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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA05G175790
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 44928712-44929292 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

501 bp · TkA05G175790|TK1151|cDNA

ATGCTTGCGGAAATGGAGCCGATTGTACTCCAATCATTCAAGGTGGTGCTTGTTTTAGCCTCAATACTGTCAAAGATCACTCCCAACAGCCCCACCTGGCAAGTCTTCCAGTGCTTGGCTGGATTTAACTTCCAGTGCAAAACGCCCAAATCTGCACACCCATTACCAAAATCCTGCATATTCGAGCATATCTACTTCTCCTTACCGAACTCAATCGTTTTCGGTATGTCTGTATACGAATCCAGACGAAAGTTTGGTGA...

501 bp · TkA05G175790|TK1151|CDS

ATGCTTGCGGAAATGGAGCCGATTGTACTCCAATCATTCAAGGTGGTGCTTGTTTTAGCCTCAATACTGTCAAAGATCACTCCCAACAGCCCCACCTGGCAAGTCTTCCAGTGCTTGGCTGGATTTAACTTCCAGTGCAAAACGCCCAAATCTGCACACCCATTACCAAAATCCTGCATATTCGAGCATATCTACTTCTCCTTACCGAACTCAATCGTTTTCGGTATGTCTGTATACGAATCCAGACGAAAGTTTGGTGA...

166 aa · TkA05G175790|TK1151|PROTEIN

MLAEMEPIVLQSFKVVLVLASILSKITPNSPTWQVFQCLAGFNFQCKTPKSAHPLPKSCIFEHIYFSLPNSIVFGMSVYESRRKFGEILATEAPVDCDVVIAVPDSGMVAALGYTAKAGVPFQQGLIRSHYVGRTFIEPSQRIRDFGVKPKLSSVRAVQGRGSLFG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G175790
TK1151 IDTkA05G175790
OH-1004 IDLXL04_038141
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)89.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.976 / OH-1004 29.104
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G175790
位置Chr05:44928712-44929292 (-)
描述Similar to ASE2: Amidophosphoribosyltransferase 2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_038141 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006164 purine nucleotide biosynthetic process 生物过程
GO:0006189 'de novo' IMP biosynthetic process 生物过程
GO:0009113 purine nucleobase biosynthetic process 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009532 plastid stroma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0004044 amidophosphoribosyltransferase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G16570
ath:AT4G34740
ath:AT4G38880
gmx:548065
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.464
排名 1 · TkA05G175790 · TK1151
过氧化物酶体0.204
排名 2 · TkA05G175790 · TK1151
细胞核0.200
排名 3 · TkA05G175790 · TK1151
线粒体0.138
排名 4 · TkA05G175790 · TK1151
质体0.103
排名 5 · TkA05G175790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9STG9拟南芥sp|Q9STG9|ASE2_ARATH Amidophosphoribosyltransferase 2, chloroplastic82.200%Swiss-Prot高置信
Q9SI61拟南芥sp|Q9SI61|ASE1_ARATH Amidophosphoribosyltransferase 1, chloroplastic80.500%Swiss-Prot高置信
Q9T0J5拟南芥sp|Q9T0J5|ASE3_ARATH Amidophosphoribosyltransferase 3, chloroplastic78.500%Swiss-Prot中等置信

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