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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G318960
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 78717718-78718311 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

594 bp · TkA05G318960|TK1151|cDNA

ATGGCAGTAAGCAACAACATAATAGCCACCATAAACTTCATAGCACTCATGTGTTCAATCCCAATAATTGTCACCGGCATCTGGCTCGCTTCCAAACCCGACAACCAATGCATCCGCTCCCTCCCCTGGCCGATCATCTTCCTCGGGGTTCTCTTCCTCCTCCTCGCCCTCACAGGCTTCATCGGAGATCACTGGAACAACCAGGTGTTATTGTCCTTTTACCTCTTCTGCAACGCCGCACTCATAGTCACCGGAATCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

594 bp · TkA05G318960|TK1151|CDS

ATGGCAGTAAGCAACAACATAATAGCCACCATAAACTTCATAGCACTCATGTGTTCAATCCCAATAATTGTCACCGGCATCTGGCTCGCTTCCAAACCCGACAACCAATGCATCCGCTCCCTCCCCTGGCCGATCATCTTCCTCGGGGTTCTCTTCCTCCTCCTCGCCCTCACAGGCTTCATCGGAGATCACTGGAACAACCAGGTGTTATTGTCCTTTTACCTCTTCTGCAACGCCGCACTCATAGTCACCGGAATCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

197 aa · TkA05G318960|TK1151|PROTEIN

MAVSNNIIATINFIALMCSIPIIVTGIWLASKPDNQCIRSLPWPIIFLGVLFLLLALTGFIGDHWNNQVLLSFYLFCNAALIVTGIILLILAFIVVHPSGEYSVPGREYDEYRYMGYSEWLREHITDPENWRSIRACLASSSICTKMVRDSYSAPSGVLRRPYLLSPVGMLQAAEGVRVPVREPDNVDKSDEPGRRR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G318960
TK1151 IDTkA05G318960
OH-1004 IDLXL04_014663
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G318960
位置Chr05:78717718-78718311 (-)
描述Similar to TET2: Tetraspanin-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g19580 可能参与细胞分化的调控。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014663 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006890 retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0035265 organ growth 生物过程
GO:0050829 defense response to Gram-negative bacterium 生物过程
GO:0090110 COPII-coated vesicle cargo loading 生物过程
GO:0099039 sphingolipid translocation 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G19580
ath:AT2G23810
ath:AT3G12090
ath:AT3G45600
ath:AT4G30430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.418
排名 1 · TkA05G318960 · TK1151
溶酶体／液泡0.267
排名 2 · TkA05G318960 · TK1151
细胞质0.209
排名 3 · TkA05G318960 · TK1151
内质网0.150
排名 4 · TkA05G318960 · TK1151
高尔基体0.104
排名 5 · TkA05G318960 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00335Tetraspanin6-139 aa
PF18967PycTM7-57 aa
PF20794bPH_710-58 aa
PF04103CD2016-121 aa
PF01757Acyl_transf_316-95 aa
PF11384DUF318817-29 aa
PF17555TssN20-91 aa
PF20990DUF2207_C46-122 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G318960PF00335Tetraspanin61391.1e-1868.5
TkA05G318960PF18967PycTM7570.2112.1
TkA05G318960PF20794bPH_710581.29.4
TkA05G318960PF04103CD20161216.4e-0523.8
TkA05G318960PF01757Acyl_transf_316950.001818.1
TkA05G318960PF11384DUF318817299.56.8
TkA05G318960PF17555TssN20910.1312.4
TkA05G318960PF20990DUF2207_C461220.08213.3
TkA05G318960PF06653Claudin_3471210.3111.7
TkA05G318960PF18967PycTM481440.2112.1
TkA05G318960PF11384DUF318848579.56.8
TkA05G318960PF20794bPH_779931.29.4
TkA05G318960PF11384DUF318881969.56.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZUN5拟南芥sp|Q9ZUN5|TET2_ARATH Tetraspanin-250.000%Swiss-Prot高置信

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