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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G314140
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 77499100-77503203 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3485 bp · TkA05G314140|TK1151|cDNA

AAACCATTAAATTCCTTACTCGATCATACAAAACACTACCCTAATTCTGTGATTTTATATCTTCCAACTTTATACAAATTGTCATAAATCAACCAAAATGTCATGCAGCTGCCCAACTGTCTAGCTCACCTCTCATCAGTCGTCTCGAGTATCATAGTCGGCTTCATACTTTCATGGCGACTATCCATCGCTTCCCTTCCTTTTGCGCTTCTCTTCGTTGTTCCCGTTTTAGGCATTGGTGTGATACTAAAAGGACTAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

3306 bp · TkA05G314140|TK1151|CDS

ATGCAGCTGCCCAACTGTCTAGCTCACCTCTCATCAGTCGTCTCGAGTATCATAGTCGGCTTCATACTTTCATGGCGACTATCCATCGCTTCCCTTCCTTTTGCGCTTCTCTTCGTTGTTCCCGTTTTAGGCATTGGTGTGATACTAAAAGGACTAGGGATGAAGATGCAAGGTGCTTATAATACAGGCGGTGGGGTTGCAGAACAAGCAATATCATCAATCCGAACCGTTTATTCTTATGTTGGAGAACAACAAACAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1101 aa · TkA05G314140|TK1151|PROTEIN

MQLPNCLAHLSSVVSSIIVGFILSWRLSIASLPFALLFVVPVLGIGVILKGLGMKMQGAYNTGGGVAEQAISSIRTVYSYVGEQQTIAKFSNALQTSMELGIQQGLTKGLMIGSMGMIFVAWAFVAWVGSYLVTEKGESGGRVFVSSICVIMAGLSAMSALPNVPFISDALAATTKMFEMISRVPQIDSENHKGKTFPSVRGHLEFRNVEFSYPSRPDTPILQGLNLKVKAGKTIGLVGGSGSGKSTIISLLERFYDPIK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G314140
TK1151 IDTkA05G314140
OH-1004 IDLXL04_020822
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.909 / OH-1004 88.710
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G314140
位置Chr05:77499100-77503203 (+)
描述Similar to Os02g0190300: Putative multidrug resistance protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28345 ABC 转运蛋白 B 家族成员 15。 暂无已核实直接文献
At3g28390 ABC转运蛋白B家族成员18。 暂无已核实直接文献
At3g28360 ABC转运蛋白B家族成员16。 暂无已核实直接文献
At3g28380 ABC转运蛋白B家族成员17。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0190300 推测的多药耐药蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020822 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0042626 ATPase-coupled transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0140359 ABC-type transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G28345
ath:AT3G28360
ath:AT3G28380
ath:AT3G28390
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.553
排名 1 · TkA05G314140 · TK1151
溶酶体／液泡0.179
排名 2 · TkA05G314140 · TK1151
细胞质0.139
排名 3 · TkA05G314140 · TK1151
内质网0.137
排名 4 · TkA05G314140 · TK1151
高尔基体0.069
排名 5 · TkA05G314140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00664ABC_membrane9-147 aa
PF13558SbcC_Walker_B136-158 aa
PF00005ABC_tran222-371 aa
PF03193RsgA_GTPase222-253 aa
PF12775AAA_7226-251 aa
PF19557BrxC-PglY_N227-254 aa
PF05783DLIC228-262 aa
PF20703nSTAND1228-249 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G314140PF00664ABC_membrane91477.8e-64216.7
TkA05G314140PF13558SbcC_Walker_B1361580.008617.0
TkA05G314140PF00005ABC_tran2223711.2e-68230.7
TkA05G314140PF03193RsgA_GTPase2222535.2e-0730.4
TkA05G314140PF12775AAA_72262510.02814.7
TkA05G314140PF19557BrxC-PglY_N2272540.01615.3
TkA05G314140PF05783DLIC2282620.02614.1
TkA05G314140PF20703nSTAND12282490.03114.7
TkA05G314140PF09818ABC_ATPase2292624.8e-0729.8
TkA05G314140PF13481AAA_252292500.01515.6
TkA05G314140PF07693KAP_NTPase2302540.03414.1
TkA05G314140PF00006ATP-synt_ab2302510.899.9
TkA05G314140PF13555AAA_292322494.1e-0627.2
TkA05G314140PF01935DUF872322660.0005820.7
TkA05G314140PF13245AAA_192322540.01116.7
TkA05G314140PF01583APS_kinase2322710.01316.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LHD1拟南芥sp|Q9LHD1|AB15B_ARATH ABC transporter B family member 1556.100%Swiss-Prot高置信
Q9LSJ5拟南芥sp|Q9LSJ5|AB18B_ARATH ABC transporter B family member 1853.600%Swiss-Prot高置信
Q9LSJ8拟南芥sp|Q9LSJ8|AB16B_ARATH ABC transporter B family member 1653.000%Swiss-Prot高置信
Q9LSJ6拟南芥sp|Q9LSJ6|AB17B_ARATH ABC transporter B family member 1753.300%Swiss-Prot高置信
Q6YUU5水稻sp|Q6YUU5|MDR_ORYSJ Putative multidrug resistance protein55.800%Swiss-Prot高置信

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