropin 1 in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019901
Biochemical characterization of plasma membrane H+-ATPase activation in guard cell protoplasts of Arabidopsis thaliana in response to blue light.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci104
An ATP-Binding Cassette Transporter, ABCB19, Regulates Leaf Position and Morphology during Phototropin1-Mediated Blue Light Responses.2020 · DOI: 10.1104/pp.20.00223
At3g45780 蛋白激酶，在光诱导运动的信号转导途径中作为蓝光（BL）光受体。
RPT2. A signal transducer of the phototropic response in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.2.225
Unexpected roles for cryptochrome 2 and phototropin revealed by high-resolution analysis of blue light-mediated hypocotyl growth inhibition.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01038.x
Phototropin 1 is required for high-fluence blue-light-mediated mRNA destabilization.2003 · DOI: 10.1023/a:1022393406204
Phot1 and phot2 mediate blue light-induced transient increases in cytosolic Ca2+ differently in Arabidopsis leaves.2003 · DOI: 10.1073/pnas.1336802100
A transgene encoding a blue-light receptor, phot1, restores blue-light responses in the Arabidopsis phot1 phot2 double mutant.2004 · DOI: 10.1093/jxb/erh044
Functional analysis of each blue light receptor, cry1, cry2, phot1, and phot2, by using combinatorial multiple mutants in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0305984101
RPT2 is a signal transducer involved in phototropic response and stomatal opening by association with phototropin 1 in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019901
Biochemical characterization of plasma membrane H+-ATPase activation in guard cell protoplasts of Arabidopsis thaliana in response to blue light.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci104
PHYTOCHROME KINASE SUBSTRATE 1 is a phototropin 1 binding protein required for phototropism.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0603799103
In vivo phosphorylation site mapping and functional characterization of Arabidopsis phototropin 1.2008 · DOI: 10.1093/mp/ssm017
An ATP-Binding Cassette Transporter, ABCB19, Regulates Leaf Position and Morphology during Phototropin1-Mediated Blue Light Responses.2020 · DOI: 10.1104/pp.20.00223

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0304200 蛋白激酶，在光向性反应的信号转导通路中作为蓝光光受体。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021009 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009638 phototropism 生物过程
GO:0009639 response to red or far red light 生物过程
GO:0009785 blue light signaling pathway 生物过程
GO:0009902 chloroplast relocation 生物过程
GO:0009903 chloroplast avoidance movement 生物过程
GO:0009904 chloroplast accumulation movement 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010155 regulation of proton transport 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G02710
ath:AT3G45780
ath:AT5G58140
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.376
排名 1 · TkA05G340150 · TK1151
细胞核0.261
排名 2 · TkA05G340150 · TK1151
细胞膜0.188
排名 3 · TkA05G340150 · TK1151
线粒体0.111
排名 4 · TkA05G340150 · TK1151
内质网0.081
排名 5 · TkA05G340150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13426PAS_942-132 aa
PF13188PAS_844-85 aa
PF00989PAS45-131 aa
PF08447PAS_345-131 aa
PF08448PAS_445-131 aa
PF24990PAS_1345-72 aa
PF04545Sigma70_r4236-255 aa
PF13426PAS_9256-358 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G340150PF13426PAS_9421322.4e-40137.7
TkA05G340150PF13188PAS_844850.0001222.5
TkA05G340150PF00989PAS451314.8e-1865.9
TkA05G340150PF08447PAS_3451315.8e-1762.4
TkA05G340150PF08448PAS_4451311.7e-1041.8
TkA05G340150PF24990PAS_1345720.1613.0
TkA05G340150PF04545Sigma70_r42362550.1312.5
TkA05G340150PF13426PAS_92563582.4e-40137.7
TkA05G340150PF08448PAS_42683531.7e-1041.8
TkA05G340150PF00989PAS2693564.8e-1865.9
TkA05G340150PF08447PAS_32693525.8e-1762.4
TkA05G340150PF13188PAS_82692890.0001222.5
TkA05G340150PF24990PAS_132692920.1613.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64511拟南芥sp|O64511|TLOV1_ARATH Protein TWIN LOV 157.800%Swiss-Prot高置信
P93025拟南芥sp|P93025|PHOT2_ARATH Phototropin-232.700%Swiss-Prot中等置信
O48963拟南芥sp|O48963|PHOT1_ARATH Phototropin-130.700%Swiss-Prot中等置信
Q9ST27水稻sp|Q9ST27|PHOT2_ORYSJ Phototropin-230.900%Swiss-Prot中等置信

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