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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G015370
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 4350628-4352453 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

803 bp · TkA05G015370|TK1151|cDNA

AGTCGAAATCGAGTATTTCACGAGCCGGTTTTGAGATTCTCGAAATTGATGCAGTCGTGGGTGATTCAACAATCTTGGCCAACAGATCCGAGTATGTTGACTTTACAGCGACTTACACAGATTTGGGTGTAGGAACACTAGTAAGAAACAAGAAAAGGGACATGTGGTTCTTCTTGAAGCCGCTTGACTTGCGTCTATGGCTAACTGCTATTGCTGCTCTTATCTTTACTGCCTTAATTGTTTGGGCTATTGAATGTATG...

CDS

下载 CDS FASTA

801 bp · TkA05G015370|TK1151|CDS

TCGAAATCGAGTATTTCACGAGCCGGTTTTGAGATTCTCGAAATTGATGCAGTCGTGGGTGATTCAACAATCTTGGCCAACAGATCCGAGTATGTTGACTTTACAGCGACTTACACAGATTTGGGTGTAGGAACACTAGTAAGAAACAAGAAAAGGGACATGTGGTTCTTCTTGAAGCCGCTTGACTTGCGTCTATGGCTAACTGCTATTGCTGCTCTTATCTTTACTGCCTTAATTGTTTGGGCTATTGAATGTATGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

266 aa · TkA05G015370|TK1151|PROTEIN

SKSSISRAGFEILEIDAVVGDSTILANRSEYVDFTATYTDLGVGTLVRNKKRDMWFFLKPLDLRLWLTAIAALIFTALIVWAIECMNPDPELNQGIGTVFWLILSTIFFAQRDKLSSNLSKFVMFIWLLVVLVLLTSYTATLASLLTVEQFESASKGGIVGFHGDGDVDAIVDEIPYIKMFLSRNYGDYALLSSQPITSGFAFIFRKGSPLVEDVSREIARIRLDGTLASLENNWFNNRLSILSRNSTMPRALKLDRFGD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G015370
TK1151 IDTkA05G015370
OH-1004 IDLXL04_019060
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)95.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.120 / OH-1004 67.095
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G015370
位置Chr05:4350628-4352453 (+)
描述Similar to GLR1.4: Glutamate receptor 1.4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g48400 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g07520 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。
Arabidopsis thaliana glutamate receptor ion channel function demonstrated by ion pore transplantation.2008 · DOI: 10.1016/j.jmb.2008.06.076
At5g48410 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g04110 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。
The putative glutamate receptor 1.1 (AtGLR1.1) functions as a regulator of carbon and nitrogen metabolism in Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1073/pnas.1030961100
The putative glutamate receptor 1.1 (AtGLR1.1) in Arabidopsis thaliana regulates abscisic acid biosynthesis and signaling to control development and water loss.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch159
Arabidopsis thaliana glutamate receptor ion channel function demonstrated by ion pore transplantation.2008 · DOI: 10.1016/j.jmb.2008.06.076
At2g29120 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019060 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0006814 sodium ion transport 生物过程
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0030003 intracellular monoatomic cation homeostasis 生物过程
GO:0071230 cellular response to amino acid stimulus 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004930 G protein-coupled receptor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G04110
ath:AT3G07520
ath:AT5G11210
ath:AT5G48400
ath:AT5G48410
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.635
排名 1 · TkA05G015370 · TK1151
溶酶体／液泡0.130
排名 2 · TkA05G015370 · TK1151
内质网0.105
排名 3 · TkA05G015370 · TK1151
细胞质0.070
排名 4 · TkA05G015370 · TK1151
高尔基体0.039
排名 5 · TkA05G015370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00497SBP_bac_314-237 aa
PF10613Lig_chan-Glu_bd14-50 aa
PF00060Lig_chan63-153 aa
PF14118YfzA63-134 aa
PF26161DUF804466-82 aa
PF14296O-ag_pol_Wzy97-137 aa
PF26161DUF804497-141 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G015370PF00497SBP_bac_3142377.2e-1142.7
TkA05G015370PF10613Lig_chan-Glu_bd14500.0005420.8
TkA05G015370PF00060Lig_chan631532e-1867.3
TkA05G015370PF14118YfzA631340.6111.3
TkA05G015370PF26161DUF804466820.3811.5
TkA05G015370PF14296O-ag_pol_Wzy971370.05612.9
TkA05G015370PF26161DUF8044971410.3811.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LV72拟南芥sp|Q9LV72|GLR12_ARATH Glutamate receptor 1.238.400%Swiss-Prot中等置信
Q8LGN1拟南芥sp|Q8LGN1|GLR14_ARATH Glutamate receptor 1.437.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FH75拟南芥sp|Q9FH75|GLR13_ARATH Glutamate receptor 1.337.700%Swiss-Prot中等置信
Q9M8W7拟南芥sp|Q9M8W7|GLR11_ARATH Glutamate receptor 1.136.600%Swiss-Prot中等置信
Q8LGN0拟南芥sp|Q8LGN0|GLR27_ARATH Glutamate receptor 2.738.700%Swiss-Prot中等置信

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