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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G018500
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 5095304-5098076 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1689 bp · TkA05G018500|TK1151|cDNA

ATGCTTTCTCTTGCAGTCAACAGTACTGAACGGGGGGTTTTCCTTGACCATATCCCAACCGACATATCCGTTCAGGTTGGTGAAGCAAGGTTCCCCCTTCACAAGTTCATGTTGGTAGCAAAGAGTAAGCACATACGAAATTTAGTTTTAGAATCCGGAGTACCTGACTTGGAGATGATAGATCTCTCTGATATCCCTGGAGGAGCCGAGATCTTCGAGAAAGTAGCAAGGTTGTGCTATGGTGTCGATTTTGAAATCAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1689 bp · TkA05G018500|TK1151|CDS

ATGCTTTCTCTTGCAGTCAACAGTACTGAACGGGGGGTTTTCCTTGACCATATCCCAACCGACATATCCGTTCAGGTTGGTGAAGCAAGGTTCCCCCTTCACAAGTTCATGTTGGTAGCAAAGAGTAAGCACATACGAAATTTAGTTTTAGAATCCGGAGTACCTGACTTGGAGATGATAGATCTCTCTGATATCCCTGGAGGAGCCGAGATCTTCGAGAAAGTAGCAAGGTTGTGCTATGGTGTCGATTTTGAAATCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

562 aa · TkA05G018500|TK1151|PROTEIN

MLSLAVNSTERGVFLDHIPTDISVQVGEARFPLHKFMLVAKSKHIRNLVLESGVPDLEMIDLSDIPGGAEIFEKVARLCYGVDFEITVNNVAALYCAAEYLEMTDQYSDGNLASRTFGFLADVALISLSGAITVLKSCEDLLPIAEQLNIVNQCVESASVKACEESLFPSRSPPNWWTVELSVVDITFFQKIIDSMKSRGAKALAIAGAITTYAKRSLPDLLRDYSGIKSPVSNHSSTSTIKQGKLLESIIALFPVENQQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G018500
TK1151 IDTkA05G018500
OH-1004 IDLXL04_019100
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)75.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 98.421
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G018500
位置Chr05:5095304-5098076 (+)
描述Similar to RPT2: Root phototropism protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q682S0 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器，介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。 暂无已核实直接文献
At5g67385 可能作为E3泛素蛋白连接酶复合体（CUL3-RBX1-BTB）的底物特异性衔接蛋白，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At5g48800 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At2g47860 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At1g03010 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019100 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009638 phototropism 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0009904 chloroplast accumulation movement 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03010
ath:AT2G30520
ath:AT2G47860
ath:AT5G48800
ath:AT5G67385
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.460
排名 1 · TkA05G018500 · TK1151
细胞核0.412
排名 2 · TkA05G018500 · TK1151
细胞膜0.161
排名 3 · TkA05G018500 · TK1151
内质网0.052
排名 4 · TkA05G018500 · TK1151
溶酶体／液泡0.039
排名 5 · TkA05G018500 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00651BTB18-105 aa
PF03000NPH3175-430 aa
PF17930LpxI_N182-254 aa
PF17930LpxI_N352-383 aa
PF00651BTB442-458 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G018500PF00651BTB181051.4e-0835.6
TkA05G018500PF03000NPH31754304.2e-69233.8
TkA05G018500PF17930LpxI_N1822540.1912.4
TkA05G018500PF17930LpxI_N3523830.1912.4
TkA05G018500PF00651BTB4424581.4e-0835.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q682S0拟南芥sp|Q682S0|RPT2_ARATH Root phototropism protein 256.000%Swiss-Prot高置信
Q66GP0拟南芥sp|Q66GP0|SR1P1_ARATH BTB/POZ domain-containing protein SR1IP136.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FKB6拟南芥sp|Q9FKB6|Y5880_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At5g4880035.600%Swiss-Prot中等置信
O82253拟南芥sp|O82253|SETH6_ARATH BTB/POZ domain-containing protein SETH635.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SA69拟南芥sp|Q9SA69|Y1301_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At1g0301034.200%Swiss-Prot中等置信

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