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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G289600
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 71553682-71561508 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

5066 bp · TkA05G289600|TK1151|cDNA

CATAGGATATGGAATCTTTGATAGGGATGTTTGTATCATATTATAATACGCACATAAGTTAATTTTCTCTATATATATAGCAGAAGAAGGATCAAGACAATTCAAGTATCACTGTATTGCATCAGCCAACCTCCACTCACCAACCCCCTCCGTCAGAAGAAACGACACGTGAGTCGCTCACCCTTTACAGATCCGCATTTCTTAAACTCATCCAATCTTGGATATACATTACCCACTCAAATATTTCCACCTCCCTTGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

4359 bp · TkA05G289600|TK1151|CDS

ATGTGGGGTTTTTGTTCTTCAATCGATTTTAGTTTTAATTTCGAGGTTTTCGAATCTGCTTCAATGGCGGCTATTTTGAATATAGGCAATGTGTGCTTCTTCTTGTGGTTATTCATCTGGGGTTTCGCAGCTATTTTAAAGCAGAGACGAGGCGAAACAACAACATTCCCGATGAATTCCTCACGTTCTTCGATGATTACAGTCGTCTCCAGTTTCCCAATCATGATTTCTCATATCGGTTTCTGTGTGTACAAGTTCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1452 aa · TkA05G289600|TK1151|PROTEIN

MWGFCSSIDFSFNFEVFESASMAAILNIGNVCFFLWLFIWGFAAILKQRRGETTTFPMNSSRSSMITVVSSFPIMISHIGFCVYKFIKHDVVPLDSIVLALTWCLASVVTVYSFFHRRKWPLVLVLFWCLSTINYFVSVAFILINYFTSKDMHILLSTSNLIHMTTLPFSIILLFNGVTFCIANKHKEVEIDEPLLQQTSERSTSAFTNSGIWNRVTFNWLNPLFELGRIQKLEFHHVPSIPESETAEEAAYLLEESLHK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G289600
TK1151 IDTkA05G289600
OH-1004 IDLXL04_020693
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G289600
位置Chr05:71553682-71561508 (+)
描述Similar to ABCC3: ABC transporter C family member 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g13080 谷胱甘肽 S-结合物泵。
An ABC-transporter of Arabidopsis thaliana has both glutathione-conjugate and chlorophyll catabolite transport activity.1998 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1998.00076.x
At1g04120 谷胱甘肽 S-结合物泵。
The Arabidopsis thaliana ABC transporter AtMRP5 controls root development and stomata movement.2001 · DOI: 10.1093/emboj/20.8.1875
The plant multidrug resistance ABC transporter AtMRP5 is involved in guard cell hormonal signalling and water use.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.016012.x
Binding of sulfonylurea by AtMRP5, an Arabidopsis multidrug resistance-related protein that functions in salt tolerance.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.027045
The Arabidopsis ATP-binding cassette protein AtMRP5/AtABCC5 is a high affinity inositol hexakisphosphate transporter involved in guard cell signaling and phytate storage.2009 · DOI: 10.1074/jbc.m109.030247
At3g13090 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At3g13100 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献
At3g60160 谷胱甘肽 S-结合物泵。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020693 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04120
ath:AT3G13080
ath:AT3G13090
ath:AT3G13100
ath:AT3G60160
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.352
排名 1 · TkA05G289600 · TK1151
溶酶体／液泡0.323
排名 2 · TkA05G289600 · TK1151
细胞质0.168
排名 3 · TkA05G289600 · TK1151
内质网0.157
排名 4 · TkA05G289600 · TK1151
高尔基体0.101
排名 5 · TkA05G289600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00664ABC_membrane282-549 aa
PF13481AAA_25600-644 aa
PF05783DLIC617-646 aa
PF13555AAA_29618-641 aa
PF00005ABC_tran619-749 aa
PF12775AAA_7621-648 aa
PF00006ATP-synt_ab621-646 aa
PF01580FtsK_SpoIIIE622-644 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G289600PF00664ABC_membrane2825492.6e-49169.1
TkA05G289600PF13481AAA_256006440.03114.6
TkA05G289600PF05783DLIC6176460.3210.5
TkA05G289600PF13555AAA_296186417.4e-0626.4
TkA05G289600PF00005ABC_tran6197492.3e-45155.3
TkA05G289600PF12775AAA_76216480.07313.3
TkA05G289600PF00006ATP-synt_ab6216460.1812.2
TkA05G289600PF01580FtsK_SpoIIIE6226440.2911.3
TkA05G289600PF03193RsgA_GTPase6236470.0003821.1
TkA05G289600PF05673DUF8156236470.0613.2
TkA05G289600PF03308MeaB6236580.559.9
TkA05G289600PF02463SMC_N6256457.9e-0936.0
TkA05G289600PF01935DUF876256490.005717.5
TkA05G289600PF20703nSTAND16256420.2611.6
TkA05G289600PF01926MMR_HSR16266521.6e-0525.7
TkA05G289600PF00931NB-ARC6266530.00119.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LK64拟南芥sp|Q9LK64|AB3C_ARATH ABC transporter C family member 350.600%Swiss-Prot高置信
Q7GB25拟南芥sp|Q7GB25|AB5C_ARATH ABC transporter C family member 546.900%Swiss-Prot中等置信
Q8VZZ4拟南芥sp|Q8VZZ4|AB6C_ARATH ABC transporter C family member 647.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LK62拟南芥sp|Q9LK62|AB7C_ARATH ABC transporter C family member 745.600%Swiss-Prot中等置信
Q9M1C7拟南芥sp|Q9M1C7|AB9C_ARATH ABC transporter C family member 947.100%Swiss-Prot中等置信

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