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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G122250
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 32330148-32332948 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1502 bp · TkA05G122250|TK1151|cDNA

ATGCTCTCTCGCCTTTTTATCACTTACGCTAAGTCGAACCATCTCCATTTGCCGTATGCGAATCATTTGCCACATTATCTCAAATCCTTTTCTCCGCTCTCCCTTCAACTCCATTTACGATCTCTCCACCGCACCACTGCTATGAACGGCAATCGCATCTCTGCCGTGATTTTCGATTTGGACGGCACCCTTTTGAACACAGAGCAAGTTACAAAGGATCTTCTGAAGGAATTTCTTGTTAGATATGGGAAAGTGGTGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1230 bp · TkA05G122250|TK1151|CDS

ATGCTCTCTCGCCTTTTTATCACTTACGCTAAGTCGAACCATCTCCATTTGCCGTATGCGAATCATTTGCCACATTATCTCAAATCCTTTTCTCCGCTCTCCCTTCAACTCCATTTACGATCTCTCCACCGCACCACTGCTATGAACGGCAATCGCATCTCTGCCGTGATTTTCGATTTGGACGGCACCCTTTTGAACACAGAGCAAGTTACAAAGGATCTTCTGAAGGAATTTCTTGTTAGATATGGGAAAGTGGTGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

409 aa · TkA05G122250|TK1151|PROTEIN

MLSRLFITYAKSNHLHLPYANHLPHYLKSFSPLSLQLHLRSLHRTTAMNGNRISAVIFDLDGTLLNTEQVTKDLLKEFLVRYGKVVDMEKENKRLGMIHHESAIAIVKDYDLPITPQQYSQSIMPMYHEKWLHAKSLPGVNRLLKHLHNHGVPFALASNSISKNVQVKVSSQKGWKEYFSVILGSDQVKSGKPSPDLFVEAANKMGVDASCCLVIEDSLVGIKAGKAAKMQVVAVPSIQTESNQYSIADYIIHSFLDFKP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G122250
TK1151 IDTkA05G122250
OH-1004 IDLXL04_020041
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)95.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G122250
位置Chr05:32330148-32332948 (+)
描述Similar to FHY: Bifunctional riboflavin kinase/FMN phosphatase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g21470 双功能酶，催化黄素单核苷酸（FMN）水解生成核黄素（维生素 B2）以及核黄素的磷酸化形成 FMN 辅酶。 暂无已核实直接文献
At4g25840 作为甘油 3 磷酸酶，对 L 甘油 3 磷酸的立体特异性高于 DL 甘油 3 磷酸。
Arabidopsis thaliana AtGppl and AtGpp2: two novel low molecular weight phosphatases involved in plant glycerol metabolism.2007 · DOI: 10.1007/s11103-006-9104-0
Identification and characterization of the missing phosphatase on the riboflavin biosynthesis pathway in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1111/tpj.13291
At5g57440 作为甘油-3-磷酸酶，对 L-甘油-3-磷酸具有比 DL-甘油-3-磷酸更高的立体特异性。
Arabidopsis thaliana AtGppl and AtGpp2: two novel low molecular weight phosphatases involved in plant glycerol metabolism.2007 · DOI: 10.1007/s11103-006-9104-0

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020041 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006114 glycerol biosynthetic process 生物过程
GO:0006771 riboflavin metabolic process 生物过程
GO:0009117 nucleotide metabolic process 生物过程
GO:0009231 riboflavin biosynthetic process 生物过程
GO:0009398 FMN biosynthetic process 生物过程
GO:0016311 dephosphorylation 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0000121 sn-glycerol 1-phosphatase activity 分子功能
GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能
GO:0003919 FMN adenylyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G21470
ath:AT5G57440
dme:Dmel_CG15441
hsa:8226
mmu:67365
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.682
排名 1 · TkA05G122250 · TK1151
细胞质0.167
排名 2 · TkA05G122250 · TK1151
质体0.127
排名 3 · TkA05G122250 · TK1151
细胞核0.086
排名 4 · TkA05G122250 · TK1151
过氧化物酶体0.044
排名 5 · TkA05G122250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03767Acid_phosphat_B46-68 aa
PF00702Hydrolase53-228 aa
PF13419HAD_256-235 aa
PF12710HAD56-185 aa
PF13344Hydrolase_656-71 aa
PF13344Hydrolase_6100-127 aa
PF13344Hydrolase_6131-167 aa
PF03767Acid_phosphat_B133-159 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G122250PF03767Acid_phosphat_B46680.1112.6
TkA05G122250PF00702Hydrolase532282.4e-2797.3
TkA05G122250PF13419HAD_2562351.9e-28100.4
TkA05G122250PF12710HAD561852e-0525.8
TkA05G122250PF13344Hydrolase_656710.0001322.6
TkA05G122250PF13344Hydrolase_61001270.0001322.6
TkA05G122250PF13344Hydrolase_61311670.0001322.6
TkA05G122250PF03767Acid_phosphat_B1331590.1112.6
TkA05G122250PF13242Hydrolase_like1912448.1e-0626.4
TkA05G122250PF13344Hydrolase_61922110.0001322.6
TkA05G122250PF01687Flavokinase3083930.0001622.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84MD8拟南芥sp|Q84MD8|FHYRK_ARATH Bifunctional riboflavin kinase/FMN phosphatase40.400%Swiss-Prot中等置信
F4JTE7拟南芥sp|F4JTE7|GPP1_ARATH (DL)-glycerol-3-phosphatase 1, mitochondrial34.200%Swiss-Prot中等置信
Q8VZP1拟南芥sp|Q8VZP1|GPP2_ARATH (DL)-glycerol-3-phosphatase 235.300%Swiss-Prot中等置信

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