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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G150480
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 39001295-39004800 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1462 bp · TkA05G150480|TK1151|cDNA

TTTTATTGTTCTGTTGTACTTTAGGGAGGAACATGTGAACAGATTTTTATTTAATCATCCACTTTCCAACTTTCTGGCAACTTCCTTCCAATTGTTTATGGTGTTTACGTTACGTACGCCATGACTCTTCTCTCCCGTTTACGTGATTGCCTGAGATGCAGAAGAGCAACCTCAGCTGATGGTGATGCAGACGATGTTGACGACGGTTGCAATGAAGCATCGGATTTGTTTTTCTCTCTCAAAACTCTTCACGCTGCTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1149 bp · TkA05G150480|TK1151|CDS

ATGACTCTTCTCTCCCGTTTACGTGATTGCCTGAGATGCAGAAGAGCAACCTCAGCTGATGGTGATGCAGACGATGTTGACGACGGTTGCAATGAAGCATCGGATTTGTTTTTCTCTCTCAAAACTCTTCACGCTGCTACAAATTTCTTCTCGGAGTCTAACAAACTCGGTCATGGTGGCTTTGGTCCGGTTTACAAGGGTTTATTACCTGATGGTCAAGAAGTAGCAATTAAGAAGCTATCACTTACATCAAGACAAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

382 aa · TkA05G150480|TK1151|PROTEIN

MTLLSRLRDCLRCRRATSADGDADDVDDGCNEASDLFFSLKTLHAATNFFSESNKLGHGGFGPVYKGLLPDGQEVAIKKLSLTSRQGVGEFTNEVKLLLKIQHRNLVMLLGCCVEGPEKMLVYEYLPNKSLDYILFDKEKARSLDWSQRFKIIVGVVRGLLYLHEEAPLRIIHRDIKASNILLDEKLNPKISDFGLARLFPGDDTHLNTFRISGTHGYIAPEYAMHGYLSVKADVFSFGILVLEIVSGRKVSDKSDLLTD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G150480
TK1151 IDTkA05G150480
OH-1004 IDLXL04_020212
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G150480
位置Chr05:39001295-39004800 (+)
描述Similar to CRK10: Cysteine-rich receptor-like protein kinase 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g23180 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 10。 暂无已核实直接文献
At4g21390 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B120。 暂无已核实直接文献
At4g23160 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶8。 暂无已核实直接文献
At4g23140 富半胱氨酸受体样蛋白激酶 6。 暂无已核实直接文献
At4g05200 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶25。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020212 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000302 response to reactive oxygen species 生物过程
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G70740
ath:AT4G21390
ath:AT4G23140
ath:AT4G23180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.665
排名 1 · TkA05G150480 · TK1151
细胞质0.268
排名 2 · TkA05G150480 · TK1151
细胞核0.199
排名 3 · TkA05G150480 · TK1151
内质网0.042
排名 4 · TkA05G150480 · TK1151
高尔基体0.035
排名 5 · TkA05G150480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase51-267 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr53-311 aa
PF03109ABC156-80 aa
PF03109ABC1119-198 aa
PF12330Haspin_kinase145-200 aa
PF17667Pkinase_fungal153-187 aa
PF01636APH163-197 aa
PF03109ABC1236-257 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G150480PF00069Pkinase512672e-43149.4
TkA05G150480PF07714PK_Tyr_Ser-Thr533112e-44152.6
TkA05G150480PF03109ABC156800.0002121.3
TkA05G150480PF03109ABC11191980.0002121.3
TkA05G150480PF12330Haspin_kinase1452000.01814.8
TkA05G150480PF17667Pkinase_fungal1531870.1611.3
TkA05G150480PF01636APH1631970.2112.1
TkA05G150480PF03109ABC12362570.0002121.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GYA4拟南芥sp|Q8GYA4|CRK10_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1053.600%Swiss-Prot高置信
O81906拟南芥sp|O81906|B120_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase B12055.400%Swiss-Prot高置信
O65468拟南芥sp|O65468|CRK8_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 854.500%Swiss-Prot高置信
Q9C5S9拟南芥sp|Q9C5S9|CRK6_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 652.600%Swiss-Prot高置信
Q9M0X5拟南芥sp|Q9M0X5|CRK25_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 2552.500%Swiss-Prot高置信

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