RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G317610
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 78381086-78387776 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2237 bp · TkA05G317610|TK1151|cDNA

ACGGAGGTTTTGTATATGGAAACCGACTTCAGCGTTCTATATCAATTCAGACTTCAGACTTCAGACGACCACAAATTGAAGACGAAACGAAAATTTTATCCACTTGTCTTAAAATTCCCGATTCAAATGTAGTAAAAGATATACAACAAGATGGACAAATCATCATTACTCATTGCTTCAATCACATTTCTACTACTAATATCAAGATCAAACGGCGATGCAAGAACCCAAATCATCCAAATGTTTTGTGACAAAGAAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1953 bp · TkA05G317610|TK1151|CDS

ATGGACAAATCATCATTACTCATTGCTTCAATCACATTTCTACTACTAATATCAAGATCAAACGGCGATGCAAGAACCCAAATCATCCAAATGTTTTGTGACAAAGAAGTCCACAACAATGACACTCTATTCATCCAAAATTATGTCCAAGCAATGGAAGTAGTCAGCACCCAAATGCAAACTACACACAACACAACCGTAGAAATAGGCACGGGACCCAACAAGAATTACGTGCTCACCCAATGCTACAACGATCTTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

650 aa · TkA05G317610|TK1151|PROTEIN

MDKSSLLIASITFLLLISRSNGDARTQIIQMFCDKEVHNNDTLFIQNYVQAMEVVSTQMQTTHNTTVEIGTGPNKNYVLTQCYNDLSSEDCMLCYAQTRTGFPACYPSNGGRIYLDGCFMRLQNYSFYKEYTGPNDTIVCGNIMRESVQFQDSTRQAVLNVVADASSNNEYFGRGEVVVAGGSGGNKSVYVMAECWRTLSPRDCRLCLENASAVISKCLPWSEGRALNTGCFMRYSNTDFLNPISGTSGSRNRGKTITIL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G317610
TK1151 IDTkA05G317610
OH-1004 IDLXL04_020850
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)78.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G317610
位置Chr05:78381086-78387776 (+)
描述Similar to CRK2: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g70520 富半胱氨酸受体样蛋白激酶2。 暂无已核实直接文献
At5g40380 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 42。 暂无已核实直接文献
At4g28670 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 46。 暂无已核实直接文献
At1g70530 富半胱氨酸受体样蛋白激酶3。 暂无已核实直接文献
At1g19090 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020850 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0052545 callose localization 生物过程
GO:0072593 reactive oxygen species metabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19090
ath:AT1G70520
ath:AT1G70530
ath:AT4G28670
ath:AT5G40380
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.888
排名 1 · TkA05G317610 · TK1151
细胞质0.072
排名 2 · TkA05G317610 · TK1151
内质网0.071
排名 3 · TkA05G317610 · TK1151
细胞核0.040
排名 4 · TkA05G317610 · TK1151
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · TkA05G317610 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01657Stress-antifung33-125 aa
PF17667Pkinase_fungal133-203 aa
PF01657Stress-antifung145-237 aa
PF14575EphA2_TM259-300 aa
PF27898C3orf18_N259-284 aa
PF21314TM_ErbB1260-290 aa
PF00069Pkinase325-595 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr326-539 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G317610PF01657Stress-antifung331253.6e-2382.8
TkA05G317610PF17667Pkinase_fungal1332030.0002920.4
TkA05G317610PF01657Stress-antifung1452373.6e-2382.8
TkA05G317610PF14575EphA2_TM2593000.114.1
TkA05G317610PF27898C3orf18_N2592840.6710.7
TkA05G317610PF21314TM_ErbB12602905.57.5
TkA05G317610PF00069Pkinase3255956.6e-45154.3
TkA05G317610PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3265393.9e-45154.9
TkA05G317610PF03109ABC13313547.2e-0522.8
TkA05G317610PF03109ABC14314757.2e-0522.8
TkA05G317610PF17667Pkinase_fungal4405100.0002920.4
TkA05G317610PF03109ABC15115747.2e-0522.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAL3拟南芥sp|Q9CAL3|CRK2_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 259.700%Swiss-Prot高置信
Q9FNE1拟南芥sp|Q9FNE1|CRK42_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 4242.200%Swiss-Prot中等置信
Q9M0G5拟南芥sp|Q9M0G5|CRK46_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 4640.100%Swiss-Prot中等置信
Q9CAL2拟南芥sp|Q9CAL2|CRK3_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 340.600%Swiss-Prot中等置信
Q9LMB9拟南芥sp|Q9LMB9|CRK1_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 142.000%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看