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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G049480
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 13066627-13080012 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2094 bp · TkA05G049480|TK1151|cDNA

ATGGCCGCCATAGCCGACATAATCGAGTACTATGAATGGATACAAGTCATAGCCATTTACATAGACGATGATCATGGGAGAAATGGAATAACTTCATTAGCAGATCAATTATTTTCCAAACGTTGCACCAATCGGGGATTAGATATACTTGATGTTGCTCAAGATCTTGGTATGATGGAAAGTGGGTACGTTTGGATCGCAACCGATTGGATTTCGACAATCATTGACATAACCTCCCCGGTCCCTACTCAAACAATTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2094 bp · TkA05G049480|TK1151|CDS

ATGGCCGCCATAGCCGACATAATCGAGTACTATGAATGGATACAAGTCATAGCCATTTACATAGACGATGATCATGGGAGAAATGGAATAACTTCATTAGCAGATCAATTATTTTCCAAACGTTGCACCAATCGGGGATTAGATATACTTGATGTTGCTCAAGATCTTGGTATGATGGAAAGTGGGTACGTTTGGATCGCAACCGATTGGATTTCGACAATCATTGACATAACCTCCCCGGTCCCTACTCAAACAATTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

697 aa · TkA05G049480|TK1151|PROTEIN

MAAIADIIEYYEWIQVIAIYIDDDHGRNGITSLADQLFSKRCTNRGLDILDVAQDLGMMESGYVWIATDWISTIIDITSPVPTQTIAAIQGVITLRSYIKDSEPKRKFITKWENMTNLVLSAYSLYAYDTIWLLALALDDFFNQGGNISFSKGLAIQNSQGRFLNLDALSVLKGGKILLENIFKVKMNGTTGPIDFTFEKNLIFPAFEVINVMGTGLTRTVGYWSNSSRLSTSPPETLNTNLSNQSSTSELLQNVIFPGK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G049480
TK1151 IDTkA05G049480
OH-1004 IDLXL04_019406
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.118 / OH-1004 90.358
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G049480
位置Chr05:13066627-13080012 (+)
描述Similar to GLR3.6: Glutamate receptor 3.6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g51480 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道。
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478
At1g42540 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道，至少在根和下胚轴中（可能）。
Calcium entry mediated by GLR3.3, an Arabidopsis glutamate receptor with a broad agonist profile.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088989
Glutamate receptor subtypes evidenced by differences in desensitization and dependence on the GLR3.3 and GLR3.4 genes.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.108134
Glutamate receptor-like channel3.3 is involved in mediating glutathione-triggered cytosolic calcium transients, transcriptional changes, and innate immunity responses in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.217208
Involvement of the glutamate receptor AtGLR3.3 in plant defense signaling and resistance to Hyaloperonospora arabidopsidis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12311
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478
Real-time, in vivo intracellular recordings of caterpillar-induced depolarization waves in sieve elements using aphid electrodes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12807
At4g35290 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道（可能）。
Overexpression of the AtGluR2 gene encoding an Arabidopsis homolog of mammalian glutamate receptors impairs calcium utilization and sensitivity to ionic stress in transgenic plants.2001 · DOI: 10.1093/pcp/pce008
Interacting glutamate receptor-like proteins in Phloem regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110668
At2g17260 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道。
De-regulated expression of the plant glutamate receptor homolog AtGLR3.1 impairs long-term Ca2+-programmed stomatal closure.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03789.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0585200 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。
A rice glutamate receptor-like gene is critical for the division and survival of individual cells in the root apical meristem.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.037713
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019406 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009630 gravitropism 生物过程
GO:0009864 induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0070417 cellular response to cold 生物过程
GO:0071230 cellular response to amino acid stimulus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05200
ath:AT1G42540
ath:AT3G51480
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.803
排名 1 · TkA05G049480 · TK1151
内质网0.082
排名 2 · TkA05G049480 · TK1151
细胞质0.074
排名 3 · TkA05G049480 · TK1151
溶酶体／液泡0.047
排名 4 · TkA05G049480 · TK1151
细胞核0.041
排名 5 · TkA05G049480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01094ANF_receptor1-40 aa
PF01094ANF_receptor47-214 aa
PF10613Lig_chan-Glu_bd291-379 aa
PF00497SBP_bac_3334-572 aa
PF26629GT2_TM_C388-415 aa
PF00060Lig_chan396-458 aa
PF00060Lig_chan564-603 aa
PF26629GT2_TM_C597-623 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G049480PF01094ANF_receptor1402.1e-34119.9
TkA05G049480PF01094ANF_receptor472142.1e-34119.9
TkA05G049480PF10613Lig_chan-Glu_bd2913796e-0523.8
TkA05G049480PF00497SBP_bac_33345727.4e-0729.7
TkA05G049480PF26629GT2_TM_C3884150.0913.6
TkA05G049480PF00060Lig_chan3964588.4e-1452.3
TkA05G049480PF00060Lig_chan5646038.4e-1452.3
TkA05G049480PF26629GT2_TM_C5976230.0913.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84W41拟南芥sp|Q84W41|GLR36_ARATH Glutamate receptor 3.648.200%Swiss-Prot中等置信
Q9C8E7拟南芥sp|Q9C8E7|GLR33_ARATH Glutamate receptor 3.346.300%Swiss-Prot中等置信
Q93YT1拟南芥sp|Q93YT1|GLR32_ARATH Glutamate receptor 3.244.200%Swiss-Prot中等置信
Q7XJL2拟南芥sp|Q7XJL2|GLR31_ARATH Glutamate receptor 3.143.300%Swiss-Prot中等置信
Q7XP59水稻sp|Q7XP59|GLR31_ORYSJ Glutamate receptor 3.142.800%Swiss-Prot中等置信

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