TkA05G327050 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G327050

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 80576858-80579701 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1504 bp · TkA05G327050|TK1151|cDNA

ACTTGGCATCCAACTATCGGAATGTGAACACTAAATTAGTACAAGGACCATTAATGCATATAACTTAAACTTTTGCCGCATAAGTTTGTTCCTTTACATTCTAACCAGCAACGACGAGAAACCAGAATGATCTATCACAACTCTGAACTCTCTCGATAAATTGATAATCTCTGCTGGTCCATAAGCAGACATTAAAATAGTCCTCGAAAGCACCACCACTATGAAGGCTTGGCAGTATCACGAATATGGCAGTGTTGATG...

CDS

下载 CDS FASTA

939 bp · TkA05G327050|TK1151|CDS

ATGAAGGCTTGGCAGTATCACGAATATGGCAGTGTTGATGTCTTGAAACTGGCTAGCGATGTACCGGTTCCTGAAATCAATGATGATCAGGTATTGGTTAAGGTTGTTGCTGCTGCTCTTAACCCTGTCGATTACAGAAGAAGGTTTGGACAAATGAAGGCTGCCGATCCACCTCTTCCGGTTATTCCAGGATTAGACGTCGCCGGAGTAGTTGTTAAGATCGGAAGCAAGGTAAAACACCTGAAAGAAGGAGATGAAGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

312 aa · TkA05G327050|TK1151|PROTEIN

MKAWQYHEYGSVDVLKLASDVPVPEINDDQVLVKVVAAALNPVDYRRRFGQMKAADPPLPVIPGLDVAGVVVKIGSKVKHLKEGDEVYGDVNEKALDKPTQLGTLAEYVPVDEKLLALKPKNLDFIEAAALPLAIETAYEGLEKAKFTEGQSILVLNGAGGVGSFAIQLAKHVFGASKVAATSSTKKLELLRSLGADLAIDYTKEKFENLPDKYDVVYDAIGQPEEAVKAVKEGGCAVSITDFEKPIPPPGFGFVLTSNG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G327050`
TK1151 ID	TkA05G327050
OH-1004 ID	LXL04_020894
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G327050

位置 Chr05:80576858-80579701 (-)

描述 Similar to EO: 2-methylene-furan-3-one reductase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g23740`	减少短链不饱和羰基中的双键。	NADPH-dependent reductases involved in the detoxification of reactive carbonyls in plants.2011 · DOI: 10.1074/jbc.m110.202226

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020894 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分

GO:0009579 thylakoid 细胞组分

GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分

GO:0010319 stromule 细胞组分

GO:0048046 apoplast 细胞组分

GO:0008270 zinc ion binding 分子功能

GO:0035671 enone reductase activity 分子功能

GO:0035798 2-alkenal reductase (NADPH) activity 分子功能

GO:0102978 furaneol oxidoreductase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G23740

sly:101250690

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.571

排名 1 · TkA05G327050 · TK1151

细胞核0.150

排名 2 · TkA05G327050 · TK1151

线粒体0.150

排名 3 · TkA05G327050 · TK1151

过氧化物酶体0.107

排名 4 · TkA05G327050 · TK1151

内质网0.095

排名 5 · TkA05G327050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16884ADH_N_220-91 aa

PF08240ADH_N28-120 aa

PF00107ADH_zinc_N91-142 aa

PF16912Glu_dehyd_C134-232 aa

PF02254TrkA_N139-200 aa

PF13649Methyltransf_25155-219 aa

PF00107ADH_zinc_N161-246 aa

PF13602ADH_zinc_N_2194-308 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G327050	`PF16884`	ADH_N_2	20	91	0.0016	19.0
TkA05G327050	`PF08240`	ADH_N	28	120	2.6e-17	63.7
TkA05G327050	`PF00107`	ADH_zinc_N	91	142	1.3e-14	55.0
TkA05G327050	`PF16912`	Glu_dehyd_C	134	232	8.7e-05	22.8
TkA05G327050	`PF02254`	TrkA_N	139	200	0.2	12.7
TkA05G327050	`PF13649`	Methyltransf_25	155	219	0.12	13.8
TkA05G327050	`PF00107`	ADH_zinc_N	161	246	1.3e-14	55.0
TkA05G327050	`PF13602`	ADH_zinc_N_2	194	308	1e-19	72.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZUC1`	拟南芥	sp\|Q9ZUC1\|AOR_ARATH NADPH-dependent alkenal/one oxidoreductase, chloroplastic	70.200%	Swiss-Prot	高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情