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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G062300
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 16568269-16570027 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

474 bp · TkA05G062300|TK1151|cDNA

ATGGTCGACCGACGTACCAAGAGATGGGGGTTAGTGCATACTCATCATTTGCAAGAATTGGAGGTGGACTTTATGAGCAACAAAAGAGGAGAGTTGACTCTTCAACAAATCTGTGGTGATTTTAATTCGGTTCCTGGAAGGGTTACAGATGTTGGCATATCACATCTGGTAAAGAACTGCAAGCATATTGTTGAGTTGAACTTAAGTGGCTGTAAGTGTCTAGAGTTGCTAGATATCACTAGGTGCATTAAGATAACAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

474 bp · TkA05G062300|TK1151|CDS

ATGGTCGACCGACGTACCAAGAGATGGGGGTTAGTGCATACTCATCATTTGCAAGAATTGGAGGTGGACTTTATGAGCAACAAAAGAGGAGAGTTGACTCTTCAACAAATCTGTGGTGATTTTAATTCGGTTCCTGGAAGGGTTACAGATGTTGGCATATCACATCTGGTAAAGAACTGCAAGCATATTGTTGAGTTGAACTTAAGTGGCTGTAAGTGTCTAGAGTTGCTAGATATCACTAGGTGCATTAAGATAACAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

157 aa · TkA05G062300|TK1151|PROTEIN

MVDRRTKRWGLVHTHHLQELEVDFMSNKRGELTLQQICGDFNSVPGRVTDVGISHLVKNCKHIVELNLSGCKCLELLDITRCIKITDGSLQHIITKCSGLKSLNLYALSSFTDEAYKKLSLLGNLRFLDLCGAQNLSDEGLLSIAKCKNIRTLSLTW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G062300
TK1151 IDTkA05G062300
OH-1004 IDLXL04_000289
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.178 / OH-1004 65.368
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G062300
位置Chr05:16568269-16570027 (+)
描述Similar to At3g58530: F-box protein At3g58530
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g58530 F-box蛋白At3g58530。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000289 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0051781 positive regulation of cell division 生物过程
GO:0071365 cellular response to auxin stimulus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0019005 SCF ubiquitin ligase complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21410
ath:AT3G58530
bta:531211
hsa:144699
mmu:101358
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.542
排名 1 · TkA05G062300 · TK1151
细胞质0.299
排名 2 · TkA05G062300 · TK1151
线粒体0.122
排名 3 · TkA05G062300 · TK1151
细胞膜0.036
排名 4 · TkA05G062300 · TK1151
内质网0.020
排名 5 · TkA05G062300 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12799LRR_415-22 aa
PF13516LRR_615-22 aa
PF25372LRR_FBXL1538-105 aa
PF25372LRR_FBXL1542-70 aa
PF13516LRR_648-54 aa
PF23952LRR_EndoS48-80 aa
PF23286LRR_1351-94 aa
PF29594LRR_SKP252-72 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G062300PF12799LRR_415221.6e-0525.7
TkA05G062300PF13516LRR_615220.02915.1
TkA05G062300PF25372LRR_FBXL15381054.2e-0832.7
TkA05G062300PF25372LRR_FBXL1542704.2e-0832.7
TkA05G062300PF13516LRR_648540.02915.1
TkA05G062300PF23952LRR_EndoS48800.1712.9
TkA05G062300PF23286LRR_1351941.29.5
TkA05G062300PF29594LRR_SKP252724.9e-0833.3
TkA05G062300PF12799LRR_452771.6e-0525.7
TkA05G062300PF29477COS111_C53700.06713.6
TkA05G062300PF19729LRR_FBXL18581080.111.7
TkA05G062300PF23952LRR_EndoS581080.1712.9
TkA05G062300PF13516LRR_659720.02915.1
TkA05G062300PF25013LRR_Zer-1681340.004417.9
TkA05G062300PF13516LRR_671880.02915.1
TkA05G062300PF24758LRR_At5g56370721070.2411.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LB33拟南芥sp|Q8LB33|FB330_ARATH F-box protein At3g5853066.700%Swiss-Prot低置信

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