基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA05G050500
当前版本: TK1151
染色体: Chr05
坐标: 13455034-13460467
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1352 bp · TkA05G050500|TK1151|cDNA
AATTATTAATCTATTTAATTAACAAGTTGTTCACAAACTTTGTATATAAACTACTATTTTCACAAGACAAAAAGCAACACCAACAAATTCAATGGCGACAATCAAAGTACCAGAAGTAGTTCCTTCTCCTACCCAAGACTCGGAAACTATCCACGAGGCTTTACATGGCTTCATAATTGATACGAAGGCTGTGATTAAAGTACTCGGTCATAGGAATACAACCCAAAGAAAGATCATCCGAGACACTTATCGAGAATTAT...
CDS
下载 CDS FASTA789 bp · TkA05G050500|TK1151|CDS
ATGGCGACAATCAAAGTACCAGAAGTAGTTCCTTCTCCTACCCAAGACTCGGAAACTATCCACGAGGCTTTACATGGCTTCATAATTGATACGAAGGCTGTGATTAAAGTACTCGGTCATAGGAATACAACCCAAAGAAAGATCATCCGAGACACTTATCGAGAATTATACAATCAAGATCTTATTGATGCTCTCCATTCTAAGATTACCTTTAATTTTGGGAGAGCAGTGGTCTTGTGGACATATGATCCATCAGAAAG...
262 aa · TkA05G050500|TK1151|PROTEIN
MATIKVPEVVPSPTQDSETIHEALHGFIIDTKAVIKVLGHRNTTQRKIIRDTYRELYNQDLIDALHSKITFNFGRAVVLWTYDPSERDARLVNEALSSKKIDKNELQVIVEISCASSPHHLMAIRKCYCSLYKRSLEEDIIDNAPKSVRKILVGLVSAFRFDGEMVDMDLANDEASKLEETIKLKQLDQDVFVWILSTRNVFQLRATFKSYQQKFGNHIFEDIKDSENDLLVSFVKDVIRCIASPEKYFAEVILITAETI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA05G050500 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA05G050500 |
| OH-1004 ID | LXL04_019419 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Strict |
| 蛋白一致性 (%) | 97.300 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 98.473 / OH-1004 81.646覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA05G050500 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:13455034-13460467 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ANN3: Annexin D3 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009639 response to red or far red light 生物过程 GO:0009651 response to salt stress 生物过程 GO:0015774 polysaccharide transport 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0080022 primary root development 生物过程 GO:0110128 phloem sucrose unloading 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G38760 ath:AT5G10220 ath:AT5G10230 ath:AT5G12380 ath:AT5G65020 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.523
细胞核0.235
细胞膜0.186
质体0.088
线粒体0.059
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00191Annexin15-79 aaPF11774Lsr270-97 aaPF00191Annexin88-154 aaPF11774Lsr2158-183 aaPF00191Annexin175-225 aaPF11774Lsr2196-211 aaPF11774Lsr2219-235 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA05G050500 | PF00191 | Annexin | 15 | 79 | 1.6e-31 | 108.9 |
| TkA05G050500 | PF11774 | Lsr2 | 70 | 97 | 0.081 | 13.3 |
| TkA05G050500 | PF00191 | Annexin | 88 | 154 | 1.6e-31 | 108.9 |
| TkA05G050500 | PF11774 | Lsr2 | 158 | 183 | 0.081 | 13.3 |
| TkA05G050500 | PF00191 | Annexin | 175 | 225 | 1.6e-31 | 108.9 |
| TkA05G050500 | PF11774 | Lsr2 | 196 | 211 | 0.081 | 13.3 |
| TkA05G050500 | PF11774 | Lsr2 | 219 | 235 | 0.081 | 13.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SE45 | 拟南芥 | sp|Q9SE45|ANXD3_ARATH Annexin D3 | 50.400% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9LX07 | 拟南芥 | sp|Q9LX07|ANXD7_ARATH Annexin D7 | 41.500% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q94CK4 | 拟南芥 | sp|Q94CK4|ANXD8_ARATH Annexin D8 | 41.200% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9XEE2 | 拟南芥 | sp|Q9XEE2|ANXD2_ARATH Annexin D2 | 40.900% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9SYT0 | 拟南芥 | sp|Q9SYT0|ANXD1_ARATH Annexin D1 | 37.800% | Swiss-Prot | 中等置信 |