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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA05G053170
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 14149363-14152853 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1300 bp · TkA05G053170|TK1151|cDNA

AGATACGTATGCTTAAAGTCGAAATTGAGAGGAGAGAGAAATGGATAGGATGTTTTCAGTGGACGATATCGCGGGCCACTTTTGGTCGCCATCGCCGGCCGCCGGCGCAGCCGATGAGGATGAATCGTCGTCTTCTTCATCCGCATCTAAGAGAAAGTCAACGCCGGCGATGATGAATCGGAGCATGTCGGAGTGGCAATTTCAACGCTTCCTCCAAGAAGCATCGGCACCACCGGAATCTACCTCTTATAGACCAAACG...

1260 bp · TkA05G053170|TK1151|CDS

ATGGATAGGATGTTTTCAGTGGACGATATCGCGGGCCACTTTTGGTCGCCATCGCCGGCCGCCGGCGCAGCCGATGAGGATGAATCGTCGTCTTCTTCATCCGCATCTAAGAGAAAGTCAACGCCGGCGATGATGAATCGGAGCATGTCGGAGTGGCAATTTCAACGCTTCCTCCAAGAAGCATCGGCACCACCGGAATCTACCTCTTATAGACCAAACGAAGTTGTCGAGATCAAGGATCAAGATGAGCTTCGAGAAAA...

420 aa · TkA05G053170|TK1151|PROTEIN

MDRMFSVDDIAGHFWSPSPAAGAADEDESSSSSSASKRKSTPAMMNRSMSEWQFQRFLQEASAPPESTSYRPNEVVEIKDQDELREKNQPSATTTATLKNNESGRTTGSSTGGGAAATTSFGASIAGGPPNVPIDSEEYQAYLKSRLNLACAAVALTRASSAKAQDFAGLTDNGSQASNTSQLGYQVPSKGFDPKGASKDGGGPIGIPSLPAVQKKVAAIPVKSATSGSSRELSDDDELDGDTETTQNMDPTDAKRVRRM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G053170
TK1151 IDTkA05G053170
OH-1004 IDLXL04_019474
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 90.733
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G053170
位置Chr05:14149363-14152853 (+)
描述Similar to CPRF2: Light-inducible protein CPRF2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g28770 参与控制饥饿反应的转录因子。
At4g02640 结合C-box样基序(5'-TGCTGACGTCA-3')和G-box样基序(5'-CCACGTGGCC-3')、基因启动子的ABRE元件的转录因子。
At3g54620 转录因子,结合 5'-ACGT-3' 底物,尤其存在于 G-box 样序列 (5'-CCACGTGGCC-3')、ABRE 元件及种子贮存蛋白 (SSP) 编码基因启动子 (例如) 中。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0796900 转录激活因子,能结合 α-球蛋白基因启动子中的 DNA 特异序列 5'-GCCACGT[AC]AG-3'。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_019474 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0002240 response to molecule of oomycetes origin 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009267 cellular response to starvation 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009649 entrainment of circadian clock 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程
GO:0071333 cellular response to glucose stimulus 生物过程
GO:2000693 positive regulation of seed maturation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G54620
ath:AT4G02640
ath:AT5G28770
dosa:Os03g0796900
osa:4334424
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞核0.975
排名 1 · TkA05G053170 · TK1151
细胞质0.089
排名 2 · TkA05G053170 · TK1151
细胞膜0.031
排名 3 · TkA05G053170 · TK1151
内质网0.018
排名 4 · TkA05G053170 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA05G053170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12498bZIP_C52-53 aa
PF00170bZIP_184-99 aa
PF12498bZIP_C130-174 aa
PF26095CC_Bre1135-161 aa
PF07200Mod_r233-333 aa
PF07716bZIP_2252-301 aa
PF03131bZIP_Maf253-309 aa
PF00170bZIP_1254-306 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G053170PF12498bZIP_C52533.9e-2073.8
TkA05G053170PF00170bZIP_184995.7e-1452.7
TkA05G053170PF12498bZIP_C1301743.9e-2073.8
TkA05G053170PF26095CC_Bre11351610.1313.3
TkA05G053170PF07200Mod_r2333330.4411.2
TkA05G053170PF07716bZIP_22523013.1e-0834.3
TkA05G053170PF03131bZIP_Maf2533090.001120.1
TkA05G053170PF00170bZIP_12543065.7e-1452.7
TkA05G053170PF13851GAS2543090.6310.1
TkA05G053170PF09789CC1492553330.001618.5
TkA05G053170PF19220Rod_CreS2553360.005416.6
TkA05G053170PF13863DUF42002563020.8910.6
TkA05G053170PF24161CCDC392573340.01513.9
TkA05G053170PF26095CC_Bre12573100.1313.3
TkA05G053170PF25762HAUS12603360.1212.9
TkA05G053170PF07926TPR_MLP1_22623354.28.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
B9DGI8拟南芥sp|B9DGI8|BZP63_ARATH Basic leucine zipper 6342.000%Swiss-Prot中等置信
O22763拟南芥sp|O22763|BZP10_ARATH Basic leucine zipper 1036.800%Swiss-Prot中等置信
Q9M1G6拟南芥sp|Q9M1G6|BZP25_ARATH Basic leucine zipper 2541.700%Swiss-Prot中等置信
Q7X9A8水稻sp|Q7X9A8|RSBZ2_ORYSJ bZIP transcription factor RISBZ243.500%Swiss-Prot中等置信

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