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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G063080
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 16795800-16799797 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2431 bp · TkA05G063080|TK1151|cDNA

CGACTGTATCATCCCGCCGTCAAATTCATATTATTACATCTTAAGTTATCCATGAATGTTTAGCCATTTTTTGGGTTTTGGAGTTTCTGCAGGGCGGATAGGGATTTGATGGATAGATTGAGGTAGTAATGTGTAATATTATTGTGGATAGAGGAAGTCACCGGGAGATGGGTGAGTAGTAAGCTGGTCAGCACTCAGCACCCATCTTCCATCACCTCCTCCGATCCTTCTTGGCAACAACTCGGAAGGTTTCCTGCTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1686 bp · TkA05G063080|TK1151|CDS

ATGGGCAATACATGCCGTGGATCTTTAGGAACAAAACACACACAGGGTTTAAATAAGCCCGAAGACCATTCAATCGCTTCTCAAAATCCTTCATCAGCTTTATCCAACAACTCTCTAGATTACTCGCCGACCACCTTAATCTCCAACCAACTCATCGCGCAAGAATTCTCAAAAGAACCCACTCCCAAACCCCTCCCTCTTCCCAAAAAAGACGCCACCATGAGCCGCCACGGAACCTCCAACCAATCCTACTACGTTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

561 aa · TkA05G063080|TK1151|PROTEIN

MGNTCRGSLGTKHTQGLNKPEDHSIASQNPSSALSNNSLDYSPTTLISNQLIAQEFSKEPTPKPLPLPKKDATMSRHGTSNQSYYVLGHKTDNIRDVYTLGQKLGQGQFGTTYLCTEIATGIDYACKSISKRKLISKEDLEDVRREIQIMHHLAGHNNIVTIKGAYEDPLYVHIVMELCNGGELFDRIIQRGHYSERKAAELTKIIVGVVEACHSLGVMHRDLKPENFLLVNRDDDFSLKAIDFGLSVFFKPGQIFTDVV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G063080
TK1151 IDTkA05G063080
OH-1004 IDLXL04_019562
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G063080
位置Chr05:16795800-16799797 (-)
描述Similar to CPK4: Calcium-dependent protein kinase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g17290 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
CDPKs CPK6 and CPK3 function in ABA regulation of guard cell S-type anion- and Ca(2+)-permeable channels and stomatal closure.2006 · DOI: 10.1371/journal.pbio.0040327
Calcium-dependent protein kinases responsible for the phosphorylation of a bZIP transcription factor FD crucial for the florigen complex formation.2015 · DOI: 10.1038/srep08341
At4g35310 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0584600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019562 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:1901002 positive regulation of response to salt stress 生物过程
GO:1902456 regulation of stomatal opening 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17290
ath:AT4G35310
dosa:Os04g0584600
osa:4336783
sot:102594309
sot:102604043
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.429
排名 1 · TkA05G063080 · TK1151
细胞膜0.428
排名 2 · TkA05G063080 · TK1151
细胞核0.228
排名 3 · TkA05G063080 · TK1151
高尔基体0.093
排名 4 · TkA05G063080 · TK1151
内质网0.059
排名 5 · TkA05G063080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14531Kinase-like97-155 aa
PF00069Pkinase98-356 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr99-350 aa
PF13499EF-hand_7133-147 aa
PF13202EF-hand_5135-142 aa
PF01636APH135-157 aa
PF06293Kdo174-244 aa
PF03109ABC1174-251 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G063080PF14531Kinase-like971550.02714.5
TkA05G063080PF00069Pkinase983566.1e-76256.0
TkA05G063080PF07714PK_Tyr_Ser-Thr993505.5e-2382.3
TkA05G063080PF13499EF-hand_71331471.1e-28100.0
TkA05G063080PF13202EF-hand_51351424.1e-2380.4
TkA05G063080PF01636APH1351570.1113.0
TkA05G063080PF06293Kdo1742440.0001122.5
TkA05G063080PF03109ABC11742510.008316.0
TkA05G063080PF14531Kinase-like1932440.02714.5
TkA05G063080PF24548EF_EFCAB10_C2112261.7e-0525.1
TkA05G063080PF01636APH2162460.1113.0
TkA05G063080PF13833EF-hand_83073189.9e-1864.4
TkA05G063080PF20742DUF5580_M3844623.4e-0627.7
TkA05G063080PF04028DUF3743844220.08313.2
TkA05G063080PF13833EF-hand_83864259.9e-1864.4
TkA05G063080PF12763EH3964641.6e-0835.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38872拟南芥sp|Q38872|CDPK6_ARATH Calcium-dependent protein kinase 683.600%Swiss-Prot高置信
Q38871拟南芥sp|Q38871|CDPK5_ARATH Calcium-dependent protein kinase 578.900%Swiss-Prot高置信
Q9FXQ3水稻sp|Q9FXQ3|CDPKD_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1379.600%Swiss-Prot高置信

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