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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G024800
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 6720481-6730105 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1591 bp · TkA05G024800|TK1151|cDNA

AAATAATTCATTTAAATTTCGTTAAAGAATAAAAACAAACAATTAAGTACTGCAAGCAAAACAAGAGTAAGGGTTTATTCTGTTTATCGTTTCGGAGGTTAAGATTATAGTCCTAACTTTTACCTCATCTTCATCATACCAACAAACTTCCATTGCTGCTTCTGTTTACAAGTTTCAATTTCACTGTTAAACCCCAAATGGTTCCCAGAAACAACCAAGCAACGTTAACTTGGAAGAAAATTCCGGGTCTTGAACCCCTA...

CDS

下载 CDS FASTA

2457 bp · TkA05G024800|TK1151|CDS

ATGGTTCCCAGAAACAACCAAGCAACGTTAACTTGGAAGAAAATTCCGGGTCTTGAACCCCTAAAATACGAAGAAAATGACCTCCTATGGCGTAGATGTGGTGGCAGCGGTGTCAATGGTGGCCCTGTTCGTTCTTATGGCATTGATTGTTTCGCTTCCGTTTCAATGACAGAGAATAAGAGAGTTGCAGCAACGATAGAACTCACACCCACGGCAGCGCAGCTTATGAAACACCCGCTGGCTATTGTGGCTTTGGTGCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

818 aa · TkA05G024800|TK1151|PROTEIN

MVPRNNQATLTWKKIPGLEPLKYEENDLLWRRCGGSGVNGGPVRSYGIDCFASVSMTENKRVAATIELTPTAAQLMKHPLAIVALVPKEAAVFAAGAVAGAAAKTVTAPLDRIKLIMQTHGLRAGQETAKKSIGFIEAVVSIVKDEGVKGYWKGNLAQVLRILPYSAVQLFTYESYKKLFRGKDGELSVVGRLAAGASAGMTSTFVTYPLDVLRLRMAVDPGVKKSLPEKFRNKTEASLVTAFVAATIATVTCYPLDTIR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G024800
TK1151 IDTkA05G024800
OH-1004 IDLXL04_019164
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)91.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G024800
位置Chr05:6720481-6730105 (+)
描述Similar to RUS5: Protein root UVB sensitive 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g01510 根部蛋白UVB敏感5。 暂无已核实直接文献
At5g01500 专门转运腺嘌呤核苷酸。
Identification, expression, and functional analyses of a thylakoid ATP/ADP carrier from Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m609130200
At3g51870 转运腺嘌呤核苷酸。 暂无已核实直接文献
At3g45890 参与根 UV-B 传感通路并防止对极低注量率 UV-B 过敏。
Role of root UV-B sensing in Arabidopsis early seedling development.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0809942106
ROOT UV-B SENSITIVE2 acts with ROOT UV-B SENSITIVE1 in a root ultraviolet B-sensing pathway.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.139253
ROOT ULTRAVIOLET B-SENSITIVE1/weak auxin response3 is essential for polar auxin transport in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.217018
At4g01100 线粒体腺苷酸载体，通过线粒体内膜的反交换机制特异性催化 ATP、ADP 和 AMP 的运输。
Identification and characterization of ADNT1, a novel mitochondrial adenine nucleotide transporter from Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.130310

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019164 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006839 mitochondrial transport 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0010117 photoprotection 生物过程
GO:0010206 photosystem II repair 生物过程
GO:0015866 ADP transport 生物过程
GO:0015867 ATP transport 生物过程
GO:0034599 cellular response to oxidative stress 生物过程
GO:0051503 adenine nucleotide transport 生物过程
GO:0071277 cellular response to calcium ion 生物过程
GO:1990544 mitochondrial ATP transmembrane transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G51870
ath:AT5G01500
ath:AT5G01510
mmu:229731
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.511
排名 1 · TkA05G024800 · TK1151
线粒体0.433
排名 2 · TkA05G024800 · TK1151
细胞质0.031
排名 3 · TkA05G024800 · TK1151
细胞核0.020
排名 4 · TkA05G024800 · TK1151
过氧化物酶体0.017
排名 5 · TkA05G024800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04884UVB_sens_prot62-101 aa
PF00153Mito_carr91-183 aa
PF18405SLC25_like91-153 aa
PF00153Mito_carr186-226 aa
PF18405SLC25_like191-212 aa
PF00153Mito_carr237-319 aa
PF18405SLC25_like240-344 aa
PF04884UVB_sens_prot448-668 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G024800PF04884UVB_sens_prot621011.2e-50173.2
TkA05G024800PF00153Mito_carr911831.8e-57191.8
TkA05G024800PF18405SLC25_like911530.07212.9
TkA05G024800PF00153Mito_carr1862261.8e-57191.8
TkA05G024800PF18405SLC25_like1912120.07212.9
TkA05G024800PF00153Mito_carr2373191.8e-57191.8
TkA05G024800PF18405SLC25_like2403440.07212.9
TkA05G024800PF04884UVB_sens_prot4486681.2e-50173.2
TkA05G024800PF24160UVB_sens_C6738091.1e-0733.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
B6IDH3拟南芥sp|B6IDH3|RUS5_ARATH Protein root UVB sensitive 553.600%Swiss-Prot中等置信
Q9M024拟南芥sp|Q9M024|TAAC_ARATH Thylakoid ADP,ATP carrier protein, chloroplastic73.000%Swiss-Prot高置信
O65023拟南芥sp|O65023|EAAC_ARATH Probable envelope ADP,ATP carrier protein, chloroplastic64.100%Swiss-Prot高置信
Q7X6P3拟南芥sp|Q7X6P3|RUS1_ARATH Protein root UVB sensitive 1, chloroplastic27.000%Swiss-Prot低置信
O04619拟南芥sp|O04619|ADNT1_ARATH Mitochondrial adenine nucleotide transporter ADNT132.200%Swiss-Prot中等置信

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