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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G044780
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 11849960-11854190 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3504 bp · TkA05G044780|TK1151|cDNA

AGACTTAAACCAGCCCCTTCTAACCGCTTCTGGATCTCAAAACCCTATTCTTCCTTCGCAAAAGCGGCCGACTTCTTCCTTCTCCACACAGCGACTTCTTTCCTTCTCCACCTGCGACGCCTGTCTTCGCCGCTTTCCTTCTCCACCGGCGACCGCGACCTGTTCTCCATCGCGACGACTACAGCAGAGAACTCTGGTGCGATTTCTTCCATTTAAACCGCCGATTTCACCCAATTTCTCCACAAATACCGGTTATGGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2766 bp · TkA05G044780|TK1151|CDS

ATGAGCAGCAGCAGAATAAGAAACTTCCGTCGTCGATCAGACGACGACGACAATGACGATGAAGATAAAGAAAAAACAACCACCCCTGCCGGCCCCACCACCATCAGCAAAAAACAACAATCAAAGCCTGCCACAGCCACTCCAAAACCTAAGAAACCTAGTCTCCTTAGCTTTGCCGATGACGAATCTACGGACTTCATTACTCCAATCTCTCGAAGCCGCCCTTCTAATCCAAATAAACAACCTAGTTCTTCCCGTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

921 aa · TkA05G044780|TK1151|PROTEIN

MSSSRIRNFRRRSDDDDNDDEDKEKTTTPAGPTTISKKQQSKPATATPKPKKPSLLSFADDESTDFITPISRSRPSNPNKQPSSSRLSKPSPLSSSSAHKLTSAKDRNSAKERTSASSLPSNVQPQAGVYTKEALLELQKNTKTLGSSTSRSRPRPPPSEPIIVLKGTVKPIIDDSLTNTKEGDEESDRDETMNRLGSIRLGGKLGKGGNLDGGVIPDQAMIDAIRAKRERLRQSRAAAPDFIALDGGSNHGEAEGLSDE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G044780
TK1151 IDTkA05G044780
OH-1004 IDLXL04_019344
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.874 / OH-1004 76.117
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G044780
位置Chr05:11849960-11854190 (+)
描述Similar to ILP1: Transcriptional repressor ILP1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g08550 转录阻遏蛋白通过控制 A 型细胞周期蛋白表达来调节核内复制。
Increased level of polyploidy1, a conserved repressor of CYCLINA2 transcription, controls endoreduplication in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.043869

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019344 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000245 spliceosomal complex assembly 生物过程
GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0014842 regulation of skeletal muscle satellite cell proliferation 生物过程
GO:0042023 DNA endoreduplication 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:2000288 positive regulation of myoblast proliferation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G08550
hsa:6936
hsa:94104
mmu:330361
mmu:67367
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.932
排名 1 · TkA05G044780 · TK1151
细胞质0.127
排名 2 · TkA05G044780 · TK1151
细胞膜0.023
排名 3 · TkA05G044780 · TK1151
内质网0.013
排名 4 · TkA05G044780 · TK1151
高尔基体0.011
排名 5 · TkA05G044780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11714Inhibitor_I539-35 aa
PF15377DUF460411-62 aa
PF11596DUF324614-76 aa
PF15458NTR215-62 aa
PF11714Inhibitor_I53103-155 aa
PF22793DUF7013136-149 aa
PF15458NTR2196-326 aa
PF11596DUF3246282-307 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G044780PF11714Inhibitor_I539352.79.0
TkA05G044780PF15377DUF460411621.410.0
TkA05G044780PF11596DUF324614760.09112.9
TkA05G044780PF15458NTR215624e-0833.9
TkA05G044780PF11714Inhibitor_I531031552.79.0
TkA05G044780PF22793DUF70131361490.0713.9
TkA05G044780PF15458NTR21963264e-0833.9
TkA05G044780PF11596DUF32462823070.09112.9
TkA05G044780PF15377DUF46042943061.410.0
TkA05G044780PF08354Fas1-AflB-like_hel3824720.1911.3
TkA05G044780PF15377DUF46044525871.410.0
TkA05G044780PF07842GCFC6178221.1e-30108.0
TkA05G044780PF15458NTR26436964e-0833.9
TkA05G044780PF22793DUF70137237770.0713.9
TkA05G044780PF06175MiaE7257640.1113.0
TkA05G044780PF30768DUF87277969050.01715.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FNN3拟南芥sp|Q9FNN3|ILP1_ARATH Transcriptional repressor ILP144.500%Swiss-Prot中等置信

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