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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G489140
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 123692753-123696310 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2734 bp · TkA04G489140|TK1151|cDNA

TGGTCATTCACTTGCTCGTTTAAATTTCTCGATACGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTATCTCTCTCTCTCGTACACACTCCTCTTGCCTGATTTCTCTACTTTGACGCGATTCCGAAGATCTTCAGTAGCATTGTCCAATTTCACGGCTGGCAACGTAGATTCATGGCAGAGAAAACCCCCGAATTAGAAACCCTAACTTTGAGCATGAAGCTTTTGAAACTTGATGCGGACCAAACTCTAGAAGGATCCCCAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2322 bp · TkA04G489140|TK1151|CDS

ATGGCAGAGAAAACCCCCGAATTAGAAACCCTAACTTTGAGCATGAAGCTTTTGAAACTTGATGCGGACCAAACTCTAGAAGGATCCCCAAATTGCGATTCAGAAAATGTTGTTAGCAATGGGGGCGAGAGTAACAGTGATATCCATTCCGATCAAGAGCAGCACACCCTTCCAATATTTGAAAAAATCGAAAAGTTGAGCAACAAAGTTAAGATTTTGAGAAGAGAACATATAGCATTAAGCAATGAAGTGAAAACCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

773 aa · TkA04G489140|TK1151|PROTEIN

MAEKTPELETLTLSMKLLKLDADQTLEGSPNCDSENVVSNGGESNSDIHSDQEQHTLPIFEKIEKLSNKVKILRREHIALSNEVKTITSDSLPGSEVFTALQNLGEEHETLKKKYQEECKTLKTKFHQESTERRKLYNEVIELKGNIRVFCRCRPLNQDEITKGSTSVVDFESAQENELKITASDSSKKQFKFDHIFRPEDNQEAVFSQTLPLVVSVLDGFNVCIFAYGQTGTGKTFTMEGNAENRGVNYRTLEELFKVS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G489140
TK1151 IDTkA04G489140
OH-1004 IDLXL04_038977
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.871 / OH-1004 86.952
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G489140
位置Chr04:123692753-123696310 (-)
描述Similar to KIN14S: Kinesin-like protein KIN-14S
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g27550 类动力蛋白KIN-14S。 暂无已核实直接文献
At2g22610 驱动蛋白样蛋白 KIN-14R。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0397900 类 kinesin 蛋白 KIN-14J。 暂无已核实直接文献
Os12g0616000 驱动蛋白样蛋白 KIN-14R。 暂无已核实直接文献
Os03g0114000 类驱动蛋白 KIN-14E。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038977 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007017 microtubule-based process 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0051225 spindle assembly 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005871 kinesin complex 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0015630 microtubule cytoskeleton 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G22610
ath:AT5G27550
dosa:Os03g0114000
dosa:Os05g0397900
dosa:Os12g0616000
osa:4338710
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.576
排名 1 · TkA04G489140 · TK1151
细胞核0.440
排名 2 · TkA04G489140 · TK1151
线粒体0.057
排名 3 · TkA04G489140 · TK1151
细胞膜0.050
排名 4 · TkA04G489140 · TK1151
高尔基体0.030
排名 5 · TkA04G489140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13094CENP-Q35-82 aa
PF05859Mis1249-146 aa
PF15821DUF470960-129 aa
PF28447Ccdc2760-144 aa
PF11559ADIP61-89 aa
PF24161CCDC3961-147 aa
PF08614ATG1662-142 aa
PF25450Rab11-FIP362-88 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G489140PF13094CENP-Q35822.49.0
TkA04G489140PF05859Mis12491465.07.5
TkA04G489140PF15821DUF4709601290.1713.0
TkA04G489140PF28447Ccdc27601441.88.0
TkA04G489140PF11559ADIP61890.0913.6
TkA04G489140PF24161CCDC39611470.419.2
TkA04G489140PF08614ATG16621420.7310.7
TkA04G489140PF25450Rab11-FIP362882.09.4
TkA04G489140PF23649FKBP15621442.78.2
TkA04G489140PF28016Mua621355.27.9
TkA04G489140PF07889DUF166462846.67.5
TkA04G489140PF27935CCDC61_coil631450.7911.0
TkA04G489140PF20993CENPH631337.87.3
TkA04G489140PF30378CEP135_TSGA10_CC641230.0002620.2
TkA04G489140PF30842LEKR1671458.47.4
TkA04G489140PF00038Filament851300.1612.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4K4C5拟南芥sp|F4K4C5|KN14S_ARATH Kinesin-like protein KIN-14S60.100%Swiss-Prot高置信
F4IJK6拟南芥sp|F4IJK6|KN14R_ARATH Kinesin-like protein KIN-14R53.200%Swiss-Prot中等置信
Q75HV1水稻sp|Q75HV1|KN14J_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14J50.000%Swiss-Prot高置信
Q2QM62水稻sp|Q2QM62|KN14R_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14R56.200%Swiss-Prot中等置信
B9FAF3水稻sp|B9FAF3|KN14E_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-14E57.500%Swiss-Prot中等置信

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