基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA05G050220
当前版本: TK1151
染色体: Chr05
坐标: 13357205-13370491
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3474 bp · TkA05G050220|TK1151|cDNA
CTCACCTTTCCCTCTTATATTAGAATTTGCAACACATTCTCCTCCGTAATTCTCTCCCTCTCCCTCTCAAACATTAAAATTTCTTAATAGAAGGCTGTAAACTTTTTGACGTTTGGGGTCTTTTTCTTTTGCATAATCTCCTTTTGTTATTTAAATCCCCTATTTCAATGCATGTTAAATACTTTGAAGTTGTAGCGTCTCATAAATCTGATCACCAACTTTTTCAAACTCATATTTTTTTGGCTCTGGTTTTACACTAC...
CDS
下载 CDS FASTA2613 bp · TkA05G050220|TK1151|CDS
ATGACTATGAAGAATCCGATTTGGGGATTATTGGTGGTGCTGGTTTTCTTTGGTGGGCGTTTCATTGAGAAGCAAAGGCAGTCGTTTGTCCTAGCTGGGATTCCTGCATCCAGCAAGCTTAGGGATAATAGTGTTCGTTCAAGACCAGAAGTTGTTAAAATTGGGTCCATTTTCGCCTTTGATTCGATGATAGGCAAAGTTGGGAAAATTGCATTGGAGGCTGCAGTAGAAGATGTGAATTCTGATCCAACAGTGCTTAA...
870 aa · TkA05G050220|TK1151|PROTEIN
MTMKNPIWGLLVVLVFFGGRFIEKQRQSFVLAGIPASSKLRDNSVRSRPEVVKIGSIFAFDSMIGKVGKIALEAAVEDVNSDPTVLNGTKLELKIHDSNSSGFLSIMEAMQITESEIVALIGPESSTLTHMLSYVVKDLQVPLLSFTSMDPTLSSLQYPFFVQTTHSDIFQMAAIADIIDYYEWRQVIVIYIDDDRGRNGITSLSDQLASKRSKISHKAPINPDATREDIRDVLLHVSFMESRVLVVHACTNRGLDILYV...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA05G050220 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA05G050220 |
| OH-1004 ID | LXL04_019404 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 71.800 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 99.195 / OH-1004 89.880覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA05G050220 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:13357205-13370491 (-) | ||||||
| 描述 | Similar to GLR3.6: Glutamate receptor 3.6 | ||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| ||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006816 calcium ion transport 生物过程 GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程 GO:0006883 intracellular sodium ion homeostasis 生物过程 GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程 GO:0009416 response to light stimulus 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0009630 gravitropism 生物过程 GO:0009864 induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程 GO:0030007 intracellular potassium ion homeostasis 生物过程 GO:0045087 innate immune response 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 | ||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G05200 ath:AT1G42540 ath:AT3G51480 ath:AT4G35290 osa:124544569 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.811
内质网0.075
细胞质0.070
溶酶体／液泡0.048
细胞核0.028
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01094ANF_receptor70-422 aaPF18920DUF5671328-351 aaPF10613Lig_chan-Glu_bd496-583 aaPF00497SBP_bac_3537-830 aaPF00060Lig_chan601-863 aaPF18920DUF5671608-656 aaPF18920DUF5671671-697 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA05G050220 | PF01094 | ANF_receptor | 70 | 422 | 3.1e-78 | 264.0 |
| TkA05G050220 | PF18920 | DUF5671 | 328 | 351 | 2.6 | 8.7 |
| TkA05G050220 | PF10613 | Lig_chan-Glu_bd | 496 | 583 | 1.9e-07 | 31.9 |
| TkA05G050220 | PF00497 | SBP_bac_3 | 537 | 830 | 1.4e-09 | 38.5 |
| TkA05G050220 | PF00060 | Lig_chan | 601 | 863 | 1.8e-33 | 116.1 |
| TkA05G050220 | PF18920 | DUF5671 | 608 | 656 | 2.6 | 8.7 |
| TkA05G050220 | PF18920 | DUF5671 | 671 | 697 | 2.6 | 8.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q84W41 | 拟南芥 | sp|Q84W41|GLR36_ARATH Glutamate receptor 3.6 | 58.400% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9C8E7 | 拟南芥 | sp|Q9C8E7|GLR33_ARATH Glutamate receptor 3.3 | 54.800% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q8GXJ4 | 拟南芥 | sp|Q8GXJ4|GLR34_ARATH Glutamate receptor 3.4 | 53.600% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q93YT1 | 拟南芥 | sp|Q93YT1|GLR32_ARATH Glutamate receptor 3.2 | 52.000% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q7XP59 | 水稻 | sp|Q7XP59|GLR31_ORYSJ Glutamate receptor 3.1 | 52.800% | Swiss-Prot | 高置信 |