基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA05G322710
当前版本: TK1151
染色体: Chr05
坐标: 79562092-79566780
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1746 bp · TkA05G322710|TK1151|cDNA
TTTTAAGCCAAGCCAGGTACACTATACATTCATTCTTAGCACTAATCTATACATATAAATTAATATCTCATCTCTTGTTTTTCATTTATACAAATCCATCACATTTCTGAAACTAACAAAACCATGGGCAAAATCGTCTTTCTTTCTATTCTTCTTGTTTTGTCATTGGTTCGCGGGACTATTGGAAATAGTTTATCTGACACCTTTTATGGTTTTGATGAAGTTGAAAGTTTGGATTTTGAAGATGATGAATTAGAGTT...
CDS
下载 CDS FASTA1371 bp · TkA05G322710|TK1151|CDS
ATGGGCAAAATCGTCTTTCTTTCTATTCTTCTTGTTTTGTCATTGGTTCGCGGGACTATTGGAAATAGTTTATCTGACACCTTTTATGGTTTTGATGAAGTTGAAAGTTTGGATTTTGAAGATGATGAATTAGAGTTGTTGGAGTTGCCTTCATGGTCAAGTCAACATGGTAGCAAGATTTTGGTCAATGTGGATAGCTTTGGTGCATCTGGAGATGGAGTTTCTGATGACACAAAGGCGTTTGAAAATGCATGGACAAA...
456 aa · TkA05G322710|TK1151|PROTEIN
MGKIVFLSILLVLSLVRGTIGNSLSDTFYGFDEVESLDFEDDELELLELPSWSSQHGSKILVNVDSFGASGDGVSDDTKAFENAWTKACSTAKSVLLVPPGRTYLVNATRFKGPCATKLIVQIDGTIIAPDEPMNWDPKNPRNWLVFSNLTGVTFQGHGVIDGSGKKWWAASCKKNKTNPCVGAPSAFTIDQSSSIKVSGLTFQNSQQMNFVISRCDSVRIYSVVVSSPEDSPNTDGIHLTGSTNVVLQNSKIGTGDDCV...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA05G322710 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA05G322710 |
| OH-1004 ID | LXL04_020876 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 100.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 100.000覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA05G322710 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:79562092-79566780 (-) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to At1g80170: Probable polygalacturonase At1g80170 | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0005975 carbohydrate metabolic process 生物过程 GO:0009830 cell wall modification involved in abscission 生物过程 GO:0009835 fruit ripening 生物过程 GO:0009901 anther dehiscence 生物过程 GO:0010047 fruit dehiscence 生物过程 GO:0045490 pectin catabolic process 生物过程 GO:0048235 pollen sperm cell differentiation 生物过程 GO:0071555 cell wall organization 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0004650 polygalacturonase activity 分子功能 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G80170 ath:AT3G07970 ath:AT3G57510 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞外0.587
溶酶体／液泡0.122
细胞膜0.105
细胞质0.096
内质网0.083
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF12708Pect-lyase_RHGA_epim62-108 aaPF12218End_N_terminal69-91 aaPF00295Glyco_hydro_2890-417 aaPF05048NosD168-283 aaPF13229Beta_helix188-273 aaPF12708Pect-lyase_RHGA_epim191-285 aaPF12708Pect-lyase_RHGA_epim327-399 aaPF13229Beta_helix386-400 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA05G322710 | PF12708 | Pect-lyase_RHGA_epim | 62 | 108 | 1.2e-08 | 35.8 |
| TkA05G322710 | PF12218 | End_N_terminal | 69 | 91 | 0.15 | 12.5 |
| TkA05G322710 | PF00295 | Glyco_hydro_28 | 90 | 417 | 3.8e-90 | 303.0 |
| TkA05G322710 | PF05048 | NosD | 168 | 283 | 0.012 | 15.8 |
| TkA05G322710 | PF13229 | Beta_helix | 188 | 273 | 0.00022 | 21.5 |
| TkA05G322710 | PF12708 | Pect-lyase_RHGA_epim | 191 | 285 | 1.2e-08 | 35.8 |
| TkA05G322710 | PF12708 | Pect-lyase_RHGA_epim | 327 | 399 | 1.2e-08 | 35.8 |
| TkA05G322710 | PF13229 | Beta_helix | 386 | 400 | 0.00022 | 21.5 |
| TkA05G322710 | PF05048 | NosD | 419 | 419 | 0.012 | 15.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。