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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G088720
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 23967209-23969538 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1176 bp · TkA05G088720|TK1151|cDNA

CCTCCTTCTCCTGCTACGAGCAGCTATCACCATACGTCACATACAAACCGTTTACTTTGATAATGACAAAATTGCTTAGTTCTACTGTTCATCCATCATCAACATATTCCCCAGTCCAACCAATAATTTCCATCCCCTTTTCTTCCATTTTGATTCGTTCCCAAATCACATTACCAAACGATTCTTCTTCGCACCATGGAAATTGATCAAGTTGAGGAAAACCCTAACTGGCTCTTCGATTATGGATTGATGGATGATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

738 bp · TkA05G088720|TK1151|CDS

ATGGAAATTGATCAAGTTGAGGAAAACCCTAACTGGCTCTTCGATTATGGATTGATGGATGATATCTCCGCCGCTGACTTCACCGCTCCTCCACCTTCCGCCGTTAGTTTTTCCTGGCCTTCCCCCGCTCTCACCTGCTCCGCATCCGTACCTGCTGTAAGTACGGAGATCGAAAGCTCATTAATTGATTTTGAAGGATTTAAAGGGGCAGGATCACGCAAACGGATAAAGTCTGAAACTTACAGTAATGTATGTGGGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

245 aa · TkA05G088720|TK1151|PROTEIN

MEIDQVEENPNWLFDYGLMDDISAADFTAPPPSAVSFSWPSPALTCSASVPAVSTEIESSLIDFEGFKGAGSRKRIKSETYSNVCGSKARREKLRRDRMNERFLELGSILEPGRTPKTDKIAVLSDAIRMITQLRSETERLNESNADLHEKIKELKGEKNELRDEKQRLKVEKERIEQRLKSMSGQPGYLAHPATAMRAAFATQEQAFGNKLMPFAGYPSVAMWQFMPSSVVDTSQDHVLRPPVA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G088720
TK1151 IDTkA05G088720
OH-1004 IDLXL04_019807
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G088720
位置Chr05:23967209-23969538 (-)
描述Similar to BHLH115: Transcription factor bHLH115
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g54680 转录因子。
An Arabidopsis basic helix-loop-helix leucine zipper protein modulates metal homeostasis and auxin conjugate responsiveness.2006 · DOI: 10.1534/genetics.106.061044
At1g51070 转录因子 bHLH115。 暂无已核实直接文献
At4g14410 转录因子bHLH104。 暂无已核实直接文献
At3g23210 转录因子 bHLH34。 暂无已核实直接文献
At4g36060 转录因子bHLH11。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019807 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006879 intracellular iron ion homeostasis 生物过程
GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程
GO:0010039 response to iron ion 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
GO:0060586 multicellular organismal-level iron ion homeostasis 生物过程
GO:0071333 cellular response to glucose stimulus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G51070
ath:AT3G23210
ath:AT4G14410
ath:AT4G36060
ath:AT5G54680
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.972
排名 1 · TkA05G088720 · TK1151
细胞质0.118
排名 2 · TkA05G088720 · TK1151
细胞膜0.021
排名 3 · TkA05G088720 · TK1151
内质网0.012
排名 4 · TkA05G088720 · TK1151
质体0.008
排名 5 · TkA05G088720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00804Syntaxin76-101 aa
PF30671CCDC170_1st77-180 aa
PF23177bHLH_IRO385-173 aa
PF00010HLH87-135 aa
PF15035Rootletin111-181 aa
PF15294Leu_zip117-182 aa
PF27605ODF2_C120-182 aa
PF27575Map3k7cl120-179 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G088720PF00804Syntaxin761010.03614.6
TkA05G088720PF30671CCDC170_1st771800.0713.3
TkA05G088720PF23177bHLH_IRO3851736.5e-41139.3
TkA05G088720PF00010HLH871354.3e-1040.0
TkA05G088720PF15035Rootletin1111810.0315.1
TkA05G088720PF15294Leu_zip1171820.005816.9
TkA05G088720PF27605ODF2_C1201820.002118.0
TkA05G088720PF27575Map3k7cl1201790.01616.2
TkA05G088720PF10234Cluap11211900.001818.4
TkA05G088720PF20492ERM_helical1241820.01616.0
TkA05G088720PF06419COG6_N1241810.2412.3
TkA05G088720PF06785UPF02421251790.1812.6
TkA05G088720PF09969DUF22031251820.2512.7
TkA05G088720PF06005ZapB1261830.0001123.3
TkA05G088720PF29997SPC25_N1261830.001119.9
TkA05G088720PF07926TPR_MLP1_21261860.006217.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FH37拟南芥sp|Q9FH37|ILR3_ARATH Transcription factor ILR354.800%Swiss-Prot高置信
Q9C682拟南芥sp|Q9C682|BH115_ARATH Transcription factor bHLH11552.100%Swiss-Prot高置信
Q8L467拟南芥sp|Q8L467|BH104_ARATH Transcription factor bHLH10448.600%Swiss-Prot中等置信
Q9LTC7拟南芥sp|Q9LTC7|BH034_ARATH Transcription factor bHLH3445.900%Swiss-Prot中等置信
Q8W2F2拟南芥sp|Q8W2F2|BH011_ARATH Transcription factor bHLH1146.500%Swiss-Prot低置信

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