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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G487040
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 123054480-123059737 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2690 bp · TkA04G487040|TK1151|cDNA

ATTTAATGGCCTTCGTGGCAAGACACCACCAGTTAGTTTTCTAGAATGGAATGGAATAACAACAATATTTTTCTCAGCTTGGCAGCACTCCTCCGCACTTACCATCTTCGCCCCAAATTCAATTCAAATCTCACTTTATTCTTAAATTACTGCTTAATTCACACCTAACGCCTTCTTGGTGTTGTGTTCCTCTCCGATATCGACATCGATCTGATCTGATCTGATCTGATCGATCAACATCAAGAAAAATGGCGATGGCG...

CDS

下载 CDS FASTA

2031 bp · TkA04G487040|TK1151|CDS

ATGGCGATGGCGAGGGCAAGCTCTGGCCTCGCATACCCGGATCGTTTTTACGCCGCTGCTACTTACGCCGGCTTCGGCGGCTCTCCCACTTCATCTTCCAAAGGGGTCACATCCAAATTCTCTAATGACGTCGCTCTTTTGCTTTACGCCTTGTATCAACAGGCAACTGTTGGAGCTTGTAGCGTACCAAAACCAAGAGGTTGGAGTCCTGTGGAACAAAGCAAATGGACAAGTTGGAATGGTCTTGGAAACATGGCTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

676 aa · TkA04G487040|TK1151|PROTEIN

MAMARASSGLAYPDRFYAAATYAGFGGSPTSSSKGVTSKFSNDVALLLYALYQQATVGACSVPKPRGWSPVEQSKWTSWNGLGNMASIEAMRLFVKILEEEDPGWYSRAANFISEPVVDVEMNHNVKMELPSKNEISLPETKTIPHENGNSVEPHDKDVMVEGLSSVVVYDQWVDPPVSGQRPKPRYEHAAAVIDDKMYIFGGNHNGRYLNDLQTLDLRNWTWSKVEVKPNSEAPVTVTPCAGHSLIPWEGNKLISIAGH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G487040
TK1151 IDTkA04G487040
OH-1004 IDLXL04_038939
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G487040
位置Chr04:123054480-123059737 (+)
描述Similar to ACBP4: Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g05420 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z
Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins ACBP4 and ACBP5 are subcellularly localized to the cytosol and ACBP4 depletion affects membrane lipid composition.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9392-7
At5g27630 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0835600 以高亲和力结合中链和长链酰基辅酶 A 酯。
The rice acyl-CoA-binding protein gene family: phylogeny, expression and functional analysis.2011 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03546.x
Subcellular localization of rice acyl-CoA-binding proteins (ACBPs) indicates that OsACBP6::GFP is targeted to the peroxisomes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12809
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038939 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0000326 protein storage vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05420
ath:AT5G27630
dosa:Os03g0835600
dosa:Os03g0835800
osa:4334700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.416
排名 1 · TkA04G487040 · TK1151
细胞核0.252
排名 2 · TkA04G487040 · TK1151
高尔基体0.185
排名 3 · TkA04G487040 · TK1151
细胞膜0.140
排名 4 · TkA04G487040 · TK1151
溶酶体／液泡0.099
排名 5 · TkA04G487040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13415Beta-prop_FBX4225-55 aa
PF00887ACBP35-97 aa
PF13415Beta-prop_FBX42155-262 aa
PF01344Kelch_1164-171 aa
PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7171-261 aa
PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR1171-298 aa
PF13854Kelch_HCF172-203 aa
PF13418Beta-prop_TYW4181-369 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G487040PF13415Beta-prop_FBX4225551.1e-75254.5
TkA04G487040PF00887ACBP35971.1e-1661.5
TkA04G487040PF13415Beta-prop_FBX421552621.1e-75254.5
TkA04G487040PF01344Kelch_11641711.2e-29102.2
TkA04G487040PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC71712616.7e-79265.0
TkA04G487040PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR11712984e-45155.0
TkA04G487040PF13854Kelch_HCF1722031.3e-34120.8
TkA04G487040PF13418Beta-prop_TYW41813696.3e-1349.9
TkA04G487040PF25210Kelch_FKB951832335.2e-1246.7
TkA04G487040PF13964Beta-prop_Calicin1832449e-0625.6
TkA04G487040PF01344Kelch_11852261.2e-29102.2
TkA04G487040PF07646Kelch_21852301.8e-2381.9
TkA04G487040PF24996NANM1852296.1e-1142.5
TkA04G487040PF13415Beta-prop_FBX421863621.1e-75254.5
TkA04G487040PF25852DUF6242_C1882440.0001822.0
TkA04G487040PF13854Kelch_HCF2073621.3e-34120.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9MA55拟南芥sp|Q9MA55|ACBP4_ARATH Acyl-CoA-binding domain-containing protein 469.000%Swiss-Prot高置信
Q8RWD9拟南芥sp|Q8RWD9|ACBP5_ARATH Acyl-CoA-binding domain-containing protein 563.300%Swiss-Prot高置信
Q75LJ4水稻sp|Q75LJ4|ACBP6_ORYSJ Acyl-CoA-binding domain-containing protein 657.400%Swiss-Prot高置信

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